[發(fā)明專利]電子FISH的方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410533062.9 | 申請日： | 2014-10-11 |
| 公開（公告）號： | CN104318131A | 公開（公告）日： | 2015-01-28 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 崔興雷;劉方;彭仁海;蔡小彥;王星星;周忠麗;王春英;王玉紅;劉玉玲;王坤波 | 申請（專利權(quán)）人： | 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所;安陽工學(xué)院 |
| 主分類號： | G06F19/22 | 分類號： | G06F19/22;G06F19/20 |
| 代理公司： | 北京法思騰知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11318 | 代理人： | 高宇 |
| 地址： | 455000 河*** | 國省代碼： | 河南;41 |
| 權(quán)利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 電子 fish 方法 | ||
【權(quán)利要求書】：
1.一種電子FISH的方法，其特征在于，所述方法包括以下步驟：
(1)以探針序列作為檢索序列，以靶序列作為數(shù)據(jù)庫序列，進(jìn)行序列比對；
(2)用Perl腳本blast_parser.pl修飾比對結(jié)果，該腳本可以把比對結(jié)果轉(zhuǎn)換成表格形式，方便統(tǒng)計分析；
(3)刪除比對結(jié)果中片段偏短、一致性偏差的結(jié)果；
(4)以探針序列在靶序列上的位置為縱坐標(biāo)，以比對次數(shù)為橫坐標(biāo)做散點(diǎn)圖。
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G06 計算；推算；計數(shù)
G06F 電數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)處理
G06F19-00 專門適用于特定應(yīng)用的數(shù)字計算或數(shù)據(jù)處理的設(shè)備或方法
G06F19-10 .生物信息學(xué)，即計算分子生物學(xué)中的遺傳或蛋白質(zhì)相關(guān)的數(shù)據(jù)處理方法或系統(tǒng)
G06F19-12 ..用于系統(tǒng)生物學(xué)的建模或仿真，例如：概率模型或動態(tài)模型，遺傳基因管理網(wǎng)絡(luò)，蛋白質(zhì)交互作用網(wǎng)絡(luò)或新陳代謝作用網(wǎng)絡(luò)
G06F19-14 ..用于發(fā)展或進(jìn)化的，例如：進(jìn)化的保存區(qū)域決定或進(jìn)化樹結(jié)構(gòu)
G06F19-16 ..用于分子結(jié)構(gòu)的，例如：結(jié)構(gòu)排序，結(jié)構(gòu)或功能關(guān)系，蛋白質(zhì)折疊，結(jié)構(gòu)域拓?fù)洌媒Y(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的藥靶，涉及二維或三維結(jié)構(gòu)的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)的，例如：基因型–表型關(guān)聯(lián)，不均衡連接，種群遺傳學(xué)，結(jié)合位置鑒定，變異發(fā)生，基因型或染色體組的注釋，蛋白質(zhì)相互作用或蛋白質(zhì)核酸的相互作用
G06F 電數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)處理
G06F19-00 專門適用于特定應(yīng)用的數(shù)字計算或數(shù)據(jù)處理的設(shè)備或方法
G06F19-10 .生物信息學(xué)，即計算分子生物學(xué)中的遺傳或蛋白質(zhì)相關(guān)的數(shù)據(jù)處理方法或系統(tǒng)
G06F19-12 ..用于系統(tǒng)生物學(xué)的建模或仿真，例如：概率模型或動態(tài)模型，遺傳基因管理網(wǎng)絡(luò)，蛋白質(zhì)交互作用網(wǎng)絡(luò)或新陳代謝作用網(wǎng)絡(luò)
G06F19-14 ..用于發(fā)展或進(jìn)化的，例如：進(jìn)化的保存區(qū)域決定或進(jìn)化樹結(jié)構(gòu)
G06F19-16 ..用于分子結(jié)構(gòu)的，例如：結(jié)構(gòu)排序，結(jié)構(gòu)或功能關(guān)系，蛋白質(zhì)折疊，結(jié)構(gòu)域拓?fù)洌媒Y(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的藥靶，涉及二維或三維結(jié)構(gòu)的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)的，例如：基因型–表型關(guān)聯(lián)，不均衡連接，種群遺傳學(xué)，結(jié)合位置鑒定，變異發(fā)生，基因型或染色體組的注釋，蛋白質(zhì)相互作用或蛋白質(zhì)核酸的相互作用
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