[發明專利]大豆身份證的重要性狀SNP標記組合篩選方法與應用

有效

• 申請號: 201510526615.2
• 申請日: 2015-08-25
• 公開（公告）號: CN105039568B
• 公開（公告）日: 2018-09-07
• 發明（設計）人: 邱麗娟;魏中艷;劉章雄;關榮霞;郭勇
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院作物科學研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢;白艷

本發明公開了大豆身份證的重要性狀SNP標記組合篩選方法與應用。本發明提供了檢測14個SNP位點的物質在鑒別大豆種質中的應用。本發明提供了一套準確可靠、簡單易行的種質資源鑒別體系。且該體系的鑒別適應性廣泛，對來自于我國不同生態區的大豆種質資源進行鑒別分析，其鑒別效率均達到70％以上。這無疑對作物品種資源管理與品種保護利用及評價起到積極的作用，也為作物新品種審定及種質材料評價提供科學依據。

技術領域

本發明涉及大豆品種鑒別或育種領域，具體地，本發明涉及大豆身份證的構建及其應用，更具體地，本發明涉及利用大豆重要性狀SNP標記組合與篩選構建大豆品種身份證及其利用。

背景技術

大豆(Glycine max)是豆科(fabaceae)大豆屬(glycine)一年生草本作物。大豆起源于中國已得到國際學者普遍認可，我國大豆種質資源豐富，保存的數量居全世界之首。大豆也是我國重要的經濟作物之一，在全國都有廣泛種植，到目前為止，已育成和推廣大豆品種超過1800個。隨著大豆種質資源和品種交換的發生，種子市場中“同物異名”和“套牌”、“冒牌”現象日趨嚴重，這不僅給市場管理和消費者帶來困擾，更會給品種選育、審定以及農業生產和農民經濟利益帶來重大損失。因此，種質資源和品種身份證的構建具有重要意義。

作物品種資源種子身份證的構建已從形態標記向高通量分子鑒定技術發展。傳統的鑒定方法主要是形態標記、生理標記和生化指標，隨著品種資源數目的增加，僅僅基于這些特性已經難以對現有品種進行準確鑒定。因此急需開發一套準確可靠、簡單易行的快速鑒定體系，為作物新品種審定及種質材料評價提供科學依據。20世紀以來，DNA分析技術開始被大量的應用于植物學研究，開發出RFLP、RAPD、AFLP、SSR以及SNP、SRAP等一系列標記。分子標記不但能夠節省常規田間調查和收集整理數據的時間，而且具有不受環境影響、鑒別品種準確和變異極豐富等優點，利用分子標記構建DNA指紋圖譜進行品種真偽性已成為發展趨勢。

鑒于方法的穩定和有效性，國際植物品種權保護聯盟(UPOV)在BMT測試指南草案中已將構建DNA指紋數據庫的標記方法確定為SSR和SNP。較SSR標記相比，SNP具有針對性強，變異來源豐富，且潛在數量巨大等特點。到目前為止，SNP標記在栽培大豆中的總數達到4-5百萬個，野生大豆PAN-GENOME中存在3.63-4.72百萬個。由于SNP大多只有兩種堿基形式，被視為二等位標記，具有簡化基因分型方法及后續數字編碼的優勢。且SNP是核苷酸自身變異，不需要讀取分子量大小，采用測序方法直接獲得等位變異基因型，遺傳穩定性高，更適合于數字化建庫。利用SNP分子標記鑒定作物的指紋圖譜，對作物品種資源管理與品種保護利用及評價無疑將起到積極的作用。

發明內容

本發明的一個目的是提供檢測14個SNP位點的物質的應用。

本發明提供的檢測14個SNP位點的物質在鑒別和/或區分大豆種質中的應用；所述14個SNP位點為如下：

AR2位點為Glyma.19G194300基因的GenBank AGGession Number AB511820.1的第186位脫氧核糖核苷酸；

AR5位點為Glyma.19G194300基因的GenBank AGGession Number AB511820.1的第1289位脫氧核糖核苷酸；

AR7位點為Glyma.06G202300基因的GenBank AGGession Number EU190438.1的第5980位脫氧核糖核苷酸；

TT8位點為Glyma.06G202300基因的GenBank AGGession Number EU190438.1的第5980位脫氧核糖核苷酸；

TT11位點為Glyma.10G221500基因的GenBank AGGession Number AB797177.1的第15077位脫氧核糖核苷酸；