[發(fā)明專利]一種本地數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)及其檢索與更新方法

有效

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• 申請日: 2014-08-07
• 公開（公告）號: CN104123390A
• 公開（公告）日: 2014-10-29
• 發(fā)明（設計）人: 喻門
• 申請（專利權）人: 武漢中科麥特技術有限公司
• 主分類號: G06F17/30
• 分類號: G06F17/30
• 代理公司: 武漢東喻專利代理事務所(普通合伙) 42224
• 代理人: 宋業(yè)斌;李歡

技術領域

本發(fā)明屬于計算機技術領域，更具體地，涉及一種本地數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)及其檢索與更新方法，主要用于對代謝物核磁共振譜圖進行快速解析。

背景技術

代謝組學是誕生于上世紀90年代的一門新興學科，研究對象是分子量小于1000道爾頓的小分子代謝物，研究手段主要依靠核磁共振和色譜質(zhì)譜聯(lián)用。目前基于核磁共振的代謝組學研究中最復雜耗時的步驟是對代謝物核磁共振譜圖進行解析，將核磁譜圖中1H和13C信號歸屬至代謝物相應基團，該步驟主要依靠人工對H-H相關、C-H相關的COSY、TOCSY、HSQC、HMBC和J分解譜這一整套二維譜進行逐一解析，研究人員需要經(jīng)過專業(yè)而系統(tǒng)的培訓才能掌握相關技術，且人工解析耗時很長。

由于一個代謝物除了對應一套唯一信息如CAS編號、通用名、分子式、類別等，還對應多套獨立不唯一信息，如化學位移、同義詞等。不同代謝物的分子式、類別和化學位移等信息還易重合。因此代謝物數(shù)據(jù)庫面臨數(shù)據(jù)量龐大且容易冗余的問題，從而導致數(shù)據(jù)檢索效率低下、更新數(shù)據(jù)復雜。另一方面，由于代謝物數(shù)據(jù)庫使用者的研究領域不盡相同，迫切需要可以個性化訂制和擴展的本地化數(shù)據(jù)庫。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于提供一種用于代謝物核磁共振譜圖快速解析的本地數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)及其檢索與更新方法，根據(jù)代謝物核磁共振譜圖中的1H和13C信號的化學位移在代謝物數(shù)據(jù)庫中進行檢索，無須人工解析二維譜圖，用于代謝物核磁共振譜圖快速解析，旨在降低數(shù)據(jù)存儲量，提高檢索效率和更新效率，擺脫對因特網(wǎng)連接的依賴，可本地化實現(xiàn)檢索和更新功能，進行個性化數(shù)據(jù)拓展和數(shù)據(jù)訂制。

為了實現(xiàn)上述發(fā)明目的，本發(fā)明提供了一種用于代謝物核磁共振譜圖快速解析的本地數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)，所述本地數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)包括本地數(shù)據(jù)庫，所述本地數(shù)據(jù)庫包括代謝物核磁共振譜圖信息數(shù)據(jù)表、代謝物核磁共振譜圖信息域處理單元以及代謝物核磁共振譜圖信息報表處理單元，其中：

所述代謝物核磁共振譜圖信息數(shù)據(jù)表，包含有多個相關數(shù)據(jù)表，所述多個相關數(shù)據(jù)表至少包括基本信息數(shù)據(jù)表、同義詞數(shù)據(jù)表和化學位移特征數(shù)據(jù)表，其中所述基本信息數(shù)據(jù)表用于存儲CAS編號、通用名、分子式、類別和來源，所述同義詞數(shù)據(jù)表用于存儲CAS編號和同義詞，所述化學位移特征數(shù)據(jù)表用于存儲CAS編號、通用名、基團、1H化學位移、峰形和13C化學位移，且每個數(shù)據(jù)表還分別包含一個自動編號的ID；所述代謝物核磁共振譜圖信息數(shù)據(jù)表，以文本數(shù)據(jù)類型分別存儲不同代謝物相對獨立的信息，并通過CAS編號進行關聯(lián)，以有效減少數(shù)據(jù)量；

所述代謝物核磁共振譜圖信息域處理單元，用于將上述代謝物核磁共振譜圖信息數(shù)據(jù)表的不同數(shù)據(jù)表中的多個域處理成一合并域，并對所述合并域中的各子域進行操作設置；所述操作設置包括：在檢索操作中在所述合并域中的各子域中讀入所述基本信息數(shù)據(jù)表、同義詞數(shù)據(jù)表和化學位移特征數(shù)據(jù)表中對應域的數(shù)據(jù)，在更新操作中將所述合并域中的各子域中的數(shù)據(jù)更新至所述基本信息數(shù)據(jù)表、同義詞數(shù)據(jù)表和化學位移特征數(shù)據(jù)表中對應域；

所述代謝物核磁共振譜圖信息報表處理單元，用于按照預定格式和順序輸出從所述代謝物核磁共振譜圖信息數(shù)據(jù)表中查詢的結果，為了使結果直觀清晰，僅顯示代謝物CAS編號、通用名及分子式信息，其余信息中的一種或多種可通過點擊代謝物通用名的超鏈接另外打開新窗體來實現(xiàn)，其中所述其余信息包括：代謝物的類別、來源、同義詞、基團、1H化學位移、峰形和13C化學位移。

在本發(fā)明的一個實施例中，還包括與本地數(shù)據(jù)庫交互的檢索裝置，所述檢索裝置包括：

檢索解析單元，用于根據(jù)用戶在查詢窗體輸入的內(nèi)容進行解析，并根據(jù)所述解析結果調(diào)用對應的查詢語句，其中所述用戶在查詢窗體輸入的內(nèi)容為1H化學位移或13C化學位移；

檢索單元，用于在合并域的各子域中讀入所述基本信息數(shù)據(jù)表、同義詞數(shù)據(jù)表和化學位移特征數(shù)據(jù)表中對應域的數(shù)據(jù)，運行查詢語句中相關的運算表達式，在所述合并域中進行查找，獲得查詢結果。

在本發(fā)明的一個實施例中，還包括與本地數(shù)據(jù)庫交互的更新裝置，所述更新裝置包括：

更新解析單元，用于根據(jù)用戶在更新窗體輸入的內(nèi)容進行解析，并根據(jù)所述解析結果調(diào)用對應的更新語句，其中所述用戶在更新窗體輸入的內(nèi)容包括代謝物的通用名、分子式、類別、來源、同義詞、通用名、基團、1H化學位移、峰形和13C化學位移中的一種或多種；

更新單元，用于運行更新語句中相關的運算表達式，將合并域中各子域中的數(shù)據(jù)更新至所述基本信息數(shù)據(jù)表、同義詞數(shù)據(jù)表和化學位移特征數(shù)據(jù)表中對應域。