[發(fā)明專利]與豬生長速度相關(guān)的SNP標記及其應用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201410557725.0
• 申請日: 2014-10-20
• 公開（公告）號: CN104404133A
• 公開（公告）日: 2015-03-11
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 張浩;張博;徐艾詩;商鵬;王志秀
• 申請（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002
• 代理人: 王文君

1.一種與豬生長速度相關(guān)的SNP標記，其特征在于，其位于豬LXRα基因第5外顯子的201bp處，此處堿基為A的豬的生長速度顯著高于此處堿基為C的豬的生長速度。

2.用于檢測權(quán)利要求1所述與豬生長速度相關(guān)的SNP標記的引物，其特征在于，包括正向引物F5’-AAGAAACTGAAGCGGCAAGAG-3’和反向引物R5'-ATCGCAGAGGTCTTTAGGAGG-3'。

3.權(quán)利要求1所述與豬生長速度相關(guān)的SNP標記在鑒定快速生長的優(yōu)勢豬品種中的應用，其包括步驟：

1)提取待測豬的基因組DNA；

2)以待測豬的基因組DNA為模板，利用權(quán)利要求2所述引物F和R，通過PCR反應擴增出豬LXRα基因462bp片段；

3)檢測PCR擴增產(chǎn)物，如果擴增產(chǎn)物序列中172bp處的堿基為A，則待測豬屬于快速生長的優(yōu)勢豬品種。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應用，其特征在于，步驟2)中PCR反應使用的擴增體系以25μl計為：100ng/μL模板DNA1μL，5pmol/μL引物F和R各1μL，10mmol/L?dNTP?mix2.0μL，5U/μL?Taq?DNA聚合酶0.5μL，10×PCR反應緩沖液2.5μL，余量為水。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應用，其特征在于，步驟2)中PCR反應使用的條件為：95℃5分鐘；95℃30秒，58℃30秒，72℃20秒，36個循環(huán)；72℃7分鐘。

6.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應用，其特征在于，步驟3)中檢測PCR擴增產(chǎn)物采用RFLP法，具體為：用內(nèi)切酶Taq?I對PCR擴增產(chǎn)物進行酶切，并對酶切產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳檢測，如果檢測結(jié)果為兩條帶，則判定基因型為AA型，待測豬屬于生長快速的優(yōu)勢豬品種；檢測結(jié)果出現(xiàn)三條帶，則判定基因型為CC型，待測豬屬于普通品種；檢測結(jié)果為四條帶，則判定基因型為AC型，待測豬屬于生長快速的優(yōu)勢豬品種。

7.含有權(quán)利要求2所述引物的用于檢測豬生長速度的試劑盒。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒還包括dNTPs、Taq?DNA聚合酶、Mg²⁺、PCR反應緩沖液中的一種或多種。

9.根據(jù)權(quán)利要求7或8所述的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒還包括標準陽性模板。

10.權(quán)利要求1所述與豬生長速度相關(guān)的SNP標記在豬分子標記輔助育種中的應用。