[發明專利]Y染色體中特異性甲基化位點作為癌癥診斷標志物的應用

有效

• 申請號: 201510027708.0
• 申請日: 2015-01-20
• 公開（公告）號: CN104593500B
• 公開（公告）日: 2017-02-22
• 發明（設計）人: 孫英麗;姚魯帥
• 申請（專利權）人: 中國科學院北京基因組研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京瑞思知識產權代理事務所(普通合伙)11341
• 代理人: 李濤

1.一種癌癥早期診斷的方法，其特征在于，利用檢測Y染色體特定甲基化位點甲基化水平的變化情況來輔助診斷癌癥的方法。

2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于：

從癌旁樣本中篩選出相對保守的甲基化位點，根據癌組織和癌旁組織進行對比，找出具有明顯差異的位點，篩選出具有明顯差異的保守性甲基化位點作為診斷標志物。

3.根據權利要求1或2所述的方法，其特征在于：

所述保守性甲基化位點為癌旁樣本間SD值小于等于0.25的點；所述明顯差異為癌組織和癌旁組織甲基化水平差值的絕對值大于等于0.2，p值小于等于0.01。

4.一種Y染色體特異性甲基化位點，其特征在于，該位點的甲基化水平的突變可以作為前列腺癌診斷的靶點；優選地，所述位點包括cg03052502、cg04462340、cg05163709、cg05544622、cg14466580和cg27539893。

5.一種Y染色體特異性甲基化位點的篩選方法，所述方法包括：a)獲取患者樣本，b)從a)步驟獲得的樣本提取DNA，c)確定樣本的全基因組甲基化水平，d)分析Y染色體甲基化信息，e)篩選甲基化保守位點，f)篩選具有明顯差異的甲基化位點，g)篩選具有明顯差異的甲基化保守位點。

6.根據權利要求5所述的方法，其中所述樣本為癌組織和癌旁組織，所述癌組織優選為前列腺癌組織。

7.根據權利要求5或6所述的方法，其中所述甲基化保守位點為在癌旁組織中樣本間標準方差SD值小于等于0.25的點，所述明顯差異為甲基化水平變化在0.2及以上，且p值和q值均小于等于0.01；可選地，所述變化為升高或降低。

8.一種癌癥診斷標志物，所述標志物由Y染色體中特異性甲基化位點組成，所述位點通過權利要求5－7任一項的方法篩選得到。

9.權利要求8的癌癥診斷標志物，其中所述癌癥診斷標志物包括cg03052502、cg04462340、cg05163709、cg05544622、cg14466580和cg27539893。

10.一種癌癥診斷標志物在制備癌癥早期診斷或預測癌癥發生風險的試劑中的用途或是一種早期診斷癌癥的試劑盒，優選地，所述癌癥為前列腺癌。