[發明專利]一種確定混合物正辛醇/水分配系數的方法在審
| 申請號: | 201410315097.5 | 申請日: | 2014-07-03 |
| 公開(公告)號: | CN104102826A | 公開(公告)日: | 2014-10-15 |
| 發明(設計)人: | 林志芬;王婷;王大力;鄭曉峰 | 申請(專利權)人: | 同濟大學 |
| 主分類號: | G06F19/00 | 分類號: | G06F19/00 |
| 代理公司: | 上海智信專利代理有限公司 31002 | 代理人: | 吳林松 |
| 地址: | 200092 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 確定 混合物 辛醇 水分 系數 方法 | ||
1.一種確定混合物正辛醇/水分配系數的方法,其特征在于:包括以下步驟:
(1)、測定單一毒性數據和混合毒性數據;
(2)、獲取單一化合物與磷脂雙分子膜的相互作用能Ebinding;
(3)、建立混合毒性與Ebinding的二元一次方程;
(4)、建立Ebinding與單一化合物的正辛醇/水分配系數logKow的線性相關關系;
(5)、將步驟(4)中的線性相關關系帶入步驟(3)得出混合毒性與logKow的線性相關關系;
(6)、對比步驟(5)中的混合毒性與logKow的線性相關關系和QSAR模型log(1/EC50mix)=a?logKowmix+b,從而獲得混合正辛醇水分配系數logKowmix的改進方法,如方程(2)所示:
log(Kowmix-revised)=∑xilogKowi??????(2)
其中,logKowmix-revised是改進混合物正辛醇水分配系數;
(Kow)i是化合物i的正辛醇水分配系數;
xi是化合物i在混合物中的摩爾分數。
2.根據權利要1所述的方法,其特征在于:所述的步驟(1)中,單一毒性數據為單一化合物對發光菌的半數效應濃度EC50;混合毒性數據為混合物對發光菌的半數效應濃度EC50。
3.根據權利要1所述的方法,其特征在于:所述的步驟(2)獲取單一化合物與磷脂雙分子膜的相互作用能Ebinding,包括以下步驟:
(2.1)通過Chemoffice軟件獲得鹵代苯類、醇類、全氟羧酸的3D結構;
(2.2)獲取磷脂雙分子膜的3D結構;
(2.3)選擇磷脂雙分子膜為受體,根據Discovery?Studio軟件內置的定義和編輯結合位點命令尋找結合區域;
(2.4)采用Discovery?Studio中“CDOCKER”程序開展鹵代苯類、醇類、全氟羧酸小分子與磷脂雙分子膜受體的對接;
(2.5)對接結束后,Discovery?Studio軟件產生相應的報告顯示小分子與磷脂雙分子膜受體的相互結合能Ebinding。
4.根據權利要1所述的方法,其特征在于:所述的步驟(4)中,單一化合物的正辛醇/水分配系數logKow來自于軟件EPI?SuiteTMv4.11。
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