[發明專利]基于二溫式RT-PCR檢測H4亞型禽流感病毒的試劑盒在審
| 申請號: | 201410734872.0 | 申請日: | 2014-12-05 |
| 公開(公告)號: | CN104498624A | 公開(公告)日: | 2015-04-08 |
| 發明(設計)人: | 謝芝勛;吳嬡瓊;謝志勤;鄧顯文;劉加波;謝麗基;羅思思;黃莉;黃嬌玲;曾婷婷 | 申請(專利權)人: | 廣西壯族自治區獸醫研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 廣西南寧公平專利事務所有限責任公司45104 | 代理人: | 楊立華 |
| 地址: | 530001廣西壯族*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 二溫式 rt pcr 檢測 h4 禽流感 病毒 試劑盒 | ||
技術領域
本發明屬于PCR檢測病毒技術領域,涉及一種基于二溫式RT-PCR檢測H4亞型禽流感病毒的試劑盒。
背景技術
禽流感(Avian?Influenza,AI)是由正黏病毒科A型流感病毒屬的禽流感病毒(AIV)引起的一種禽類的感染和/或疾病綜合征,主要引起禽類的全身或呼吸系統疾病。AIV亞型眾多,根據表面糖蛋白血凝素(Hemagglutinin,HA)和神經氨酸酶(Neuraminidase,NA)的抗原性差異,已鑒別出16種HA亞型(H1-H16)和9種NA(N1-N9)亞型;根據AIV致病力的差異可分為高致病性禽流感病毒(Highly?Pathogenic?Avian?Influenza?Virus,HPAIV)和低致病性禽流感病毒(Lowly?Pathogenic?Avian?Influenza?Virus,LPAIV)。HPAIV引起家禽的AI以全身感染、高發病率和高死亡率為特征;LPAIV引起家禽AI的臨床癥狀表現溫和,死亡率不高,但影響家禽的生長發育和生產性能。
H4亞型AIV屬于LPAIV,能隱性感染各種家禽及野生鳥類,宿主范圍比較廣,包括雞、火雞、鴨、野鴨、野鳥、鴕鳥、鸚鵡等,還可以跨種傳播,感染哺乳動物。薛峰等報道,在江蘇鹽城國家級自然保護區對野鴨、丹頂鶴等野禽AIV檢測中,H4亞型AIV分離率最高(38.5%)。雖然絕大多數LPAIV致病力低,但LPAIV可能為感染人類的AIV提供基因,潛在危害性不容忽視。因此,應加強對H4亞型AIV的監測。目前,國內已建立的快速檢測方法多數都是針對其他亞型AIV,如H1、H3、H5、H6、H7、H9亞型,而針對H4亞型AIV的快速檢測方法的未見報道。
發明內容
本發明要解決的技術問題是提供敏感性好、特異性強和重復性好的基于二溫式RT-PCR檢測H4亞型禽流感病毒的試劑盒,以簡便快速地檢測H4亞型禽流感病毒。
為解決上述技術問題,本發明采用以下技術方案:H4亞型禽流感病毒二溫式RT-PCR檢測引物對,包括引物1和2,它們分別具有序列表SEQ.ID.No.1和SEQ.ID.No.2的堿基序列。
引物1和引物2的摩爾比為1∶1。
上述H4亞型禽流感病毒二溫式RT-PCR檢測引物對在PCR擴增方面的應用,PCR擴增的退火溫度為58.0℃-68.0℃。
PCR擴增的退火溫度為65℃。
基于二溫式RT-PCR檢測H4亞型禽流感病毒的試劑盒,包括引物對、PCR擴增緩沖液和水;
引物對包括引物1和2,它們分別具有序列表SEQ.ID.No.1和SEQ.ID.No.2的堿基序列,其濃度均為25pmol/μL,在PCR反應體系中的終濃度分別為0.5pmol/μL;
PCR擴增緩沖液為2×Taq?PCR?Mix。
引物1和2在PCR反應體系中的終濃度分別為0.5μmol/L。
上述基于二溫式RT-PCR檢測H4亞型禽流感病毒的試劑盒在PCR擴增方面的應用,PCR擴增的退火溫度為58.0℃-68.0℃。
PCR擴增的退火溫度為65℃。
針對目前缺乏對H4亞型禽流感病毒進行快速檢測和診斷的有效可靠的技術,發明人研究設計了一對特異性引物,據此建立了H4亞型禽流感病毒二溫式RT-PCR檢測方法,并制備了相應的檢測試劑盒。實驗證明,應用本發明可檢測H4亞型禽流感病毒,具有操作快速簡便、敏感性高、特異性強和重復性好等優點,特異性試驗結果顯示該法可特異性擴增出H4亞型禽流感病毒,不擴增其他常見禽病病原體;敏感性試驗結果顯示該法對H4亞型禽流感病毒檢測下限為1.48pg/μL;對86份臨床樣品進行檢測,臨床樣品檢測結果與病毒分離結果一致。本發明用于H4亞型禽流感病毒導致的禽類感染早期診斷及有效防制,可以節約時間的成本。
附圖說明
圖1是二溫式RT-PCR退火溫度優化結果電泳圖,圖中:M、DL1000?DNA?Marker;1、58℃;2、59℃;3、60℃;4、61℃;5、62℃;6、63℃;7、64℃;8、65℃;9、66℃;10、67℃;11、68℃;12、陰性對照。
圖2是二溫式RT-PCR的特異性試驗結果電泳圖,圖中:M、DL1000?DNA?Marker;1~3為3株不同的H4亞型禽流感病毒;4~9分別為H1、H3、H5、H6、H7、H9亞型AIV;10、NDV;11、IBV;12、ILTV;13、MG;14、ARV;15、陰性對照。
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