[發明專利]一種胃癌的唾液蛋白診斷模型及其建立方法

無效

• 申請號: 201410233882.6
• 申請日: 2014-05-29
• 公開（公告）號: CN104007169A
• 公開（公告）日: 2014-08-27
• 發明（設計）人: 吳正治;孫珂煥;曹美群
• 申請（專利權）人: 深圳市第二人民醫院
• 主分類號: G01N27/64
• 分類號: G01N27/64;G01N1/28
• 代理公司: 北京科億知識產權代理事務所(普通合伙) 11350
• 代理人: 湯東鳳

1.一種胃癌的唾液蛋白診斷模型的建立方法，其特征在于，該胃癌的唾液蛋白診斷模型的建立方法包括以下步驟：

步驟一，唾液標本的收集和處理；

步驟二，采用WCX磁珠處理唾液樣品，加入穩定緩沖液的洗脫液可以用來直接質譜分析；

步驟三，點樣及質譜分析：將磁珠處理好的多肽樣品溶液各取分別點靶，室溫下干燥后，再各點基質溶液，然后將制備好的點樣板置于MALDI-TOF質譜儀上進行分析；

步驟四，數據統計學分析：用FlexAnalysis3.0軟件進行標峰和校正峰，用軟件ClinProTools2.1中的統計學檢驗方法尋找差異蛋白，分析有差異趨勢的多肽，并利用軟件中的遺傳算法結合KNN建立分類預測模型；

建立分類預測模型的方法為：

首先使用遺傳算法，設變異率為0.2，交叉率為0.5，初始染色體個數為1000，適應度函數用KNN判定結果的準確率，最終經過10000次進化，遍歷k，最終在差異蛋白中，選用了幾個蛋白峰，建立模型，計算模型的特異性、敏感性及平均準確率用隨機抽樣方法，隨機選擇80％樣本建立模型，其余的20％作為驗證樣本，運行十次，驗證模型的有效性，平均特異性、靈敏性及平均正確率。

2.一種胃癌的唾液蛋白診斷模型，其特征在于，該胃癌的唾液蛋白診斷模型由人唾液蛋白中質荷比(m/z)分別為1472.78Da、2936.49Da、6556.81Da和7081.17Da的4個唾液蛋白峰組成。