[發明專利]一種分離鑒定糖蛋白N-糖鏈結構的方法有效
| 申請號: | 201410291021.3 | 申請日: | 2014-06-24 |
| 公開(公告)號: | CN104133027A | 公開(公告)日: | 2014-11-05 |
| 發明(設計)人: | 關鋒;楊剛龍;譚增琦;李想;郭佳;龐星辰 | 申請(專利權)人: | 江南大學 |
| 主分類號: | G01N30/72 | 分類號: | G01N30/72;G01N30/08 |
| 代理公司: | 北京愛普納杰專利代理事務所(特殊普通合伙) 11419 | 代理人: | 何自剛;王玉松 |
| 地址: | 214122 江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 分離 鑒定 糖蛋白 鏈結 方法 | ||
1.一種分離鑒定糖蛋白N-糖鏈結構的方法,其特征在于,向變性蛋白中加入刀豆凝集素,使之與高甘露糖型N-糖基化蛋白相結合,然后加入糖肽酶F釋放全N-糖鏈,離心收集與ConA結合的非高甘露糖型N-糖鏈;再利用競爭性抑制將高甘露糖型N-糖鏈從ConA上競爭性洗脫下來并收集;最后,對收集的糖鏈進行除鹽純化處理、MALDI-TOF/TOF質譜解析。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,將樣品蛋白質加入到超濾管中,用二硫蘇糖醇及碘乙酰胺使之變性。
3.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述競爭性抑制劑是α-甲基-甘露糖。
4.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,包括以下步驟:(1)非高甘露糖型N-糖鏈的分離、富集:將蛋白加入超濾管中,采用尿素初步變性,然后通過二硫蘇糖醇及碘乙酰胺進一步使蛋白變性,向變性蛋白中加入ConA,使之與高甘露糖型N-糖基化蛋白相結合,然后加入糖肽酶F釋放全部的N-糖鏈,離心收集未與ConA結合的非高甘露糖型N-糖鏈;(2)高甘露糖型N-糖鏈的分離、富集:向仍與ConA結合并留在超濾管濾膜上的高甘露糖型N-糖鏈中添加α-甲基-甘露糖,將高甘露糖型N-糖鏈從ConA上競爭性替換下來,通過離心收集高甘露糖型N-糖鏈;(3)糖鏈的除鹽純化:利用Sepharose?4B對糖鏈進行純化;(4)MALDI-TOF/TOF質譜解析。
5.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,非高甘露糖型N-糖鏈的分離、富集采用如下具體步驟:
取1-2mg蛋白加入超濾管中,14000g離心濃縮至50μL,直接加300μL的8M尿素,充分混勻,14000g離心15min;再加入200μL8M尿素溶液至超濾管,14000g離心15min,棄去收集管中的流出液;
加入150μL的10mM?DTT充分混勻,56℃孵育45min,14000g離心10min,加入150μL20mM的IAM充分混勻,暗處孵育20min,14000g離心10min,棄去收集管中的流出液;加入150μL偶聯緩沖液至超濾管中,14000g離心10min,重復加入偶聯緩沖液并離心3次,棄去收集管中的流出液;所述偶聯緩沖液組成為:0.1mol/L?Tris-HCl、150mmol/L?NaCl、1mmol/L?CaCl2、1mmol/L?MgCl2、1mmol/L?MnCl2,pH7.4;
加入500μg?ConA于37℃靜置孵育3h,14000g離心10min,加入用150μL的40mMNH4HCO3至超濾管中,14000g離心10min重復加入NH4HCO3并離心3次,棄去收集管中的流出液,換新的收集管;加入用300μL的40mM?NH4HCO3溶解的PNGase?F充分混勻,37℃靜置孵育12h,14000g離心10min,加200μL超純水至超濾管中,14000g離心10min,重復加入超純水并離心一次,收集流出液,冷凍干燥得到非高甘露糖型N-糖鏈。
6.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,高甘露糖型N-糖鏈的分離、富集采用如下具體步驟:
向原超濾管中加入300μL0.5Mα-甲基-甘露糖洗脫液,于37℃靜置孵育3h,14000g離心10min,加200μL超純水至超濾管中,14000g離心10min,重復加入超純水并離心一次,收集流出液,冷凍干燥得到高甘露糖型N-糖鏈。
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