[發(fā)明專利]兩個增加豬肋骨數(shù)的主效標(biāo)記及其在豬育種中的應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201410419679.8
• 申請日: 2012-12-04
• 公開（公告）號: CN104232630A
• 公開（公告）日: 2014-12-24
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 任軍;黃路生;幸宇云;張志燕;艾華水
• 申請（專利權(quán)）人: 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 北京聿宏知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11372
• 代理人: 吳大建;陳偉

本申請為2012年12月04日提交的申請?zhí)枮?01210509536.7的同名中國發(fā)明專利申請的分案申請。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及動物遺傳育種領(lǐng)域，尤其是涉及兩個增加豬肋骨數(shù)的主效標(biāo)記及其在種豬遺傳改良中的應(yīng)用。

背景技術(shù)

豬屬于脊椎動物，豬的脊椎分為頸椎、胸椎、腰椎、薦椎和尾椎，豬的頸椎、薦椎和尾椎數(shù)相對固定，而胸椎和腰椎數(shù)存在差異，胸椎又俗稱肋骨。豬肋骨數(shù)是重要的經(jīng)濟性狀，且其遺傳力高達0.6以上。肋骨數(shù)與豬的胴體長顯著相關(guān)，隨著肋骨數(shù)的增加，豬的胴體長也在相應(yīng)的增長，每增加一根肋骨數(shù)可使體長增加80mm左右，豬的產(chǎn)肉量也因此得到了相應(yīng)的增加。

申請人前期利用構(gòu)建的大規(guī)模白色杜洛克豬×二花臉豬F₂資源群體，測定了1029頭F₂屠宰個體的脊椎數(shù)表型，通過全基因組掃描檢測到了7號染色體上影響豬肋骨數(shù)的主效基因位點(QTL)，初步定位的區(qū)間大小為900kb。

鑒于以上背景情況，申請人通過白色杜洛克豬×二花臉豬F₂資源群體、二花臉豬×通城豬F₂資源群體和蘇太豬群體的全基因組關(guān)聯(lián)(GWAS)分析和后裔同源相同(IBD)分析，將QTL區(qū)間縮小到100kb。對該區(qū)域開展重測序、多態(tài)位點的搜尋、鑒別及其與豬肋骨數(shù)相關(guān)性的研究，以期建立高效準(zhǔn)確的基因育種技術(shù)開展豬肋骨數(shù)的選育工作。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的第一個目的是提供兩個增加豬肋骨數(shù)的主效標(biāo)記，即：序列表SEQ?ID?NO:1所示的位于豬7號染色體上的基因變異序列，序列標(biāo)注位置為2401的A2401-C2401的核苷酸突變；序列表SEQ?ID?NO:1中序列標(biāo)注位置為3678和3679之間的一個291個核苷酸的插入突變。通過現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)檢測這兩個主效標(biāo)記，判定攜帶增加肋骨數(shù)有利等位基因的個體。

本發(fā)明的第二個目的是增加豬肋骨數(shù)的主效標(biāo)記在種豬遺傳改良中的應(yīng)用，即利用所鑒別的主效標(biāo)記信息開展種豬選育,選擇導(dǎo)致豬肋骨數(shù)更多的基因型個體留種，以提高種豬的肋骨數(shù)、胴體長和產(chǎn)肉量。

為此，本發(fā)明第一個方面提供了一種主效標(biāo)記，該主效標(biāo)記的序列如序列表SEQ?ID?NO:1所示，其中在該序列第3678和3679之間的位置為一個291個核苷酸的插入突變。

本發(fā)明第二個方面提供了本發(fā)明第一個方面所述的主效標(biāo)記在蘇太豬，由杜洛克豬、長白豬和大白豬雜交獲得的西方三元雜交商品豬，杜洛克豬和二花臉豬的雜交豬以及二花臉豬和通城豬的雜交豬的豬肋骨數(shù)鑒定中的應(yīng)用。

本發(fā)明的第一個目的是這樣實現(xiàn)的：

1、實驗動物和表型測定

本發(fā)明所使用的豬群體共有4個：白色杜洛克豬×二花臉豬F₂資源群體、二花臉豬×通城豬F₂資源群體、蘇太豬(50％杜洛克豬和50％太湖豬血緣)群體和三元雜(杜洛克豬×長白豬×大白豬)群體。

白色杜洛克豬×二花臉豬F₂資源群體以2頭白色杜洛克公豬和17頭二花臉母豬為祖代繁殖F₁代，選9頭F₁公豬與59頭F₁母豬分6批次互交產(chǎn)生1912頭F₂個體，其中918頭F₂個體在240±3日齡屠宰以記錄肋骨數(shù)表型數(shù)據(jù)。

二花臉豬×通城豬F₂資源群體以1頭二花臉公豬和1頭通城母豬交配得到2頭F₁公豬和7頭F₁母豬，F(xiàn)₁后代互交后產(chǎn)生61頭F₂個體，所有F₂個體在60日齡屠宰以記錄肋骨數(shù)表型數(shù)據(jù)。

蘇太豬是一個中國培育品種，它是由中國太湖豬和西方杜洛克豬種通過超過18個世代的培育而獲得的豬種(各含50％太湖豬和50％杜洛克豬的血緣)；本發(fā)明中，4頭蘇太公豬與55頭蘇太母豬交配獲得461頭后代，其中的435頭在240±3日齡屠宰以記錄肋骨數(shù)表型數(shù)據(jù)。此外，1403頭195±3日齡的三元雜商品豬的樣本和肋骨數(shù)表型數(shù)據(jù)分9個批次從位于南昌蔣巷的江西國鴻有限公司屠宰場獲得。

2、豬全基因組60K?SNP判型