[發明專利]蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法有效
| 申請號: | 201410247111.2 | 申請日: | 2014-06-06 |
| 公開(公告)號: | CN104120191A | 公開(公告)日: | 2014-10-29 |
| 發明(設計)人: | 李云峰;蔡鵬;龍川鳳;趙亮;葛藤 | 申請(專利權)人: | 李云峰 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
| 代理公司: | 大連科技專利代理有限責任公司 21119 | 代理人: | 龍鋒 |
| 地址: | 116001 遼*** | 國省代碼: | 遼寧;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 蟲媒病毒 芯片 三重 檢測 方法 | ||
1.蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,包括如下步驟:
1)?設計引物并對下游引物進行生物素標記,在引物特異性驗證成功后,進行蟲媒病毒多重PCR擴增,其中所述蟲媒病毒為基孔肯雅病毒CHIKV、克里米亞-?剛果出血病毒CCHFV和裂谷熱病毒RVFV三種,其中多重PCR擴增反應體系為:?
反應條件為:95?℃,10?min;94?℃,30?s,55?℃,30?s,72?℃,30?s,35?cycles;72?℃,10?min;4℃,hold;所述混合引物為上下游引物的混合物,上下游引物的濃度比為1:1-1:8;反應體系中所述模板可以為模板1、2、3種的任意一種或任意兩種組合或三種;
2)?設計核酸探針并進行氨基化修飾,與熒光編碼微球偶聯制得微球混合液;
3)?設計偶聯質控探針并加入到步驟2)得到的微球混合液進行偶聯質量控制,所述偶聯質控探針序列與步驟2)所述核酸探針序列互補;
4)?將PCR產物與微球混合液進行雜交反應,同時加入用核酸檢測緩沖液稀釋的鏈霉素-藻紅蛋白,并通過液相芯片檢測儀對反應產物進行分析。
2.根據權利要求1所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,所述基孔肯雅病毒CHIKV、裂谷熱病毒RVFV和克里米亞-剛果出血熱CCHF的引物序列為:
。
3.根據權利要求1所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,所述上下游引物的濃度比為1:8。
4.根據權利要求1所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,所述核酸探針和偶聯質控探針的序列為:
。
5.根據權利要求4所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,所述序列中每個核酸探針的5’端加10個poly(T),再加氨基修飾,并對偶聯質控探針的5‘端進行了生物素標記。
6.根據權利要求1所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,步驟2)所述偶聯微球混合液通過如下步驟制得:
1)?隨機選取帶有不同編號的羧基化微球并活化;
2)?向活化微球中各加入100?pmol/μL的氨基化修飾的核酸探針3-5?μL,瞬時震蕩;
3)?再各加3?μL核酸偶聯活化劑,即10?mg/mL?的EDC到上述微球中,瞬時震蕩;
4)?室溫避光孵育30-45min;
5)?向上述微球中各加200?μL核酸偶聯洗滌液A?,即0.02%?吐溫-20,全速震蕩5min;
6)?12,000×g?離心微球10min;
7)?棄上清,向上述微球中加入200μL核酸偶聯洗滌液B,即0.1%?SDS,全速震蕩5min;
8)?12,000×g?離心微球10min;
9)?棄上清,不要觸動沉淀;
10)?各加入100μL?核酸偶聯微球貯存液,全速震蕩或超聲波懸浮微球5min制得偶聯微球混合液。
7.根據權利要求1所述的蟲媒病毒液相芯片三重檢測方法,其特征在于,步驟3)偶聯質量控制包括如下步驟:
1)?取偶聯混合微球5μL,加入到1.5?mL離心管中,并用核酸檢測緩沖液1,?即1.5×TMAC,稀釋至33μL;
2)?將偶聯質控探針稀釋至0.01μM的混合液,取7μL偶聯質控探針混合液,加入到含上述33μL微球混合液的1.5mL離心管中;
3)?然后用核酸檢測緩沖液2?,即1.0×TMAC,補足體積至50μL,52℃避光孵育15min;
4)?加入25μL?的10μg/mL?SAPE,混勻,52℃避光孵育5min,加入反應終止液50μL;
5)??液相芯片系統中進行測試,判斷標準:空白質控熒光信號中值小于100,偶聯質控熒光信號中值大于1000。
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