[發明專利]一種大菱鲆個體育種值評估方法

有效

• 申請號: 201410514807.7
• 申請日: 2014-09-30
• 公開（公告）號: CN104313135A
• 公開（公告）日: 2015-01-28
• 發明（設計）人: 王偉繼;官健濤;胡玉龍;欒生;孔杰
• 申請（專利權）人: 中國水產科學研究院黃海水產研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;A01K61/00
• 代理公司: 青島海昊知識產權事務所有限公司 37201
• 代理人: 曾慶國

1.一種大菱鲆個體育種值評估方法，其特征在于，所述的方法包括有如下的步驟：

1)首先將待檢測的大菱鲆雌雄個體來構建家系，

2)對構建的家系中的子代個體在養殖后，選取全部或部分個體進行生長性狀的測量；獲得個體的生長性狀的測量值；

3)提取構建家系的雌雄親本的DNA進行SSR位點基因分型；記錄每一個體在每個SSR位點上的等位基因峰值數據；

4)利用Coancestry1.0.1.2軟件對SSR分型數據進行計算求得親本個體間的共祖率coancestry及近交系數F；

家系子代個體間的共祖率由其父母本間的共祖率根據公式(1)求得，其中個體與其本身的共祖率由公式(2)求出，并按公式(3)計算出子代個體間的遺傳相關系數，即分子遺傳相關系數；

θPQ=14(θAC+θAD+θBC+θBD)---(1)]]>

θAA=12(1+FA)---(2)]]>

r_PQ＝2θ_PQ????(3)

其中A和B、C和D分別代表P和Q的父母本，θ代表共祖率，F代表近交系數，r代表遺傳相關系數；

5)然后利用R3.0.2軟件將父母本間共祖率轉化為其子代個體間的分子遺傳相關系數矩陣；最后利用ASReml軟件計算個體育種值：

y＝Xb+Zu+e

其中y代表大菱鲆家系子代個體的測量值，bi代表固定效應，u代表隨機效應，e表示殘差效應；

再根據狹義遺傳力公式求得遺傳力估計值：

h2=σa2/σp2]]>

和分別表示加性遺傳方差及表現方差。

2.如權利要求1所述的方法，其特征在于，所述的步驟1)中的家系為母系半同胞家系組和/或全同胞家系。

3.如權利要求1所述的方法，其特征在于，所述的步驟3)中的SSR位點基因分型所用到的微衛星引物序列信息如下：

4.如權利要求1所述的方法，其特征在于，所述的步驟3)中所述的SSR位點基因分型是利用全自動基因分析儀進行SSR基因分型。