[發(fā)明專利]組織切片圖像的配準(zhǔn)的方法、計算機(jī)可讀介質(zhì)和圖像處理設(shè)備

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201480059940.6
• 申請日: 2014-10-30
• 公開（公告）號: CN105659288B
• 公開（公告）日: 2020-08-07
• 發(fā)明（設(shè)計）人: J.P.溫克;M.B.范里尤文
• 申請（專利權(quán)）人: 皇家飛利浦有限公司
• 主分類號: G06T7/30
• 分類號: G06T7/30
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 孫之剛;景軍平

一種用于配準(zhǔn)組織切片的圖像的方法包括：接收第一組織切片（14a）的第一圖像（18a）和第二組織切片（14b）的第二圖像（18b），兩個組織切片從相同組織塊（10）準(zhǔn)備；確定示出折疊組織（15）的第一圖像（14a）中的不可靠區(qū)域（27）；以及通過配準(zhǔn)不可靠區(qū)域外部的第一圖像和第二圖像的區(qū)域來配準(zhǔn)第一圖像（14a）和第二圖像。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及用于組織切片的圖像的配準(zhǔn)的方法、計算機(jī)程序、計算機(jī)可讀介質(zhì)和設(shè)備。

背景技術(shù)

患者材料（組織和細(xì)胞）的病理學(xué)診斷調(diào)查是許多治療決定的基礎(chǔ)，特別是在腫瘤學(xué)中。通常，來自活組織檢查的薄切片被呈現(xiàn)在顯微鏡載玻片上并且根據(jù)某些協(xié)議染色。特定染色劑用于對腫瘤的可能存在類型進(jìn)行評分和分級。由于應(yīng)用于單個載玻片的染色劑數(shù)目由于視覺光譜中的疊加頻率而相當(dāng)有限（特別地在亮場顯微鏡中），因此使用連續(xù)切片，每一個被不同地染色。在傳統(tǒng)病理學(xué)中，僅在比喻的意義上將一個載玻片的信息傳送至下一個載玻片。多個載玻片之間的快速交替是不可能的，因為其要求切換物理載玻片并且找到感興趣的區(qū)。因此，多個載玻片的配準(zhǔn)必須由操作者（例如病理學(xué)家）在其頭腦中完成。

隨著數(shù)字掃描儀的引入，圖像分析工具可以幫助病理學(xué)家配準(zhǔn)（連續(xù)）載玻片。然而，作為全局配準(zhǔn)的一般配準(zhǔn)技術(shù)可能由于組織中的不同、組織的變形、組織的拉伸等而不工作。諸如局部配準(zhǔn)之類的更高級的配準(zhǔn)技術(shù)不要求單個（全局）變換矩陣并且準(zhǔn)許局部適配。

發(fā)明內(nèi)容

另外，配準(zhǔn)步驟可能需要對于人為產(chǎn)物是魯棒的。通常，人為產(chǎn)物（例如染色或成像人為產(chǎn)物）看起來是局部的，使得這些區(qū)域例如被省略并且組織幻燈片的圖像的其余部分用于配準(zhǔn)。然而，該方案在折疊組織的情況中可能不適用。折疊組織不僅影響其中折疊組織可見的局部（空間）區(qū)域，而且還導(dǎo)致其它地方的組織的缺失并且潛在地導(dǎo)致組織的一些局部拉伸和變形。

可能存在對于用于關(guān)于彼此配準(zhǔn)組織切片圖像的配準(zhǔn)方法的需要，其將局部人工產(chǎn)物考慮在內(nèi)。

這樣的需要可以通過獨(dú)立權(quán)利要求的主題來滿足。本發(fā)明的另外的實施例從從屬權(quán)利要求和隨附描述顯現(xiàn)。

本發(fā)明的一方面涉及一種用于配準(zhǔn)用于病理學(xué)診斷調(diào)查的組織切片的圖像的方法。例如，組織切片已經(jīng)從一個組織塊準(zhǔn)備好。另外，組織切片可以已經(jīng)被不同地染色。必須要理解的是，術(shù)語“配準(zhǔn)”可以意味著兩個圖像（示出類似或相同的內(nèi)容）全局移動（旋轉(zhuǎn)、縮放和/或移動）和/或局部變形，使得它們的內(nèi)容盡可能好地疊加。

根據(jù)本發(fā)明的實施例，方法包括以下步驟：接收第一組織切片的第一圖像和第二組織切片的第二圖像，兩個組織切片從相同的組織塊準(zhǔn)備；確定示出折疊組織的第一圖像中的不可靠區(qū)域；以及通過配準(zhǔn)不可靠區(qū)域外部的第一圖像和第二圖像的區(qū)域來配準(zhǔn)第一圖像和第二圖像以找到感興趣的區(qū)。

必須要理解的是，折疊可以出現(xiàn)在兩個圖像中。在該情況中，不可靠區(qū)域可以在第一圖像和第二圖像中確定并且兩個圖像的配準(zhǔn)可以基于配準(zhǔn)不可靠區(qū)域外部的第一圖像和第二圖像的區(qū)域。

例如，可選地不同染色的組織切片（其可以是來自組織塊的連續(xù)切片）的兩個圖像通過將具有折疊組織的區(qū)/區(qū)域考慮在內(nèi)來局部配準(zhǔn)。這些區(qū)例如可以通過尋找可能具有閾值以下的像素強(qiáng)度的非常暗的區(qū)域（例如具有低像素強(qiáng)度的區(qū)域）來確定?？梢源鎯υ谘谀D像中的這樣的不可靠區(qū)域或排除區(qū)域的內(nèi)容可以在兩個圖像的局部配準(zhǔn)期間被忽略，這可以增強(qiáng)圖像的其余部分的配準(zhǔn)。必須要理解的是，不可靠區(qū)域可以包含兩個圖像（即第一和第二圖像）中的具有折疊組織的區(qū)域。

方法提供魯棒的配準(zhǔn)，其將組織折疊考慮在內(nèi)?？梢詼p少其中組織折疊的圖像的未對準(zhǔn)區(qū)域。