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[發明專利]蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法有效

專利信息
申請號: 201410247111.2 申請日: 2014-06-06
公開(公告)號: CN104120191A 公開(公告)日: 2014-10-29
發明(設計)人: 李云峰;蔡鵬;龍川鳳;趙亮;葛藤 申請(專利權)人: 李云峰
主分類號: C12Q1/70 分類號: C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93
代理公司: 大連科技專利代理有限責任公司 21119 代理人: 龍鋒
地址: 116001 遼*** 國省代碼: 遼寧;21
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 蟲媒病毒 芯片 三重 檢測 方法
【權利要求書】:

1.蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,包括如下步驟:

1)?設計引物并對下游引物進行生物素標記,在引物特異性驗證成功后,進行蟲媒病毒多重PCR擴增,其中所述蟲媒病毒為基孔肯雅病毒CHIKV、克里米亞-?剛果出血病毒CCHFV和裂谷熱病毒RVFV三種,其中多重PCR擴增反應體系為:?

反應條件為:95?℃,10?min;94?℃,30?s,55?℃,30?s,72?℃,30?s,35?cycles;72?℃,10?min;4℃,hold;所述混合引物為上下游引物的混合物,上下游引物的濃度比為1:1-1:8;反應體系中所述模板可以為模板1、2、3種的任意一種或任意兩種組合或三種;

2)?設計核酸探針并進行氨基化修飾,與熒光編碼微球偶聯制得微球混合液;

3)?設計偶聯質控探針并加入到步驟2)得到的微球混合液進行偶聯質量控制,所述偶聯質控探針序列與步驟2)所述核酸探針序列互補;

4)?將PCR產物與微球混合液進行雜交反應,同時加入用核酸檢測緩沖液稀釋的鏈霉素-藻紅蛋白,并通過液相芯片檢測儀對反應產物進行分析。

2.根據權利要求1所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,所述基孔肯雅病毒CHIKV、裂谷熱病毒RVFV和克里米亞-剛果出血熱CCHF的引物序列為:

3.根據權利要求1所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,所述上下游引物的濃度比為1:8。

4.根據權利要求1所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,所述核酸探針和偶聯質控探針的序列為:

5.根據權利要求4所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,所述序列中每個核酸探針的5端加10個poly(T),再加氨基修飾,并對偶聯質控探針的5端進行了生物素標記。

6.根據權利要求1所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,步驟2)所述偶聯微球混合液通過如下步驟制得:

1)?隨機選取帶有不同編號的羧基化微球并活化;

2)?向活化微球中各加入100?pmol/μL的氨基化修飾的核酸探針3-5?μL,瞬時震蕩;

3)?再各加3?μL核酸偶聯活化劑,即10?mg/mL?的EDC到上述微球中,瞬時震蕩;

4)?室溫避光孵育30-45min;

5)?向上述微球中各加200?μL核酸偶聯洗滌液A?,即0.02%?吐溫-20,全速震蕩5min;

6)?12,000×g?離心微球10min;

7)?棄上清,向上述微球中加入200μL核酸偶聯洗滌液B,即0.1%?SDS,全速震蕩5min;

8)?12,000×g?離心微球10min;

9)?棄上清,不要觸動沉淀;

10)?各加入100μL?核酸偶聯微球貯存液,全速震蕩或超聲波懸浮微球5min制得偶聯微球混合液。

7.根據權利要求1所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,步驟3)偶聯質量控制包括如下步驟:

1)?取偶聯混合微球5μL,加入到1.5?mL離心管中,并用核酸檢測緩沖液1,?即1.5×TMAC,稀釋至33μL;

2)?將偶聯質控探針稀釋至0.01μM的混合液,取7μL偶聯質控探針混合液,加入到含上述33μL微球混合液的1.5mL離心管中;

3)?然后用核酸檢測緩沖液2?,即1.0×TMAC,補足體積至50μL,52℃避光孵育15min;

4)?加入25μL?的10μg/mL?SAPE,混勻,52℃避光孵育5min,加入反應終止液50μL;

5)??液相芯片系統中進行測試,判斷標準:空白質控熒光信號中值小于100,偶聯質控熒光信號中值大于1000。

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