[發明專利]一種生物標志物相關性可視化方法以及裝置

有效

• 申請號: 201410853550.8
• 申請日: 2014-12-30
• 公開（公告）號: CN104573411B
• 公開（公告）日: 2018-04-17
• 發明（設計）人: 周豐豐;孟慶漢
• 申請（專利權）人: 深圳先進技術研究院
• 主分類號: G06F19/26
• 分類號: G06F19/26
• 代理公司: 廣州三環專利商標代理有限公司44202
• 代理人: 郝傳鑫,熊永強

1.一種生物標志物相關性可視化方法，其特征在于，包括：

根據第i個標志物的多個采樣樣本計算所述第i個標志物的費舍爾比率，其中，i為正整數，i小于或等于M，M為所述標志物的數量，N為所述采樣樣本的數量；

重復上一個步驟，直到求出每個的標志物的費舍爾比率；

根據第a個標志物的多個采樣樣本和第b個標志物的多個采樣樣本計算出第a個標志物和第b個標志物之間的距離，其中，a，b均為正整數，a，b均小于或等于M；

重復上一個步驟，直到求出任意兩個標志物之間的距離；

將所有的兩個標志物之間的距離和降維后的維度作為多維標度算法的輸入，從而獲得每個標志物的坐標值；

根據每個標志物的費舍爾比率獲得每個標志物在散點圖上的大小，并根據每個標志物的坐標值獲得每個標志物在散點圖上的坐標，進而使得所述標志物相關性可視化。

2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，根據第i個標志物的多個采樣樣本計算所述第i個標志物的費舍爾比率之前包括：

根據所述第i個標志物的多個采樣樣本進行歸一化計算，以得到多個歸一化后的采樣樣本；

根據第i個標志物的多個采樣樣本計算所述第i個標志物的費舍爾比率具體為：

根據第i個標志物的多個歸一化后的采樣樣本計算所述第i個標志物的費舍爾比率。

3.根據權利要求2所述的方法，其特征在于，根據所述第i個標志物的多個采樣樣本進行歸一化計算，以得到多個歸一化后的采樣樣本具體為：

根據進行歸一化計算，以得到多個歸一化后的采樣樣本，其中，X_i為所述第i個標志物的多個采樣樣本所組成的向量，u_i為所述第i個標志物的多個采樣樣本的平均值，ρ_i為所述第i個標志物的多個采樣樣本的標準差，X_i'為多個歸一化后的采樣樣本所組成的向量。

4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，根據第i個標志物的多個歸一化后的采樣樣本計算所述第i個標志物的費舍爾比率具體為：

根據求出第i個標志物中類別為0的采樣樣本的平均值，其中，j為第i個標志物中采樣樣本的序號，Y^j為第i個標志物中第j個采樣樣本的類別，當Y^j＝0時，第j個采樣樣本的類別為0，當Y^j＝1時，第j個采樣樣本的類別為1，為第i個標志物的第j個歸一化后的采樣樣本的值，m₀為第i個標志物中類別為0的采樣樣本的平均值；

根據求出第i個標志物中類別為0的采樣樣本的標準差，其中，v₀為第i個標志物中類別為0的采樣樣本的標準差；

根據求出第i個標志物中類別為1的采樣樣本的平均值，其中，m₁為第i個標志物中類別為1的采樣樣本的平均值；

根據求出第i個標志物中類別為1的采樣樣本的標準差，其中，v₁為第i個標志物中類別為1的采樣樣本的標準差；

根據計算第i個標志物的費舍爾比率。

5.根據權利要求2所述的方法，其特征在于，根據第a個標志物的多個采樣樣本和第b個標志物的多個采樣樣本計算出第a個標志物和第b個標志物之間的距離具體為：

根據計算出第a個標志物和第b個標志物之間的距離，其中，j為采樣樣本的序號，為所述第a個標志物第j個歸一化后的采樣樣本的值，為所述第b個標志物第j個歸一化后的采樣樣本的值，D_ab為第a個標志物和第b個標志物之間的距離。

6.根據權利要求1至5任一權利要求所述的方法，其特征在于，所述降維后的維度為2維或者3維。

7.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，每個標志物的費舍爾比率與每個標志物在散點圖上的大小成正比例。