[發明專利]用于預測大腸癌發病危險度的基因標志物及其應用

有效

• 申請號: 201480057145.3
• 申請日: 2014-11-27
• 公開（公告）號: CN105683396B
• 公開（公告）日: 2019-07-09
• 發明（設計）人: 金成珠;池善河;樸鐘根;鄭錦枝
• 申請（專利權）人: 加圖立大學校產學協力團;延世大學校產學協力團
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 北京市中倫律師事務所 11410
• 代理人: 石寶忠

本發明涉及一種通過識別與大腸癌發病危險度具有顯著相關關系的特定的單核苷酸多態性(SNP：single nucleotide polymorphism)堿基來預測大腸癌發病危險度的方法、包含有能夠確認上述SNP的多核苷酸、多肽、抗體或cDNA的大腸癌發病危險度預測用組合物和包含該組合物的微陣列及試劑盒。

技術領域

本發明涉及一種通過確認與大腸癌發病危險度具有顯著的相關關系的特定的單核苷酸多態性(SNP：single nucleotide polymorphism)堿基來預測大腸癌發病危險度的方法、包含有能夠確認上述SNP的多核苷酸、多肽、抗體或互補脫氧核糖核酸(cDNA)的大腸癌發病危險度預測用組合物和包含該組合物的微陣列以及試劑盒。

背景技術

大腸的結構是指從小腸末端起至肛門的臟器，其長度約為1.5米左右。大腸由上行、橫行、下行和S狀結腸、直腸及肛門構成，大腸的主要功能是指通過從小腸接收消化后的殘留食物而吸收水分和電解質并將剩余殘渣排出的功能。

大腸癌為在上行結腸、橫行結腸、下行結腸、S狀結腸和直腸粘膜中發生的惡性腫瘤，其包含有腺癌、淋巴癌、肉瘤、扁平上皮癌等，其中腺癌(adenocarcinoma)的發生所占比重較高。據悉，在韓國，分部位的大腸癌發生頻率中，上行結腸和S狀結腸各占25％，直腸占20％。

查看大韓民國的大腸癌，在70年代之前屬于不易發生的疾病，但隨著飲食生活的西方化，目前呈現逐漸增加的趨勢。根據統計局的死亡原因統計(國家核準統計第10154號)和保健福祉部的癌癥登記統計(國家核準統計第11744號)，從2000年至2010年的10年之間，大腸癌的發病率從10萬人中21.8人上升至41.5人，死亡率從10萬人中8.8人上升至15.4人，幾乎增加了2倍，并且呈現繼續增加的趨勢。

并且，當縱觀與大韓民國相鄰的亞洲國家中的中國和日本時，引用中國媒體的美國自由亞洲電臺(RFA)的報道中稱，根據中國腫瘤登記中心發刊的＜2013中國腫瘤年度報告＞，癌癥死亡者人數達到年內270萬人，年平均有312萬人得到了癌癥確診判定，呈現每年增加的趨勢。并且，報告稱大腸癌之一的直腸癌的發病率在所有癌癥中占據第三位(第一位：肺癌，第二位：胃癌，第三位：直腸癌)。至于日本，根據2006年日本癌癥發病率監測(MCIJ：Monitoring of Cancer Incidence in Japan)的統計資料，報告稱對于男性(胃癌：55.3人/10萬人、大腸癌：45.1人/10萬人、肺癌：41.6人/10萬人)和女性(乳腺癌：52人/10萬人，大腸癌：25.6人/10萬人，胃癌：20.3人/10萬人)而言，大腸癌的發病率在所有癌癥中分別占據第二位(International Jounal of Cencer(國際癌癥雜志),2014,134,747-754)。

目前，對于大腸癌來說，與其它消化系統癌癥相同，外科手術是最為有效的治療方法，從一期初期階段至三期具有70％～90％的生存率，最后階段四期中具有15％的生存率。

大腸癌的主要危險因素大致可分為兩種。第一種為環境因素，高齡、過度攝取肉類、纖維質攝取不足、維生素攝取不足、鈣攝取不足、飲酒、吸煙等被認為是其原因。第二種為遺傳因素，被認為在癌細胞發展到轉移的各階段中有APC、KRAS、P53、MLH1、MSH2、INK4A及SMAD4等各種基因參與。

另一方面，在人類的情況下，以約每1000堿基中一次的頻率發生變異，這被稱之為單核苷酸多態性(SNP：single nucleotide polymorphism)，5％多態性稱之為常見多態(common polymorphism)，1～5％多態性稱之為罕見多態(rare polymorphism)。目前，為了分析人類所有堿基序列，諸多實驗方法等得到了發展，其中，目前為止全基因組關聯研究(Genome-wide association study：GWAS)被用于很多疾病的研究中。