[發明專利]具有光致交聯能力的光響應性核苷酸類似物

有效

• 申請號: 201480030704.1
• 申請日: 2014-03-27
• 公開（公告）號: CN105579437B
• 公開（公告）日: 2019-03-08
• 發明（設計）人: 藤本健造;坂本隆;田中佑彌
• 申請（專利權）人: 國立研究開發法人科學技術振興機構
• 主分類號: C07D209/86
• 分類號: C07D209/86;C07H19/06;C08F230/02
• 代理公司: 北京林達劉知識產權代理事務所(普通合伙) 11277
• 代理人: 劉新宇;李茂家

提供能夠用于核酸的光反應技術的新的光反應性化合物和使用該光反應性化合物的光反應性交聯劑。可以使用式I所示的光反應性的化合物。

技術領域

本發明涉及：具有能夠與核酸類交聯的光反應性的核酸堿基類似結構和脫氧核糖替代結構的光反應性交聯劑、以及具備該核酸堿基類似結構作為堿基部分且具備該脫氧核糖替代結構作為脫氧核糖部分的、具有光致交聯(光交聯)能力的光響應性核苷酸類似化合物(光響應性核苷酸類似物)。

背景技術

分子生物學領域的基本技術包括核酸的連接和核酸的交聯。核酸的連接、交聯例如與雜交法組合而用于基因的導入、堿基序列的檢測或用于例如基因表達的抑制。因此，核酸的連接和交聯的技術不僅是用于分子生物學的基礎研究的極重要的技術，而且也是用于例如：醫療領域中的診斷、治療或治療藥、診斷藥等的開發、制造；工業和農業領域中的酶、微生物等的開發、制造的極重要的技術。

作為這樣的核酸的連接或交聯的技術，不使用酶類且利用光反應的技術由于能夠自由控制反應的時間、空間，能夠在比通常的有機化學反應緩和的條件下反應等優點而開始受到關注。

作為這樣的核酸的光反應技術，有：使用5-氰基乙烯基脫氧尿苷的光連接技術(專利文獻1：日本專利第3753938號、專利文獻2：日本專利第3753942號)、使用在堿基部位具有3-乙烯基咔唑結構的修飾核苷的光交聯技術(專利文獻3：日本專利第4814904號、專利文獻4：日本專利第4940311號)。

現有技術文獻

專利文獻

專利文獻1：日本國專利第3753938號公報

專利文獻2：日本國專利第3753942號公報

專利文獻3：日本國專利第4814904號公報

專利文獻4：日本國專利第4940311號公報

發明內容

發明要解決的問題

從核酸的光反應技術的重要性出發，進一步要求能夠用于核酸的光反應技術的新的化合物。本發明的目的在于，提供能夠用于核酸的光反應技術的新的光反應性化合物、和使用了該光反應性化合物的光反應性交聯劑。

用于解決問題的方案

本發明人對作為核酸的光反應技術中能夠使用的光反應性交聯劑的光反應性化合物進行了深入探索，結果發現：具有乙烯基咔唑骨架結構代替核酸堿基的堿基部分且具有后述的式I所示的骨架結構代替核糖和脫氧核糖部分的化合物成為這樣的核酸的光反應技術中能夠使用的光反應性交聯劑，從而實現了本發明。

本發明的化合物具有后述的式I所示的骨架結構，而不具有由天然的核苷和核苷酸所應當具有的核糖或脫氧核糖所形成的糖結構。進而，本發明的化合物不具有天然的核苷和核苷酸所應當具有的嘌呤堿基或嘧啶堿基所形成的堿基結構。即，本發明的化合物成為被認為與天然的核苷和核苷酸在結構上完全不類似的化學結構。盡管如此，本發明的化合物形成單鏈的核酸時，該單鏈核酸和與其互補的單鏈的核酸形成雙螺旋，乙烯基咔唑部分通過光反應形成交聯時，從雙螺旋的一條鏈至另一條鏈形成光交聯(光致交聯)，因此，本發明的光反應性的化合物可以作為能夠與期望的序列發生特異性反應的雙螺旋的光致交聯劑(光交聯劑)而使用。

因此，本發明在于如下(1)～(10)。

(1)

一種光反應性的化合物，其如下式I所示：

(其中，式I中，

Ra表示氰基、酰胺基、羧基、C2～C7的烷氧基羰基、膦?；?、磺基或氫原子，