[發明專利]使用靶基因表達的數學建模評價PI3K細胞信號傳導途徑活性

在審

• 申請號: 201480048682.1
• 申請日: 2014-12-30
• 公開（公告）號: CN105492630A
• 公開（公告）日: 2016-04-13
• 發明（設計）人: H.J.范奧詹;W.F.J.維哈伊格;A.范德斯托佩
• 申請（專利權）人: 皇家飛利浦有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;G06F19/10
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 梁謀;景軍平

1.一種方法，其包括：

至少基于醫學主體的組織和/或細胞和/或體液的提取樣品中測量的PI3K細胞信號傳 導途徑的一種或多種靶基因的表達水平推斷所述醫學主體的組織和/或細胞和/或體液中 的PI3K細胞信號傳導途徑的活性，其中所述推斷包括：

測定所述醫學主體的組織和/或細胞和/或體液的提取樣品中的FOXO轉錄因子（TF）元 件的水平，所述FOXOTF元件控制PI3K細胞信號傳導途徑的一種或多種靶基因的轉錄，所述 測定至少部分基于評估將PI3K細胞信號傳導途徑的一種或多種靶基因的表達水平與FOXO TF元件的水平關聯的數學模型；

基于所述醫學主體的組織和/或細胞和/或體液的提取樣品中的FOXOTF元件的測定水 平推斷所述醫學主體的組織和/或細胞和/或體液中的PI3K細胞信號傳導途徑的活性，

其中所述推斷通過使用所述數學模型的數字處理設備來執行。

2.權利要求1的方法，其中所述推斷包括：

至少基于所述醫學主體的組織和/或細胞和/或體液的提取樣品中測量的PI3K細胞信 號傳導途徑的一種或多種、優選至少三種靶基因的表達水平推斷所述醫學主體的組織和/ 或細胞和/或體液中的PI3K細胞信號傳導途徑的活性，所述靶基因選自：AGRP、BCL2L11、 BCL6、BNIP3、BTG1、CAT、CAV1、CCND1、CCND2、CCNG2、CDKN1A、CDKN1B、ESR1、FASLG、FBXO32、 GADD45A、INSR、MXI1、NOS3、PCK1、POMC、PPARGC1A、PRDX3、RBL2、SOD2和TNFSF10。

3.權利要求2的方法，其中所述推斷還基于醫學主體的組織和/或細胞和/或體液的提 取樣品中測量的PI3K細胞信號傳導途徑的至少一種靶基因的表達水平，所述靶基因選自： ATP8A1、C10orf10、CBLB、DDB1、DYRK2、ERBB3、EREG、EXT1、FGFR2、IGF1R、IGFBP1、IGFBP3、 LGMN、PPM1D、SEMA3C、SEPP1、SESN1、SLC5A3、SMAD4和TLE4。

4.權利要求2的方法，其中所述推斷還基于醫學主體的組織和/或細胞和/或體液的提 取樣品中測量的PI3K細胞信號傳導途徑的至少一種靶基因的表達水平，所述靶基因選自： ATG14、BIRC5、IGFBP1、KLF2、KLF4、MYOD1、PDK4、RAG1、RAG2、SESN1、SIRT1、STK11和TXNIP。

5.權利要求1的方法，其還包括：

基于所述醫學主體的組織和/或細胞和/或體液中的PI3K細胞信號傳導途徑的推斷活 性確定PI3K細胞信號傳導途徑在所述醫學主體的組織和/或細胞和/或體液中是否異常運 行。

6.權利要求5的方法，其還包括：

為所述醫學主體推薦開藥，所述藥物校正PI3K細胞信號傳導途徑的異常運行；

其中只有當基于PI3K細胞信號傳導途徑的推斷活性確定PI3K細胞信號傳導途徑在所 述醫學主體的組織和/或細胞和/或體液中異常運行時才進行所述推薦。