[發明專利]一種從魚類歷史標本中提取DNA的方法在審
| 申請號: | 201510568890.0 | 申請日: | 2015-09-09 |
| 公開(公告)號: | CN105063019A | 公開(公告)日: | 2015-11-18 |
| 發明(設計)人: | 陳善元;肖蘅;李春青 | 申請(專利權)人: | 云南大學 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 昆明科陽知識產權代理事務所 53111 | 代理人: | 董建國 |
| 地址: | 650091*** | 國省代碼: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 魚類 歷史 標本 提取 dna 方法 | ||
技術領域
本發明屬于分子生物學領域,具體涉及從魚類歷史標本中提取DNA的方法。
背景技術
我國地形地貌復雜,湖泊眾多,分布在我國的魚類資源十分豐富,但因環境變化及人為影響,很多魚類物種資源在我們人類還沒來得及認識就消失了,只剩下早期留下的浸泡標本,成為證明它們存在的唯一線索。分子生物學技術發展為探索這些魚類物種資源提供了新的途徑,獲取DNA是開展分子生物學研究的第一步,但從經過長時間浸泡的標本中提取DNA也成了研究這些魚類的首道屏障。
經過長時間浸泡后,不僅細胞結構發生了變化,細胞內的大分子物質已經降解或者正在降解,為了得到相對完整的DNA序列,人們在DNA析出和純化過程中花費了大量的精力和時間,卻忽略了材料的預處理步驟,大多只是進行簡單的清洗就進入了破碎環節。
發明內容
為解決上述問題,在對酒精浸泡的歷史標本進行DNA提取時,加入預處理環節,主要包括以下6個步驟:
(1)將組織材料放于70%的酒精中浸泡20分鐘以上;
(2)將組織材料轉于50%的酒精中浸泡15分鐘以上;
(3)將組織材料轉于30%的酒精中浸泡10分鐘以上;
(4)將組織材料轉于10%的酒精中浸泡10分鐘以上;
(5)將組織材料轉于無菌水中浸泡10分鐘以上;
(6)將組織材料轉于TE緩沖液(10mMTris-HCl和1mMEDTA,pH8.0)中浸泡10分鐘以上;
以上各步驟中,液體的體積至少是所處理材料體積的10倍以上。
進一步,步驟(1)的浸泡時間為40-60分鐘。
進一步,步驟(2)的浸泡時間為30-40分鐘。
進一步,步驟(1)的浸泡時間為40分鐘,步驟(2)的浸泡時間為40分鐘,步驟(3)-(6)的浸泡時間為10分鐘。
經研究發現,將酒精中的標本進行預處理,用酒精水溶液逐步置換出標本組織中的酒精,再將標本組織轉移至TE緩沖液中,還原至近似體液中的細胞后再進入破碎環節,能提高DNA的產量和質量。
經過上述處理后,從酒精浸泡的歷史標本中提取的DNA產量和質量都有很大的提高。
具體實施方式
下面通過實施例對本發明做進一步說明。
取酒精浸泡60年的鯉科魚類標本2克,進入下列處理程序:
(1)將組織材料放于50毫升70%的酒精中浸泡40分鐘;
(2)將組織材料轉于50毫升50%的酒精中浸泡40分鐘;
(3)將組織材料轉于50毫升30%的酒精中浸泡10分鐘;
(4)將組織材料轉于50毫升10%的酒精中浸泡10分鐘;
(5)將組織材料轉于50毫升無菌水中浸泡10分鐘;
(6)將組織材料轉于50毫升TE溶液(10mMTris-HCl和1mMEDTA,pH8.0)中浸泡10分鐘;
組織材料預處理后進入破碎和DNA提取的其它環節,最后得到了50ngDNA,平均長度達到4kb,與對照相比,產量提高了100%,長度增加了300%。
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