[發明專利]一種高分辨質譜數據的處理方法

有效

• 申請號: 201410398615.4
• 申請日: 2014-08-14
• 公開（公告）號: CN105334279B
• 公開（公告）日: 2017-08-04
• 發明（設計）人: 曾仲大;陳愛明
• 申請（專利權）人: 大連達碩信息技術有限公司
• 主分類號: G01N30/86
• 分類號: G01N30/86
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種高分辨質譜數據處理方法，其特征在于包括以下步驟：

a.用戶預先定義用于質譜數據處理的參考數據樣本；

b.快速讀取質譜數據的XML文件，單個文件讀取完成后，構造二維矩陣并從數據色譜方向扣除背景基線；

c.背景基線扣除以非固定尺寸移動窗口的方式進行，即沿著色譜的流出方向根據色譜峰的劃分對數據進行自動背景扣除；

d.用戶自定義質譜響應的閾值或總特征峰數目，將已扣除背景的數據響應值，按照從大到小的順序排列，篩選符合響應閾值或峰數目條件的質譜特征作為與參考樣本比較分析的依據；

e.以用戶自定義的窗口尺寸大小，依次從數據的質譜和色譜二個方向，以固定的窗口大小劃分數據，獲得被分析樣本與參考樣本在該窗口內的質譜特征，計算二個不同類型樣本中質譜特征倆倆間的距離,得到一個距離矩陣；

f.基于線性規劃逆向思維的策略，計算該距離矩陣內從起始點到結束點的最短路徑，記錄該最短路徑所經過的軌跡，獲得被校正樣本數據與參考樣本數據中各個特征峰的最優匹配關系，同時校正樣本間的保留時間與m/z漂移；

g.將校正完成后獲得的峰表進行高分辨質譜特征融合，即得到同一代謝小分子中多個特征間的關聯關系與多樣本的匹配峰表；

h.將上述獲得的峰表與原始數據進行比較，驗證結果的準確性和可靠性，并將結果應用于代謝組學標志物的發現和鑒定中。

2.根據權利要求1所述的質譜數據處理方法，其特征在于先校正數據的噪聲和背景，以用戶自定義的質譜響應的閾值或總特征峰數目快速獲得數據中的主要質譜特征。

3.根據權利要求1所述的質譜數據處理方法，其特征在于以用戶可簡便使用的質譜響應閾值或特征峰數目方法判別質譜特征，采用基于高分辨質譜特征峰融合的方法對大量的質譜特征進行刪減、合并和歸類的融合處理。

4.根據權利要求1所述的質譜數據處理方法，其特征在于高分辨質譜特征融合包括以下步驟：

i.對校正完成后獲得的質譜峰表進行預處理分析以提高數據質量，首先采用80％規則去除零值數量較大的質譜特征，然后以特征中最低信號的萬分之一對缺失值進行替換處理；

j.去除峰表數據中的同位素峰；

k.根據加和離子，中性丟失和相關性分析的原則，找到不同離子倆倆間的融合關系，尋找這些離子可被視為來自同一小分子裂解的規律和線索；

l.根據上述結果，將相同小分子的裂解碎片離子融合在一起；

m.人工查看結果，評價上述融合結果的準確性，若存在錯誤的融合，則加入去除錯誤融合的規則，重新進行新的峰表數據融合；

n.依照質量數從小到大的順序，依次對質譜數據中所有的質譜特征進行分析，直到所有離子特征均被分析完成為止。