[發明專利]目標基因的捕獲試劑盒及捕獲方法

有效

• 申請號: 201410508624.4
• 申請日: 2014-09-28
• 公開（公告）號: CN105524981B
• 公開（公告）日: 2019-02-05
• 發明（設計）人: 周婕;陳亞寧;酈征宇
• 申請（專利權）人: 浙江大學;杭州然鈉生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6876
• 分類號: C12Q1/6876;C12N15/11
• 代理公司: 北京集佳知識產權代理有限公司 11227
• 代理人: 趙青朵;馮瓊

本發明屬于生物技術領域，公開了一種目標基因的捕獲探針、包括目標基因的捕獲探針的捕獲試劑盒及捕獲目標基因的方法。本發明所述目標基因的捕獲探針為生物素標記的63個目標基因的特異性探針組，其與全基因組DNA雜交，運用鏈霉親和素包被的磁珠，可將與探針結合的DNA片段捕捉下來，在進行二代高通量測序前實現對特定目標基因組區域的富集。本發明所述目標基因的捕獲探針覆蓋率廣，測序深度深，極大的提高了基因組中目標區域的研究效率，顯著降低了測序成本。本發明所述目標基因捕獲試劑盒組成簡單，適用范圍廣，而且成本低，適用于廣大的實驗室和科研工作。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，具體涉及一種目標基因的捕獲探針、包括目標基因的捕獲探針的捕獲試劑盒及捕獲目標基因的方法。

背景技術

快速和準確地獲取生物體的遺傳信息對于生命科學研究一直具有十分重要的意義。對于每個生物體來說，基因組包含了整個生物體的遺傳信息。測序技術能夠真實地反映基因組DNA上的遺傳信息，進而比較全面地揭示基因組的復雜性和多樣性，因而在生命科學研究中扮演了十分重要的角色。

測序技術最早可以追溯到20世紀50年代，早在1954年就已經出現了關于早期測序技術的報導，即Whitfeld等用化學降解的方法測定多聚核糖核苷酸序列。1977年Sanger等發明的雙脫氧核苷酸末端終止法和Gilbert等發明的化學降解法，標志著第一代測序技術的誕生。此后在三十幾年的發展中陸續產生了第二代測序技術，包括Roche公司的454技術、Illumina公司的Solexa技術和ABI公司的SOLiD技術。相比傳統的Sanger測序法，新一代測序技術的推出及普及，使得基因測序的通量和質量大幅提高，而測序成本逐步降低。目前Roche，Illumina等公司推出的小型實驗臺測序儀價格非常低廉，感興趣的客戶群也非常之多。

目前臨床癌癥的早期診斷和個性化指導用藥需要對病人進行相關基因的測序。然而Roche，Illumina等公司推出的配套測序平臺使用的試劑盒僅僅適用于全基因組或者全外顯子的測序，而全基組測序或全外顯子的測序對于大樣本量的研究仍然費用太高，不適合癌癥的早期診斷和個性化指導用藥。因此要想真正能夠把二代測序技術推向臨床，能夠滿足醫生的需求，就需要設計針對特定疾病的靶向基因的測序試劑盒。

目前Illumina公司和Life technologies公司都提供靶向基因的捕獲試劑盒，然而上述公司的試劑盒產品針對的靶向基因的數目不全，并非全區域覆蓋。如Illumina公司的TruSeq Amplicon-Cancer Panel，共檢測48個基因，而Life technologies公司的AmpliSeq Cancer Hotspot Panel，共檢測50個基因中的熱點位點而非全部區域。而且以上商業試劑盒雖然均能達到90％以上的覆蓋率，但是仍然有10％區域的缺失，并且每個區域的覆蓋深度不同，無法進行定量的分析。

發明內容

有鑒于此，本發明的一個目的是提供一種目標基因的捕獲探針，為生物素標記的目標基因的特異性探針組，所述目標基因包括如下63個基因：