[發明專利]一種典型化合物對生物體膜作用表征參數的確定方法在審
| 申請號： | 201410315098.X | 申請日： | 2014-07-03 |
| 公開（公告）號： | CN104102827A | 公開（公告）日： | 2014-10-15 |
| 發明（設計）人： | 林志芬;王大力;王婷;鄭曉峰 | 申請（專利權）人： | 同濟大學 |
| 主分類號： | G06F19/00 | 分類號： | G06F19/00 |
| 代理公司： | 上海智信專利代理有限公司 31002 | 代理人： | 吳林松 |
| 地址： | 200092 *** | 國省代碼： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 典型 化合物 生物體 作用 表征 參數 確定 方法 | ||
1.一種典型化合物對生物體膜作用表征參數的確定方法，其特征在于：包括以下步驟：
(1)獲取典型化合物的結構；
(2)確定典型化合物與磷脂雙分子膜的相互結合能Ebinding；
(3)獲取典型化合物的正辛醇/水分配系數logKow，驗證Ebinding與logKow之間的線性相互關系。
2.根據權利要求1所述的確定方法，其特征在于：所述的典型化合物為任意非極性麻醉型化合物。
3.根據權利要求1所述的確定方法，其特征在于：所述的步驟(1)中，通過Chemoffice軟件獲取典型化合物的3D結構。
4.根據權利要求1所述的確定方法，其特征在于：所述的步驟(2)中，確定典型化合物與磷脂雙分子膜的相互結合能Ebinding，采用Discovery?Studio軟件計算獲得。
5.根據權利要求1或4所述的確定方法，其特征在于：典型化合物與磷脂雙分子膜的相互結合能Ebinding的計算方法，具體包括以下步驟：
(2.1)、選擇磷脂雙分子膜為受體，根據Discovery?Studio軟件內置的定義和編輯結合位點尋找結合區域；
(2.2)、進行典型化合物與磷脂雙分子膜的對接；
(2.3)、對接結束后，獲取典型化合物與磷脂雙分子膜的相互結合能Ebinding。
6.根據權利要求1所述的確定方法，其特征在于：所述的步驟(3)中，采用軟件EPISuiteTMv4.11，獲取所述典型化合物的正辛醇/水分配系數logKow；通過建立一元一次方程驗證Ebinding與logKow之間的線性相互關系。
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