[發明專利]檢測鴨2型腺病毒的引物及試劑盒在審
| 申請號: | 201510188768.0 | 申請日: | 2015-04-20 |
| 公開(公告)號: | CN105039586A | 公開(公告)日: | 2015-11-11 |
| 發明(設計)人: | 招麗嬋;林麗苗;周慶豐;覃健萍;操勝;王占新;曾凡桂 | 申請(專利權)人: | 廣東溫氏食品集團股份有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 廣州市深研專利事務所 44229 | 代理人: | 陳雅平 |
| 地址: | 527400 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 病毒 引物 試劑盒 | ||
技術領域
本發明涉及動物病原微生物檢測技術領域,具體涉及一種檢測鴨2型腺病毒的引物及試劑盒。
背景技術
鴨2型腺病毒(DuckAdenovirus2)1977年首次在法國番鴨發現,主要引起15-35天齢番鴨發病死亡,感染鴨只表現為精神萎靡、沉郁、消瘦、軟腳、拉黃白色黏液稀糞,肝臟腫大蒼白彌漫性黃白色針尖樣壞死灶,胰腺白色壞死點,脾臟腫大充血,腎臟腫大充血成黃色條索狀,感染早期有輕度呼吸道癥狀,發病高峰期每天導致1%-1.5%的死亡率,并持續約10天時間總發病死亡率高達15-25%不等。1982年,J.F.BOUQUET首次利用水禽及鴨源細胞分離得到該病毒,當時根據其宿主范圍、臨床癥狀及血清學方法分類該病毒與目前已發現的12個血清型并不相關,推斷為新的鴨腺病毒。鴨2型腺病毒屬于I亞群腺病毒,根據限制性內切酶片段圖譜和核酸序列等分子生物學標準暫未定種,病毒核酸為雙股DNA。
鴨2型腺病毒感染近年來在廣東、浙江、福建等地番鴨、櫻桃谷鴨養殖場頻頻爆發直接導致發病死亡率高達10%-30%不等,給我國養鴨業造成較大的經濟損失。本研究者為國內首次從發病死亡番鴨中分離獲得鴨2型腺病毒,同時通過分子生物學手段獲取了該病毒部分基因組序列。因此建立一種準確、快速、靈敏的檢測方法對其進行監控,保證養鴨業健康發展十分必要。近年來,實時熒光定量PCR以其特異性強、靈敏度高,可定量,有效解決PCR污染及自動化程度高等優點,在醫學、微生物學及動植物檢驗檢疫方面得到了廣泛應用。暫未見鴨2型腺病毒的相關研究及報道。
發明內容
本發明的目的在于針對現有技術中的上述不足,提供一種檢測鴨2型腺病毒的引物;另外提供一種檢測鴨2型腺病毒的試劑盒。
本發明通過以下技術方案實現上述目的:
一種檢測鴨腺病毒2型的引物,其核苷酸序列如SEQIDNO:1~2所示。
上游引物F:TGTTCCGGAATGTAACCTGTTTAA(SEQIDNO:1);
上游引物R:CATCGCGCTCGTAGTCGT(SEQIDNO:2)。
一種檢測鴨腺病毒2型的熒光定量引物組,上述的檢測鴨腺病毒2型的引物,以及SEQIDNO:3所示的核苷酸序列構成的探針,SEQIDNO:3所示的核苷酸序列5’端標記有發光的報告熒光基團,3’端標記有不發光的淬滅基團Eclipse。
探針P:CTCCGAGAACCGAGGTGCCGC(SEQIDNO:3)。
優選地,上述檢測鴨腺病毒2型的熒光定量引物組中,所述報告熒光基團為FAM(羥基熒光素)。
一種檢測鴨腺病毒2型的熒光定量試劑盒,以上所述的檢測鴨腺病毒2型的熒光定量引物組。
優選地,上述檢測鴨腺病毒2型的熒光定量試劑盒中,還包括以下組分:PCR反應緩沖液、Mg2+、無菌雙蒸水、dNTP的混合物以及Taq酶。
優選地,上述檢測鴨腺病毒2型的熒光定量試劑盒中,還包括標準陽性對照品,為插入了鴨2型腺病毒52K基因SEQIDNO:4所示核苷酸片段的pMD18-T質粒。該pMD18-T質粒可在大腸桿菌E.coliTOP10中增殖,3.55×1010拷貝數/μL,-20℃保存。該鴨2型腺病毒52K基因SEQIDNO:4所示核苷酸片段是本研究通過設計引物特異性擴增測序獲得的。
與現有技術相比,本發明具有以下有益效果:
本發明根據對NCBI登陸的鴨2型腺病毒(GenBank登錄號為KJ469653.1)及其他I亞群禽腺病毒52K基因序列信息,經比對分析,設計特異性檢測鴨2型腺病毒的引物探針,建立了熒光定量PCR方法,提供了一種鴨2型腺病毒檢測試劑盒,可對鴨2型腺病毒感染進行快速鑒別診斷,節省了時間和成本,提高了準確性。
本發明的鴨2型腺病毒Tagman實時熒光定量PCR檢測試劑盒在鴨2型腺病毒病原檢測中重復性好,定量準確,樣品檢測僅需要2-3小時即可完成,使用試劑盒開展疫病診斷可大大縮短檢測時間,易于定量、假陽性低等特點,有利于規?;妥詣踊瘷z測分析。
附圖說明
圖1:TaqMan熒光定量PCR曲線,其中a為標準陽性模板,b為標準曲線分析質??截悢蹬cCt值的相關性,橫坐標代表質粒模板拷貝數(x),縱坐標為Ct值;
圖2:本發明引物及探針的特異性檢測實驗結果;
圖3:本發明引物及探針的靈敏度檢測實驗結果;
圖4:本發明引物及探針的重復性檢測實驗結果。
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