[發(fā)明專利]影響中國西門塔爾牛脂肪沉積的FDFT1基因關(guān)鍵位點在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410678775.4 | 申請日: | 2014-11-24 |
| 公開(公告)號: | CN104611349A | 公開(公告)日: | 2015-05-13 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 楊潤軍;趙志輝;梁晶婕;房希碧;龍小娟;肖航;姜平 | 申請(專利權(quán))人: | 吉林大學(xué) |
| 主分類號: | C12N15/54 | 分類號: | C12N15/54;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 吉林長春新紀(jì)元專利代理有限責(zé)任公司 22100 | 代理人: | 陳宏偉 |
| 地址: | 130011 吉*** | 國省代碼: | 吉林;22 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 影響 中國 西門 塔爾牛 脂肪 沉積 fdft1 基因 鍵位 | ||
1.用于中國西門塔爾牛脂肪沉積性狀遺傳標(biāo)記的FGF-1基因,其特征在于:
核苷酸序列如序列表Seq?ID?NO.3和Seq?ID?NO.6所示,在序列表Seq?ID?NO.3第149?bp處有149T-149C的突變,導(dǎo)致Hae-III-RFLP多態(tài)性;在序列表Seq?ID?NO.6第390?bp處有390C-390T的突變,導(dǎo)致Hpa-II-RFLP多態(tài)性。
2.一種利用FDFT1基因檢測中國西門塔爾牛脂肪沉積性狀的分子標(biāo)記方法,其特征在于:
從中國西門塔爾牛血液中提取基因組DNA,根據(jù)中國西門塔爾牛FDFT1基因序列設(shè)計引物,得到的引物序列如下所示:
P1正向引物F:5'?CCTGGAGGACTTCCCAACGGTAG???3',
???????P1反向引物R:5'?CCTGGAGAATGCTATGGACAGAGGG?3';
???????P2正向引物F:5'?CTACTCGCCCATCTACCTGTCG??3',
P2反向引物R:5'?TCACACCTGCTACATTCAAGTCC?3';
用所示的特異性引物在中國西門塔爾牛基因組中進行PCR擴增,擴增基因產(chǎn)物純化、克隆測序,獲得如序列表SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.6所示的核苷酸序列,其中分別包括FDFT1基因I4-130?T>C和E8-500?C>T的單核苷酸堿基突變,并且利用PCR-RFLP方法對中國西門塔爾牛群體中FDFT1基因2個SNPs進行了檢測。
3.如權(quán)利要求2所述中國西門塔爾牛脂肪沉積性狀相關(guān)FDFT1基因SNPs的檢測方法,其特征在于:
所述的PCR擴增條件是:25?μL反應(yīng)體系,包括DNA?模板(50?ng/μL)1?μL、上下游引物(10?μmol/L)各1?μL、dNTPs(2?mmol/L)2.5?μL、Taq?DNA?聚合酶(5?U/μL)0.3?μL、Mg2+(25?mmol/L)1.5?μL、10×PCR?緩沖液2.5?μL、超純水15.2?μL;?所述的PCR?擴增反應(yīng)程序為:95℃變性5?min,95℃變性30?s,57℃(P1)、60℃(P2)退火45?s,72℃延伸30?s,進行30個循環(huán),最后72℃延伸10?min。
4.如權(quán)利要求2所述中國西門塔爾牛脂肪沉積性狀相關(guān)FDFT1基因SNPs的檢測方法,其特征在于:
SNP1(I4-130?T>C)為HaeIII內(nèi)切酶,在功能區(qū)域識別序列為GG/CC;SNP2(E8-500?C>T)為HpaII內(nèi)切酶,在功能區(qū)域識別序列為C/CGG。
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