[發明專利]一種基因編碼的環腺苷酸熒光探針及其制備方法和應用在審
| 申請號: | 201410648446.5 | 申請日: | 2014-11-14 |
| 公開(公告)號: | CN105646716A | 公開(公告)日: | 2016-06-08 |
| 發明(設計)人: | 楊弋;張茜;徐磊 | 申請(專利權)人: | 華東理工大學 |
| 主分類號: | C07K19/00 | 分類號: | C07K19/00;C12N15/62;C12Q1/02;G01N21/64 |
| 代理公司: | 上海三和萬國知識產權代理事務所(普通合伙) 31230 | 代理人: | 章鳴玉 |
| 地址: | 200237 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基因 編碼 腺苷酸 熒光 探針 及其 制備 方法 應用 | ||
1.一種基因編碼的cAMP熒光探針,其特征在于,其內含有熒光蛋白序列或其衍生物 和對cAMP敏感的多肽,其中所述對cAMP敏感的多肽,
(1)具有cAMP結合特性的CNBD結構域;和/或
(2)來源于對cAMP敏感的被cAMP直接活化調節的鳥嘌呤核苷酸交換因子Epac家族 蛋白。
2.根據權利要求1所述基因編碼的cAMP熒光探針,其特征在于,所述對cAMP敏感的 多肽為來自于真核生物的交換因子Epac蛋白基因的多肽,該多肽的序列選自SEQIDNO: 1、2、3和4。
3.根據權利要求1所述基因編碼的cAMP熒光探針,其特征在于,所述熒光蛋白序列 為環狀排列的黃色熒光蛋白cpYFP如SEQIDNO:21所示。
4.根據權利要求1-3任一項所述基因編碼的cAMP熒光探針,其特征在于,所述熒光 探針所包含的熒光蛋白序列B和對cAMP敏感的多肽中具有cAMP結合特性的CNBD結構域A, 所述B為序列表所示B1和/或B2氨基酸序列,所述A為序列表所示A1和/或A2氨基酸序 列;所述熒光探針的組合形式是:
(1)A-B-A,其中B插入A的柔性區域內,將A分割成A的第一部分和A的第二部分, A的第一部分和A的第二部分共同構成完整的A結構域;
(2)A1-B-A2,其中A1和A2分別串聯在B兩端,A1和A2前后順序可變換;A1是來 自于人體或小鼠組織器官的交換蛋白或其衍生物的氨基酸序列,A2是來自于人體或小鼠組 織器官的另一交換蛋白或其衍生物的氨基酸序列;
所述的cAMP熒光探針優選SEQIDNO:5、6、7、8、39、40、41、42、67所示的蛋白 序列。
5.根據權利要求1所述基因編碼的cAMP熒光探針,其特征在于,所述熒光探針為具 有以下結構:
A1-A2-LK1-FP-LK2-A3-A4,
其中,A1是Epac蛋白的第一結構域,為SEQIDNO:13或SEQIDNO:14;
A2是Epac蛋白的第二結構域,為SEQIDNO:15或SEQIDNO:16;
A3是Epac蛋白的第三結構域,為SEQIDNO:17或SEQIDNO:18;
A4是Epac蛋白的第四結構域,為SEQIDNO:19或SEQIDNO:20;
FP是熒光蛋白,選自GFP,YFP,CFP以及基于這些蛋白的變異體,優選YFP,更優選cpYFP 如SEQIDNO:21所示;
LK1可以存在或不存在,存在時,LK1為T、A、S、G中一種或一種以上氨基酸;
LK2可以存在或不存在,存在時,LK2為G、S、T中一種或一種以上氨基酸。
6.根據權利要求1所述基因編碼的cAMP熒光探針,其特征在于,所述cAMP熒光探針 為對熒光蛋白序列和對cAMP敏感的多肽的連接處氨基酸肽段YNSD和LEYN進行截短的突變 體,優選的是SEQIDNO:51-66和SEQIDNO:68-83所示的氨基酸序列。
7.根據權利要求1所述基因編碼的cAMP熒光探針,其特征在于,所述cAMP熒光探針 為對cAMP熒光探針進行定點突變的突變體,所述突變為在Epac2B-CNBD氨基酸序列的93 位、105位、122位、123位、132位、133位、152位、156位、160位、412位上突變; 優選的是SEQIDNO:110-126所示的氨基酸序列。
8.一種編碼權利要求1所述熒光探針的核苷酸序列,包括編碼對cAMP敏感的蛋白質 的核苷酸序列和編碼熒光蛋白的核苷酸序列。
9.根據權利要求8所述的核酸序列,其特征在于,所述核酸序列選自核苷酸序列SEQ IDNO:9、10、11或12。
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