[發(fā)明專利]大腦異常參數(shù)的提取方法和系統(tǒng)在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410597003.8 | 申請日: | 2014-10-29 |
| 公開(公告)號: | CN104346530A | 公開(公告)日: | 2015-02-11 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 姜春香;張麗娟;隆曉菁;劉新;鄭海榮 | 申請(專利權(quán))人: | 中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院 |
| 主分類號: | G06F19/00 | 分類號: | G06F19/00 |
| 代理公司: | 廣州華進(jìn)聯(lián)合專利商標(biāo)代理有限公司 44224 | 代理人: | 吳平 |
| 地址: | 518055 廣東省深圳*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 大腦 異常 參數(shù) 提取 方法 系統(tǒng) | ||
1.一種大腦異常參數(shù)的提取方法,所述方法包括:
對大腦進(jìn)行磁共振彌散張量成像和靜息態(tài)功能成像掃描,獲得所述大腦的彌散張量數(shù)據(jù)和靜息態(tài)功能數(shù)據(jù);
根據(jù)所述彌散張量數(shù)據(jù)構(gòu)建所述大腦的結(jié)構(gòu)連接網(wǎng)絡(luò);
根據(jù)所述靜息態(tài)功能數(shù)據(jù)構(gòu)建所述大腦的功能連接網(wǎng)絡(luò);
將所述結(jié)構(gòu)連接網(wǎng)絡(luò)和所述功能連接網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行耦合,得到網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo);
將網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo)與正常網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo)進(jìn)行排列檢驗,提取網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo)中與正常網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo)存在差異的參數(shù)。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述根據(jù)所述彌散張量數(shù)據(jù)構(gòu)建所述大腦的結(jié)構(gòu)連接網(wǎng)絡(luò)的步驟,包括:
根據(jù)所述彌散張量數(shù)據(jù)求得大腦個體空間的部分各向異性分?jǐn)?shù)圖;
通過確定性跟蹤算法對所述部分各向異性分?jǐn)?shù)圖進(jìn)行全腦白質(zhì)纖維束3D重建;
根據(jù)磁共振掃描數(shù)據(jù)獲取T1加權(quán)圖像和彌散張量成像非加權(quán)圖像;
將T1加權(quán)圖像配準(zhǔn)到彌散張量成像非加權(quán)圖像中;
將配準(zhǔn)后的T1加權(quán)圖像標(biāo)準(zhǔn)化到T1結(jié)構(gòu)模塊得到空間變化參數(shù),并對所述空間變化參數(shù)進(jìn)行逆變換得到逆變換參數(shù);
通過所述逆變換參數(shù)將具有MNI空間信息的AAL模板轉(zhuǎn)換到大腦個體空間;
根據(jù)所述大腦個體空間提取3D重建后全腦白質(zhì)纖維束中預(yù)設(shè)數(shù)量腦區(qū),并計算預(yù)設(shè)數(shù)量腦區(qū)中每一對腦區(qū)之間的結(jié)構(gòu)連接密度,得到關(guān)系矩陣;
對所述關(guān)系矩陣進(jìn)行閾值化處理,得到權(quán)重矩陣;
通過所述權(quán)重矩陣構(gòu)建所述大腦的結(jié)構(gòu)連接網(wǎng)絡(luò)。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述根據(jù)所述靜息態(tài)功能數(shù)據(jù)構(gòu)建所述大腦的功能連接網(wǎng)絡(luò)的步驟,包括:
對所述靜息態(tài)功能數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,將預(yù)處理好的靜息態(tài)功能數(shù)據(jù)配準(zhǔn)到AAL模塊;
通過高斯核對AAL模板進(jìn)行數(shù)據(jù)平滑,并提取AAL模板中預(yù)設(shè)數(shù)量腦區(qū)內(nèi)的時間序列信號并平均;
計算所述預(yù)設(shè)數(shù)量腦區(qū)內(nèi)每一對腦區(qū)之間的時間互相關(guān)系數(shù),并通過Fisher變換將所述時間相關(guān)系數(shù)轉(zhuǎn)換為功能連接矩陣;
對功能連接矩陣進(jìn)行閾值化處理得到二值矩陣,通過所述二值矩陣構(gòu)建功能連接網(wǎng)絡(luò)。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征在于,所述對所述靜息態(tài)功能數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理包括:時間校正、空間對齊和空間標(biāo)準(zhǔn)化到MNI標(biāo)準(zhǔn)腦模板空間。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述將所述結(jié)構(gòu)連接網(wǎng)絡(luò)和所述功能連接網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行耦合,得到網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo)的步驟,包括:
提取結(jié)構(gòu)連接網(wǎng)絡(luò)對應(yīng)的結(jié)構(gòu)連接矩陣中的非零元素,所述非零元素構(gòu)成結(jié)構(gòu)連接向量;
提取功能連接網(wǎng)絡(luò)對應(yīng)的結(jié)構(gòu)連接矩陣中非零元素位置對應(yīng)的功能連接,所述功能連接的強度構(gòu)成功能連接向量;
計算所述結(jié)構(gòu)連接向量與所述功能連接向量的皮爾遜相關(guān)系數(shù),所述皮爾遜相關(guān)系數(shù)即為網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo)。
6.一種大腦異常參數(shù)的提取系統(tǒng),其特征在于,所述系統(tǒng)包括:
掃描成像模塊,用于對大腦進(jìn)行磁共振彌散張量成像和靜息態(tài)功能成像掃描,獲得所述大腦的彌散張量數(shù)據(jù)和靜息態(tài)功能數(shù)據(jù);
第一網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建模塊,用于根據(jù)所述彌散張量數(shù)據(jù)構(gòu)建所述大腦的結(jié)構(gòu)連接網(wǎng)絡(luò);
第二網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建模塊,用于根據(jù)所述靜息態(tài)功能數(shù)據(jù)構(gòu)建所述大腦的功能連接網(wǎng)絡(luò);
網(wǎng)絡(luò)耦合模塊,用于將所述結(jié)構(gòu)連接網(wǎng)絡(luò)和所述功能連接網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行耦合,得到網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo);
參數(shù)提取模塊,用于將網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo)與正常網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo)進(jìn)行排列檢驗,提取網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo)中與正常網(wǎng)絡(luò)耦合性指標(biāo)存在差異的參數(shù)。
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G06F 電數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)處理
G06F19-00 專門適用于特定應(yīng)用的數(shù)字計算或數(shù)據(jù)處理的設(shè)備或方法
G06F19-10 .生物信息學(xué),即計算分子生物學(xué)中的遺傳或蛋白質(zhì)相關(guān)的數(shù)據(jù)處理方法或系統(tǒng)
G06F19-12 ..用于系統(tǒng)生物學(xué)的建模或仿真,例如:概率模型或動態(tài)模型,遺傳基因管理網(wǎng)絡(luò),蛋白質(zhì)交互作用網(wǎng)絡(luò)或新陳代謝作用網(wǎng)絡(luò)
G06F19-14 ..用于發(fā)展或進(jìn)化的,例如:進(jìn)化的保存區(qū)域決定或進(jìn)化樹結(jié)構(gòu)
G06F19-16 ..用于分子結(jié)構(gòu)的,例如:結(jié)構(gòu)排序,結(jié)構(gòu)或功能關(guān)系,蛋白質(zhì)折疊,結(jié)構(gòu)域拓?fù)洌媒Y(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的藥靶,涉及二維或三維結(jié)構(gòu)的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)的,例如:基因型–表型關(guān)聯(lián),不均衡連接,種群遺傳學(xué),結(jié)合位置鑒定,變異發(fā)生,基因型或染色體組的注釋,蛋白質(zhì)相互作用或蛋白質(zhì)核酸的相互作用
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