[發明專利]特異性結合DOCK8基因片段的探針、檢測DOCK8突變情況的試劑盒及方法有效
| 申請號： | 201410336687.6 | 申請日： | 2014-07-15 |
| 公開（公告）號： | CN104059993A | 公開（公告）日： | 2014-09-24 |
| 發明（設計）人： | 趙曉東;秦濤 | 申請（專利權）人： | 重慶醫科大學附屬兒童醫院 |
| 主分類號： | C12Q1/68 | 分類號： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京集佳知識產權代理有限公司 11227 | 代理人： | 趙青朵 |
| 地址： | 400014 *** | 國省代碼： | 重慶;85 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 特異性 結合 dock8 基因 片段 探針 檢測 突變 情況 試劑盒 方法 | ||
1.一種特異性結合DOCK8基因片段的探針，其特征在于，所述特異性結合DOCK8基因片段的探針的序列如SEQ ID NO：1所示。
2.一種檢測DOCK8突變情況的試劑盒，其特征在于，包括親和素標記的磁珠和如權利要求1所述的特異性結合DOCK8基因片段的探針。
3.根據權利要求2所述的探針，其特征在于，所述特異性結合DOCK8基因片段的探針采用生物素標記。
4.根據權利要求2所述的試劑盒，其特征在于，所述親和素為鏈霉親和素。
5.根據權利要求2所述的試劑盒，其特征在于，還包括DOCK8基因未突變的血液。
6.一種非診斷目的檢測DOCK8突變情況的方法，其特征在于，包括如下步驟：
取待測樣本，提取全基因組DNA，富集DOCK8基因片段；
對所述DOCK8基因片段測序，形成BAM文件；
對所述BAM文件進行數據分析，排除SNP，分析插入與缺失情況，檢測所述待測樣本的DOCK8突變情況；
所述待測樣本的DOCK8基因大片段的測序深度減少至50％，所述待測樣本的DOCK8突變情況為大片段雜合缺失；
所述待測樣本的DOCK8基因大片段的測序深度減少至0％～1％，所述待測樣本的DOCK8突變情況為大片段純合缺失；
所述待測樣本的DOCK8單個堿基的測序深度減少至50％，所述待測樣本的DOCK8突變情況為單個堿基雜合缺失；
所述待測樣本的DOCK8單個堿基的測序深度減少至0％～1％，所述待測樣本的DOCK8突變情況為單個堿基純合缺失；
所述待測樣本的DOCK8單個堿基發生改變，所述單個堿基的測序深度減少至50％，所述待測樣本的DOCK8突變情況為單個堿基雜合突變；
所述待測樣本的DOCK8單個堿基發生改變，所述單個堿基的測序深度減少至0％～1％，所述待測樣本的DOCK8突變情況為單個堿基純合突變。
7.根據權利要求6所述的方法，其特征在于，所述富集DOCK8基因片段具體為：取特異性結合DOCK8基因片段的探針與所述全基因組DNA雜交，再與親和素標記的磁珠結合，經洗提、擴增；
所述特異性結合DOCK8基因片段的探針如SEQ ID NO：1所示。
8.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，所述雜交的溫度為60～70℃，所述雜交的時間為20～24小時。
9.根據權利要求6所述的方法，其特征在于，所述測序采用的方法為二代測序技術。
10.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，所述特異性結合DOCK8基因片段的探針采用生物素標記。
11.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，所述親和素為鏈霉親和素。
12.根據權利要求6所述的方法，其特征在于，所述方法還包括：取DOCK8基因未突變的血液作為陽性對照，按照權利要求6所述的方法形成BAM文件，并對所述BAM文件進行數據分析，排除SNP。
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