[發(fā)明專利]TP1基因3’UTR區(qū)功能SNP位點及其檢測引物、試劑盒和檢測方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201410531776.6
• 申請日: 2014-10-10
• 公開（公告）號: CN104293951A
• 公開（公告）日: 2015-01-21
• 發(fā)明（設計）人: 鞠志花;張帥;王長法;張燕;王秀革;黃金明;李建斌;仲躋峰
• 申請（專利權(quán)）人: 山東省農(nóng)業(yè)科學院奶牛研究中心
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 濟南圣達知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 37221
• 代理人: 楊琪;崔苗苗

1.一種影響種公牛精液品質(zhì)優(yōu)劣的TP1基因3'UTR區(qū)功能SNP位點，其特征在于，所述SNP位點為：g.528G>A；核苷酸位置的編號基于GenBank登錄號為AC_000159.1，在105576568與105577158之間的牛TP1基因序列，且以TP1基因的起始密碼子ATG作為+1。

2.權(quán)利要求1所述的TP1基因3'UTR區(qū)功能SNP位點在篩選和鑒定種公牛是否具有優(yōu)質(zhì)的精液品質(zhì)中的應用。

3.一種用于檢測種公牛TP1基因3'UTR區(qū)功能SNP位點的引物，其特征在于，上游引物的序列如SEQ?ID?NO.1所示,下游引物的序列如SEQ?ID?NO.2所示。

4.權(quán)利要求3所述的引物在篩選和鑒定種公牛是否具有優(yōu)質(zhì)的精液品質(zhì)中的應用。

5.一種用于檢測種公牛TP1基因3'UTR區(qū)功能SNP位點基因分型的引物，其特征在于，上游引物序列如SEQ?ID?NO.4所示,下游引物序列如SEQ?ID?NO.5所示。

6.權(quán)利要求5所述的引物在篩選和鑒定種公牛是否具有優(yōu)質(zhì)的精液品質(zhì)中的應用。

7.采用權(quán)利要求5所述的引物進行種公牛精液品質(zhì)優(yōu)劣篩選的方法，其特征在于，以種公牛基因組DNA為模板，利用SEQ?ID?NO.4和SEQ?ID?NO.5所示的引物對待檢測的種公牛的TP1基因3'UTR區(qū)進行擴增，將PCR產(chǎn)物用FastDigest限制酶TaqⅠ進行切割，聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測酶切產(chǎn)物，并根據(jù)銀染后的電泳結(jié)果進行判定：若得到283bp一條帶，則為GG基因型；若得到307bp，283bp兩條帶，則為GA基因型；若得到307bp一條帶，則為AA基因型；其中，GG基因型具有優(yōu)良的精液品質(zhì)性狀，作為種公牛精液品質(zhì)優(yōu)劣篩選的分子標記。

8.一種用于種公牛精液品質(zhì)優(yōu)劣篩選的試劑盒，其特征在于，含有權(quán)利要求5所述的引物。

9.如權(quán)利要求8所述的用于種公牛精液品質(zhì)優(yōu)劣篩選的試劑盒，其特征在于，包括：上游引物10μmol/L，其序列如SEQ?ID?NO.4所示；下游引物10μmol/L，其序列如SEQ?ID?NO.5所示；上述引物能夠擴增出序列如SEQ?ID?NO.6所示的片段；2×Taq?PCR?MasterMix；ddH₂O；FastDigest限制酶TaqⅠ；10×FastDigest?buffer。