[發明專利]抗體選擇裝置和方法

有效

• 申請號: 201480064869.0
• 申請日: 2014-11-26
• 公開（公告）號: CN105793850B
• 公開（公告）日: 2020-04-24
• 發明（設計）人: V·K·夏爾馬;T·E·斯沃茨;T·W·帕塔普夫
• 申請（專利權）人: 豪夫邁·羅氏有限公司
• 主分類號: G16H70/40
• 分類號: G16H70/40;C07K16/00
• 代理公司: 北京市中咨律師事務所 11247
• 代理人: 胡志君;黃革生

1.確定抗體納入藥物組合物中的適宜性的方法，其中所述方法是跨網絡實施的；和/或使用計算設備，所述方法包括：

(a)設定抗體的粘度限值；

(b)從抗體結構信息的一級結構信息計算凈電荷和電荷不對稱性，其中所述一級結構包含輕鏈可變結構域VL氨基酸序列和重鏈可變結構域VH氨基酸序列；

(c)獲得對應于凈電荷的第一換算系數和對應于電荷不對稱性的第二換算系數；

(d)從包含所述換算系數、凈電荷和電荷不對稱性的目標函數計算指標，所述指標代表粘度；和

(e)當所述指標不超過粘度限值，則確定抗體的適宜性。

2.根據權利要求1所述的方法，其中所述凈電荷是VL氨基酸序列凈電荷和VH氨基酸序列凈電荷的總和。

3.根據權利要求1所述的方法，其中所述電荷不對稱性包含VL氨基酸序列凈電荷和VH氨基酸序列凈電荷的算術乘積。

4.根據權利要求1所述的方法，其中獲得所述換算系數包括：從至少一種檢驗抗體的至少一個粘度測量的數據確定換算系數，其中抗體和檢驗抗體為相同抗體類別。

5.根據權利要求4所述的方法，其中獲得所述換算系數還包括：從所述至少一種檢驗抗體的多個粘度測量的數據確定換算系數，其中每一粘度測量是在不同溶液條件下實施的。

6.根據權利要求1所述的方法，其中在目標函數中，指標的log10包含(凈電荷X第一換算系數)加(電荷不對稱性X第二換算系數)的總和。

7.根據權利要求1至6中任一項所述的方法，所述方法還包括以下步驟：

(a’)從結構信息、從抗體的一個或多個互補決定區CDR的信息，計算疏水性；和

(b’)選擇對應于疏水性的第三換算系數，其中目標函數還包含第三換算系數。

8.根據權利要求7所述的方法，其中疏水性包含一個或多個CDR的疏水性值的求和函數的總計。

9.根據權利要求8所述的方法，其中每個求和函數是CDR疏水性殘基各值的總和與CDR親水性殘基各值的總和的比率。

10.根據權利要求8所述的方法，其中值是艾森伯格疏水性標度值。

11.根據權利要求8所述的方法，其中一個或多個CDR包含一、二、三、四、五或六個CDR。

12.根據權利要求7所述的方法，其中在目標函數中，指標的log10包含(凈電荷X第一換算系數)加(電荷不對稱性X第二換算系數)加(疏水性X第三換算系數)的總和。

13.生產抗體的方法，所述方法包括：

(a)設定抗體的粘度限值；

(b)從抗體結構信息的一級結構信息計算凈電荷和電荷不對稱性，其中所述一級結構包含輕鏈可變結構域VL氨基酸序列和重鏈可變結構域VH氨基酸序列；

(c)獲得對應于凈電荷的第一換算系數和對應于電荷不對稱性的第二換算系數；

(d)從包含所述換算系數、凈電荷和電荷不對稱性的目標函數計算指標，所述指標代表粘度；和

(e)當所述指標超過粘度限值，則誘變抗體輕鏈和重鏈的可變區氨基酸序列至少之一中的一個或多個氨基酸殘基，以產生目標抗體；和

(f)生產所述目標抗體。

14.根據權利要求13所述的方法，其中誘變輕鏈和重鏈的可變區氨基酸序列至少之一中的一個或多個氨基酸殘基來減少疏水性、增加凈電荷和減少電荷不對稱性中的至少之一，從而與目標抗體的粘度相對應的指標不超過粘度限值。

15.根據權利要求13或14所述的方法，還包括：基于制造容器中流體傳導元件的流體流阻設定抗體的粘度限值，所述流體流阻取決于流經所述元件的流體的粘度。