[發明專利]鑒定待測品種是否為中棉所63的方法及其專用引物組

有效

• 申請號: 201410245213.0
• 申請日: 2014-06-04
• 公開（公告）號: CN104004845A
• 公開（公告）日: 2014-08-27
• 發明（設計）人: 付小瓊;葉武威;楊付新;黃殿成
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院棉花研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢

1.一種鑒定或輔助鑒定待測棉花是否為中棉所63的方法，包括如下步驟：

以待測棉花的基因組DNA為模板，分別采用CIR62引物對、CS62引物對、NAU1070引物對、NAU1102引物對、NAU1186引物對、NAU2026引物對、NAU2173引物對、NAU2277引物對、NAU2343引物對、NAU1196引物對、NAU1085引物對、NAU1255引物對、NAU1369引物對、NAU1233引物對、NAU1269引物對、NAU2272引物對、NAU1187引物對、NAU1375引物對、CS51引物對、NAU1028引物對、NAU2342引物對、NAU868引物對、HAU1300引物對、NAU6094引物對、DPL0238引物對、NAU1362引物對、NAU859引物對、HAU2786引物對、CGR6410引物對和NAU0478引物對進行PCR擴增，如果PCR擴增產物滿足標準1)至標準30)中的28條以上，待測棉花為中棉所63或待測棉花為候選的中棉所63；

所述CIR62引物對由序列表的序列1所示的單鏈DNA分子和序列表的序列2所示的單鏈DNA分子組成；所述CS62引物對由序列表的序列3所示的單鏈DNA分子和序列表的序列4所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1070引物對由序列表的序列5所示的單鏈DNA分子和序列表的序列6所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1102引物對由序列表的序列7所示的單鏈DNA分子和序列表的序列8所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1186引物對由序列表的序列9所示的單鏈DNA分子和序列表的序列10所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU2026引物對由序列表的序列11所示的單鏈DNA分子和序列表的序列12所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU2173引物對由序列表的序列13所示的單鏈DNA分子和序列表的序列14所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU2277引物對由序列表的序列15所示的單鏈DNA分子和序列表的序列16所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU2343引物對由序列表的序列17所示的單鏈DNA分子和序列表的序列18所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1196引物對由序列表的序列19所示的單鏈DNA分子和序列表的序列20所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1085引物對由序列表的序列21所示的單鏈DNA分子和序列表的序列22所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1255引物對由序列表的序列23所示的單鏈DNA分子和序列表的序列24所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1369引物對由序列表的序列25所示的單鏈DNA分子和序列表的序列26所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1233引物對由序列表的序列27所示的單鏈DNA分子和序列表的序列28所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1269引物對由序列表的序列29所示的單鏈DNA分子和序列表的序列30所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU2272引物對由序列表的序列31所示的單鏈DNA分子和序列表的序列32所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1187引物對由序列表的序列33所示的單鏈DNA分子和序列表的序列34所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1375引物對由序列表的序列35所示的單鏈DNA分子和序列表的序列36所示的單鏈DNA分子組成；所述CS51引物對由序列表的序列37所示的單鏈DNA分子和序列表的序列38所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1028引物對由序列表的序列39所示的單鏈DNA分子和序列表的序列40所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU2342引物對由序列表的序列41所示的單鏈DNA分子和序列表的序列42所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU868引物對由序列表的序列43所示的單鏈DNA分子和序列表的序列44所示的單鏈DNA分子組成；所述HAU1300引物對由序列表的序列45所示的單鏈DNA分子和序列表的序列46所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU6094引物對由序列表的序列47所示的單鏈DNA分子和序列表的序列48所示的單鏈DNA分子組成；所述DPL0238引物對由序列表的序列49所示的單鏈DNA分子和序列表的序列50所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU1362引物對由序列表的序列51所示的單鏈DNA分子和序列表的序列52所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU859引物對由序列表的序列53所示的單鏈DNA分子和序列表的序列54所示的單鏈DNA分子組成；所述HAU2786引物對由序列表的序列55所示的單鏈DNA分子和序列表的序列56所示的單鏈DNA分子組成；所述CGR6410引物對由序列表的序列57所示的單鏈DNA分子和序列表的序列58所示的單鏈DNA分子組成；所述NAU0478引物對由序列表的序列59所示的單鏈DNA分子和序列表的序列60所示的單鏈DNA分子組成；

標準1)：采用所述CIR062引物對時，滿足如下帶型：在500bp和400bp之間具有2條帶、在200bp和150bp之間具有2條帶；

標準2)：采用所述CS62引物對時，滿足如下帶型：大于500bp具有2條帶、在500bp和400bp之間具有2條帶、在150-250bp之間具有3條帶；

標準3)：采用所述NAU1070引物對時，滿足如下帶型：在250bp和200bp之間具有2條帶、在200bp和150bp之間具有1條帶；

標準4)：采用所述NAU1102引物對時，滿足如下帶型：大于500bp具有2條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準5)：采用所述NAU1186引物對時，滿足如下帶型：在500bp和400bp之間具有2條帶、在200bp和150bp之間具有2條帶；

標準6)：采用所述NAU2026引物對時，滿足如下帶型：在400bp以上具有5條帶、在400bp和300bp之間具有1條帶、在200bp和150bp之間具有3條帶；

標準7)：采用所述NAU2173引物對時，滿足如下帶型：在250bp和200bp之間具有3條帶；

標準8)：采用所述NAU2277引物對時，滿足如下帶型：在250bp和200bp之間具有1條帶、在150bp和100bp之間具有1條帶；

標準9)：采用所述NAU2343引物對時，滿足如下帶型：在400bp和300bp之間具有1條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準10)：采用所述NAU1196引物對時，滿足如下帶型：在400bp和250bp之間具有4條帶、在200bp和150bp之間具有2條帶；

標準11)：采用所述NAU1085引物對時，滿足如下帶型：在500bp和400bp之間具有2條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準12)：采用所述NAU1255引物對時，滿足如下帶型：在500bp和400bp之間具有1條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準13)：采用所述NAU1369引物對時，滿足如下帶型：在400bp以上具有5條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準14)：采用所述NAU1233引物對時，滿足如下帶型：大于500bp具有2條帶、在300bp和250bp之間具有2條帶；

標準15)：采用所述NAU1269引物對時，滿足如下帶型：在500bp和400bp之間具有1條帶、在150bp以下具有2條帶；

標準16)：采用所述NAU2272引物對時，滿足如下帶型：在500bp以上具有1條帶、在500bp和400bp之間具有1條帶、在200bp和150bp之間具有1條帶；

標準17)：采用所述NAU1187引物對時，滿足如下帶型：在500bp以上具有1條帶、在200bp和150bp之間具有2條帶；

標準18)：采用所述NAU1375引物對時，滿足如下帶型：在500bp以上具有1條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準19)：采用所述CS51引物對時，滿足如下帶型：在500bp以上具有1條帶、在200bp和150bp之間具有2條帶；

標準20)：采用所述NAU1028引物對時，滿足如下帶型：在500bp以上具有2條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準21)：采用所述NAU2342引物對時，滿足如下帶型：在500bp和400bp之間具有1條帶、在300bp和250bp之間具有1條帶、在200bp和150bp之間具有2條帶；

標準22)：采用所述NAU868引物對時，滿足如下帶型：在500bp以上具有1條帶、在500bp和400bp之間具有1條帶、在250bp和200bp之間具有1條帶、在200bp和150bp之間具有上1條帶；

標準23)：采用所述HAU1300引物對時，滿足如下帶型：在400bp以上具有4條帶、在250bp和200bp之間具有3條帶；

標準24)：采用所述NAU6094引物對時，滿足如下帶型：在400bp以上具有4條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶、在200bp和150bp之間具有2條帶；

標準25)：采用所述DPL0238引物對時，滿足如下帶型：在500bp以上具有4條帶、在500bp和400bp之間具有2條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準26)：采用所述NAU1362引物對時，滿足如下帶型：在500bp以上具有2條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準27)：采用所述NAU859引物對時，滿足如下帶型：在500bp以上具有2條帶、在400bp和300bp之間具有2條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準28)：采用所述HAU2786引物對時，滿足如下帶型：在500bp以上具有2條帶、在500bp和400bp之間具有1條帶、在400bp和300bp之間具有1條帶、在250bp和200bp之間具有2條帶；

標準29)：采用所述CGR6410引物對時，滿足如下帶型：在300bp和150bp之間具有5條帶、在150bp和100bp之間具有3條帶；

標準30)：采用所述NAU0478引物對時，滿足如下帶型：在250bp和150bp之間具有4條帶、在150bp和100bp之間具有3條帶。