[發明專利]一種通用PCR引物對及其應用有效
| 申請號: | 201510542028.2 | 申請日: | 2015-08-28 |
| 公開(公告)號: | CN106701747B | 公開(公告)日: | 2019-12-13 |
| 發明(設計)人: | 張紅發;劉振民;王淵龍;游春蘋 | 申請(專利權)人: | 光明乳業股份有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/689;C12Q1/6895;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 31283 上海弼興律師事務所 | 代理人: | 朱水平;沈利 |
| 地址: | 201103 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 通用 pcr 引物 及其 應用 | ||
1.一種通用PCR引物對,其特征在于,其包括兩條寡核苷酸,其中一條的序列如序列表中SEQ ID NO.1所示,另一條的序列如序列表中SEQ ID NO.2所示,其中全簡并堿基N為選自A、G、C和T中的任一種。
2.一種PCR擴增DNA試劑盒,其特征在于,其包括如權利要求1所述通用PCR引物對。
3.如權利要求2所述PCR擴增DNA試劑盒,其特征在于,其還包括dNTP、氯化鎂溶液、PCR緩沖液和DNA聚合酶。
4.一種PCR擴增DNA的方法,其特征在于,其反應體系包括如權利要求1所述通用PCR引物對、0.2-2mmol/L dNTP、1.0-2.5mmol/L鎂離子、0.01-0.20U/μL DNA聚合酶和10-100ng/μL模板DNA,所述通用PCR引物對中的兩條引物的含量均為0.1-3μmol/L;所述PCR擴增DNA的方法包括以下步驟:
(1)90-99℃,變性3-10分鐘;
(2)90-99℃,變性10-60秒;
(3)45-60℃,退火10-60秒;
(4)65-75℃延伸1-5分鐘;
其中所述步驟(2)-(4)重復25-45個循環;
(5)65-75℃延伸3-15分鐘。
5.如權利要求4所述PCR擴增DNA的方法,其特征在于,其還包括步驟(6):將所述步驟(5)的產物4℃保存。
6.如權利要求4所述PCR擴增DNA的方法,其特征在于,其反應體系包括:1μmol/L如權利要求1所述通用PCR引物對、0.5mmol/L dNTP、1.5mmol/L鎂離子、0.05U/μL Taq DNA聚合酶和10-100ng/μL模板DNA。
7.如權利要求4所述PCR擴增DNA的方法,其特征在于,其方法包括以下步驟:
(1)95℃,變性5分鐘;
(2)95℃,變性30秒;
(3)50℃,退火30秒;
(4)72℃延伸2分鐘;
其中所述步驟(2)-(4)重復30-35個循環;
(5)72℃延伸5分鐘;
(6)將所述步驟(5)的產物4℃保存。
8.一種檢測微生物的方法,其特征在于,其包括以下步驟:
(1)提取樣品中的微生物的基因組DNA;
(2)以所述步驟(1)所述微生物的基因組DNA作為模板,用如權利要求1所述的通用PCR引物對進行PCR擴增,得PCR產物;
(3)將所述步驟(2)所述PCR產物測序,將所得到的序列進行比對分析,
其中,所述比對分析為與GenBank數據庫中的序列進行BLAST比對,分析被比對的序列與所述GenBank數據庫中的序列的同源性打分,根據所述同源性打分最高的序列確定微生物的種類。
9.如權利要求8所述方法,其特征在于,所述步驟(1)中,所述樣品中的微生物為選自細菌、霉菌和酵母中的一種或多種;所述基因組DNA為用DNA提取試劑盒進行提??;所述步驟(2)中,所述PCR擴增的體系包括以下組分:所述通用PCR引物對、0.2-2mmol/L dNTP、1.5mmol/L鎂離子、0.05U/μL DNA聚合酶和10-100ng/μL模板DNA,所述通用PCR引物對中的兩條引物的含量均為1μmol/L;所述PCR擴增的步驟包括:1)90-99℃,變性5分鐘;2)90-99℃,變性30秒;3)45-60℃,退火30秒;4)65-75℃延伸2分鐘;其中所述步驟2)-4)重復25-45個循環;5)65-75℃延伸3-15分鐘。
10.如權利要求8所述方法,其特征在于,所述步驟(3)中,所述測序為一代測序或二代測序。
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