[發明專利]用于鑒定多個生物樣本之間身份關系的方法和系統

有效

• 申請號: 201480081788.1
• 申請日: 2014-12-31
• 公開（公告）號: CN106715712B
• 公開（公告）日: 2021-02-19
• 發明（設計）人: 蘆靜;蔣浩君;陳芳;崔路漫;康雄斌;蔣慧
• 申請（專利權）人: 深圳華大基因科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6869
• 分類號: C12Q1/6869;C12Q1/6888;C12N15/11;C12M1/34;C12M1/00
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 趙天月

1.一種用于鑒定多個生物樣本之間身份關系的方法，其特征在于，包括：

(1)對來自所述多個生物樣本的基因組DNA的至少一部分進行測序，以便獲得所述多個生物樣本的核酸測序結果；

(2)基于所述核酸測序結果，針對所述多個生物樣本中的每一個，確定預定SNP位點集合中每一個SNP位點的基因型；

(3)基于所述SNP位點的基因型，確定所述多個生物樣本之間的身份關系；

所述預定SNP位點集合包含如下SNP位點：

rs11239930、rs10801520、rs3899750、rs11714239、rs1397228、rs472728、rs7429010、rs4478233、rs2172651、rs325238、rs7715674、rs1337823、rs574202、rs7741536、rs4719491、rs13438255、rs7834428、rs6994603、rs10124916、rs4606122、rs7035090、rs2038597、rs1484443、rs518357、rs895648、rs1939904、rs991718、rs7306163、rs10860402、rs11146962、rs1147437、rs4789817、rs8083190、rs2829066、rs2076039。

2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，預定SNP位點集合中的每一個SNP位點至少滿足下列條件之一：

MAF0.4的位點；

無連鎖不平衡；

SNP位點之間符合Hardy–Weinberg平衡。

3.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述基因組DNA的至少一部分包含所述預定SNP位點集合中的所有SNP位點。

4.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，在進行所述測序之前，預先利用引物對所述生物樣本的基因組DNA進行擴增，所述引物特異性識別所述SNP位點集合中的每一個SNP位點。

5.根據權利要求1-4任一項所述的方法，其特征在于，所述預定SNP位點集合包含如下SNP位點：

rs11239930、rs10801520、rs3899750、rs11714239、rs1397228、rs472728、rs7429010、rs4478233、rs2172651、rs325238、rs7715674、rs1337823、rs574202、rs7741536、rs4719491、rs13438255、rs7834428、rs6994603、rs10124916、rs4606122、rs7035090、rs2038597、rs1484443、rs518357、rs895648、rs1939904、rs991718、rs7306163、rs10860402、rs11146962、rs1147437、rs4789817、rs8083190、rs2829066、rs2076039、rs4076086、rs1106201、rs3756050、rs11123823、rs2274212、rs3829868、rs2276967、rs9821880、rs1049500、rs3811474、rs2292564、rs2013162、rs1997660、rs14134、rs26821、rs7690296、rs5745448、rs1343469、rs1699798、rs1698647、rs2293195、rs3805392、rs227368、rs6909306、rs62431284、rs562381、rs10734685、rs929310、rs1355634、rs2356027、rs1657741、rs8076154、rs2235907、rs228104、rs5749426。

6.根據權利要求1-4任一項所述的方法，其特征在于，所述引物的核酸序列如SEQ IDNO：3-142所示。