[發明專利]一種基于基因芯片網絡分析的疾病風險基因識別方法

在審

• 申請號: 201410345984.7
• 申請日: 2014-07-21
• 公開（公告）號: CN104156503A
• 公開（公告）日: 2014-11-19
• 發明（設計）人: 徐瑞龍;伯曉晨;楊寧敏
• 申請（專利權）人: 金華市中心醫院
• 主分類號: G06F17/50
• 分類號: G06F17/50
• 代理公司: 金華科源專利事務所有限公司 33103
• 代理人: 胡杰平

1.一種基于基因芯片網絡分析的疾病風險基因識別方法，其特征在于：結合遞歸決策森林技術，通過計算每一成對基因在遞歸決策森林中的出現頻率，定量分析每一對基因和疾病的相關程度，給出基因互作網絡的風險基因的分布圖譜。

2.根據權利要求1所述的一種基于基因芯片網絡分析的疾病風險基因識別方法，其特征是，所述的遞歸決策森林技術，包含兩部分：一是遞歸決策樹的構建；二是遞歸決策樹分類效能的評價。

3.根據權利要求1或2所述的一種基于基因芯片網絡分析的疾病風險基因識別方法，其特征是，所述的每一成對基因在遞歸決策森林中的出現頻率，包含任一兩個基因在遞歸決策森林中出現的頻率，這些數據具有相似的類型。

4.根據權利要求1或2所述的一種基于基因芯片網絡分析的疾病風險基因識別方法，其特征是，所述的基因和疾病的相關程度它的計算包括下列步驟：接收來自基因芯片的表達譜數據，對數據進行標準化；從構建的決策樹中提取相應節點的特征基因子集，若干決策樹構成決策森林，對決策樹分類效能進行評價；計算每一基因對在決策森林中的出現頻率；計算基因間的這種相關關系與疾病的關聯函數。

5.根據權利要求4所述的一種基于基因芯片網絡分析的疾病風險基因識別方法，其特征是，所述的基因互作網絡的風險基因的分布圖譜，通過可視化排列檢驗閾值以上的基因互作關系對，得到基因網絡的風險基因分布圖譜。