[發明專利]基于決策樹的作物育種評價方法有效
| 申請號: | 201510347717.8 | 申請日: | 2015-06-19 |
| 公開(公告)號: | CN104951987B | 公開(公告)日: | 2018-04-10 |
| 發明(設計)人: | 趙向宇;劉忠強;王書鋒;潘守慧;王志彬;王開義 | 申請(專利權)人: | 北京農業信息技術研究中心 |
| 主分類號: | G06Q50/02 | 分類號: | G06Q50/02 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產權代理有限公司11002 | 代理人: | 李相雨 |
| 地址: | 100097 北京市海淀區*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 決策樹 作物 育種 評價 方法 | ||
1.一種基于決策樹的作物育種評價方法,其特征在于,包括:
以育種目標為篩選條件,構建作物育種評價數據集,所述數據集共享相同的育種目標,其中,所述數據集中的每個數據均以四元數據類型{實驗材料編號,性狀特征集合T,所屬實驗e,實驗結果r}來表示;
對所述數據集中的性狀特征集合T進行預處理,得到預處理后的數據集;
根據所述預處理后的數據集,使用決策樹構建性狀特征與實驗結果間的模型,得到針對育種目標的基于決策樹的作物育種評價模型;
根據所述作物育種評價模型對具有相同育種目標的待評價作物性狀數據進行分析,并獲得評價結果;
所述根據所述預處理后的數據集,使用決策樹構建性狀特征與實驗結果間的模型,得到針對育種目標的基于決策樹的作物育種評價模型,包括:
S1、將預處理后的數據集記為D0,D0中的特征集合記為T0,根據D0與T0生成根節點root,并令所述根節點root作為當前節點;
S2、根據第三公式,計算得到D0的基尼Gini指標;
S3、判斷D0是否小于預設閾值G且T0中性狀的個數是否為0,若D0小于預設閾值且T0中性狀的個數為0,則將當前節點標記為葉子節點,取Pi中的最大值對應的實驗結果ri為該節點的實驗結果;若D0大于等于預設閾值且T0中性狀的個數不為0,則執行步驟S4-S7;
S4、計算T0中各性狀特征與實驗結果的排序相關性;
S5、取T0中與實驗結果排序相關性最大的性狀特征作為當前節點的劃分性狀Ts;
S6、根據劃分性狀Ts計算劃分閾值vs,并根據vs將D0劃分為兩個集合D1、D2;
S7、從T0中移除Ts,分別令D1、D2作為D0,重復S2至S7建立其對應的決策樹模型,并將結果分別作為當前節點的左、右子樹;
其中,所述第三公式為:
其中,a為所述實驗結果r中不同取值的個數,Pi為D0中數據對應實驗結果ri的概率。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述對所述數據集中的性狀特征集合T進行預處理,得到預處理后的數據集,包括:
對所述數據集中的性狀特征集合T中的每種性狀進行規范化處理;
對經過規范化處理之后的性狀特征集合T進行去噪處理;
對經過去噪處理之后的性狀特征集合T進行歸一化處理,得到預處理后的數據集。
3.根據權利要求2所述的方法,其特征在于,所述規范化處理包括:統一量化方式,和/或統一計量單位,和/或統一表現形式。
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