[發明專利]口腔癌致病基因BPIFB2及其應用

有效

• 申請號: 201410315624.2
• 申請日: 2014-07-04
• 公開（公告）號: CN104059982A
• 公開（公告）日: 2014-09-24
• 發明（設計）人: 楊承剛;李紅偉;常鵬;孫錦云
• 申請（專利權）人: 楊承剛
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12Q1/06
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

技術領域

本發明涉及生物工程技術領域，具體地，本發明涉及通過高通量轉錄組測序分析篩選出口腔癌致病基因BPIFB2及所述致病基因在制備口腔癌輔助診斷或者預后制劑中的應用。

背景技術

口腔癌(Oral Squarmous Cell Carcinomas，OSCC)是人體常見的腫瘤之一，尤其是在發展中國家印度、斯里蘭卡、巴西等其發病率可以達到全部腫瘤的25％。近年來口腔癌的發病率在歐美等發達國家有明顯的上升趨勢，特別是發病年齡趨向年輕化。口腔鱗癌不僅發病率高，且惡性程度較高；往往造成語音、咀嚼、吞咽、面容等功能障礙和嚴重的面容毀損，并威脅到患者的生命；五年生存率只有60％左右。盡管近來口腔癌手術方法的不斷改進和放療、化療的廣泛應用，但口腔癌的五年生存率并沒有明顯的提高。

導致這一狀況的主要原因在于：口腔癌的發病機制不清，侵襲轉移機制不明，缺乏有效的早期預防和預后判斷手段。因此研究口腔癌發生和發展的分子機制，從中找到口腔癌早期預防、預后判斷和治療方法是口腔癌研究中急待解決的重大問題。

轉錄組學是研究活細胞在某一功能狀態下所含信使RNA(Messenger RNA，mRNA)的類型和拷貝數，反應了某一特定時間和空間細胞內所有基因的表達情況。轉錄組動態反應了細胞的生長發育狀態，不同生理、病理狀態下以及不同細胞類型都具有細胞特異的轉錄組，了解轉錄組是解讀細胞的分子功能、組成成分及其完成的生物過程所必需的，對我們理解生命體機體發育、疾病發生與預防都具有重要作用。

以Roche454，Illumina Solexa和ABI SOLiD為代表的第二代測序技術的出現，使得大規模應用基因組和轉錄組學方法解決科學問題成為可能。mRNA測序(mRNA sequencing，mRNA-Seq)是把mRNA逆轉錄生成的cDNA，利用第二代高通量測序技術進行cDNA測序，全面快速地獲取某一物種特定器官或組織樣本在某一狀態下幾乎所有轉錄本表達豐度的信息。各類型的轉錄本都可以采用同樣的原理用高通量測序技術進行深度測序，來反應它們的表達水平，統稱為RNA-Seq。伴隨著二代測序平臺的商業化，尤其是RNA-Seq技術的應用，上千萬甚至是上億的通量測序極大的提高了轉錄組測序的深度和覆蓋度，使得定性和定量分析轉錄組成為可能，推動了轉錄組學的快速發展。目前已廣泛應用到生物醫學的各個領域并取得突出進展，使我們對于疾病的分子與遺傳學基礎的認識達到了一個新的水平。這些研究成果對于闡明疾病的病因、解析疾病發生的分子機制、尋找疾病特異的生物標志物和藥物靶點，進而提升疾病的預防、診斷和治療水平具有重要意義。

發明人通過Illumina公司的HiSeq2500高通量測序平臺選取8例口腔癌癌變、癌旁及正常組織的轉錄組深度測序分析，初步篩選出影響口腔癌發生發展的相關基因BPIFB2，并進一步采用分子生物學方法證實了BPIFB2基因與口腔癌的關系：BPIFB2與口腔癌具有很好的相關性，可用于制備口腔癌輔助診斷或者預后制劑，具有重要的臨床應用價值。

發明內容

本發明目的是提供了口腔癌致病相關基因BPIFB2。

本發明目的是提供了一種檢測BPIFB2表達水平的熒光定量PCR試劑盒。

進一步，本發明還提供了一對檢測BPIFB2表達水平的熒光定量PCR引物。

進一步，本發明還提供了一種檢測BPIFB2表達水平的熒光定量PCR試劑盒使用方法。

本發明目的是提供BPIFB2基因在制備口腔癌的診斷或者預后產品中的應用。

為實現上述目的，本發明對癌變、癌旁及正常組織的三組樣品進行高通量cDNA測序，檢測到癌變與癌旁組織之間有252個差異表達基因，癌變與正常組織之間有234個差異表達基因，為了更好的理解差異表達基因的功能，發明人對表達失調的基因進行Gene Ontology的功能富集分析。最終從差異表達基因中篩選出BPIFB2。

本發明運用熒光定量PCR方法分析篩選到的口腔癌致病基因BPIFB2在口腔癌患病病人的腫瘤組織和癌旁組織的表達情況。