[發明專利]用于核酸特異性雜化合物的模板化裝配的方法和組合物

在審

• 申請號: 201480038772.2
• 申請日: 2014-06-04
• 公開（公告）號: CN105358691A
• 公開（公告）日: 2016-02-24
• 發明（設計）人: 伊恩·鄧恩;馬修·勞勒
• 申請（專利權）人: 特里比奧迪卡有限責任公司
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11
• 代理公司: 北京德恒律治知識產權代理有限公司 11409
• 代理人: 章社杲;李偉

1.一種靶向模板化裝配反應物，其包含：

a)結合靶核酸序列的至少一個核酸識別部分；

b)至少一個效應物局部部分；和

c)至少一個選擇性反應性部分；其中所述反應物能夠結合相應的模板化裝配反應物而產生活性效應物結構。

2.根據權利要求1所述的反應物，其中所述核酸識別部分是核酸結合寡聚物。

3.根據權利要求1所述的反應物，其中所述核酸識別部分是與所述靶核酸序列雜交的核酸寡聚物。

4.根據權利要求1所述的反應物，其中所述選擇性反應性部分是生物惰性的。

5.根據權利要求1所述的反應物，其中所述選擇性反應性部分連接至所述核酸識別部分。

6.根據權利要求1所述的反應物，其中所述選擇性反應性部分是生物正交反應性分子。

7.根據權利要求1所述的反應物，其中所述活性效應物結構調節酶活性、基因/蛋白質表達、分子信號傳導和分子相互作用中的至少一個。

8.根據權利要求1所述的反應物，其中所述活性效應物結構相較于所述效應物局部部分的活性具有靶向活性。

9.根據權利要求1所述的反應物，其進一步包含化學連接子，所述化學連接子位于所述核酸識別部分與所述選擇性反應性部分以及所述選擇性反應性部分與所述效應物局部部分中的任一者之間。

10.根據權利要求9所述的反應物，其中所述化學連接子改善所述靶向模板化裝配反應物的溶解度、疏水性、電荷、細胞滲透性、毒性、生物分布和穩定性中的至少一個。

11.根據權利要求9所述的反應物，其中所述化學連接子為柔性部分、裂解位點和化學修飾位點中的至少一個。

12.根據權利要求1所述的反應物，其中所述靶核酸序列選自癌癥特異性核酸序列、病毒核酸序列、微生物特異性核酸序列、差異表達基因、疾病特異性核酸序列和其片段、部分或核酸基因產物。

13.一種靶向模板化裝配反應物，其包含：

a)至少一個核酸識別部分；

b)至少一個生物正交部分；和

c)至少一個效應物局部部分。

14.根據權利要求13所述的反應物，其中所述核酸識別部分為選自由以下組成的組的寡聚物：DNA核苷酸、RNA核苷酸、經硫代磷酸酯修飾的核苷酸、2-O-烷基化RNA核苷酸、鹵代核苷酸、鎖核酸核苷酸(LNA)、肽核酸(PNA)、嗎啉代核酸類似物、假尿苷核苷酸、黃嘌呤核苷酸、次黃嘌呤核苷酸、2-脫氧肌苷核苷酸、能夠形成堿基對的其它核酸類似物和其組合。

15.根據權利要求13所述的反應物，其中所述核酸識別部分結合選自由以下所組成的組的靶核酸序列：致癌基因、突變基因、致癌病毒基因、病毒核酸序列、微生物核酸序列、差異表達基因及其片段、部分或核酸基因產物。

16.根據權利要求13所述的反應物，其中所述生物正交部分選自由以下所組成的組：疊氮化物、環辛炔、硝酮、降冰片烯、氧雜降冰片二烯、膦、二烷基膦、三烷基膦、膦基硫醇、膦基苯酚、環辛烯、氧化腈、硫酯、四嗪、異腈、四唑、四環烷和其衍生物。

17.根據權利要求13所述的反應物，其中所述效應物局部部分選自由以下所組成的組：肽、擬肽結構的非活性部分、藥物的非活性部分和其它生物活性化合物。

18.根據權利要求13所述的反應物，其中所述效應物局部部分小于20kDa。

19.根據權利要求13所述的反應物，其中所述核酸識別部分、所述生物正交部分和所述效應物局部部分中的一個或多個被化學連接子官能化。

20.根據權利要求13所述的反應物，其進一步包含化學連接子，所述化學連接子位于所述核酸識別部分與所述生物正交部分以及所述生物正交部分與所述效應物局部部分中的任一者之間。

21.根據權利要求20所述的反應物，其中所述化學連接子選自由以下所組成的組：烷基、烯基、酰胺、酯、硫酯、酮、醚、硫醚、二硫化物、乙二醇、環烷基、芐基、雜環基、馬來酰亞胺基、腙、尿烷、唑類、亞胺、鹵代烷基、氨基甲酸酯和其組合。