[發明專利]一種基于胃液多重實時PCR檢測的幽門螺桿菌(HP)個體化治療輔助診斷方法在審
| 申請號: | 201410131307.5 | 申請日: | 2014-04-02 |
| 公開(公告)號: | CN103911446A | 公開(公告)日: | 2014-07-09 |
| 發明(設計)人: | 張建中;彭賢惠;劉杰;何利華;趙飛;閆笑梅;張茂俊;張慧芳 | 申請(專利權)人: | 中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/01 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產權代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君 |
| 地址: | 102206 北京*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 胃液 多重 實時 pcr 檢測 幽門 螺桿 hp 個體化 治療 輔助 診斷 方法 | ||
1.一種基于胃液的幽門螺桿菌個體化治療多重實時PCR檢測方法所用的引物和探針組合,其特征在于,
2.包含權利要求1所述的引物和探針的試劑盒。
3.權利要求2所述的試劑盒,其特征在于,
其中,胃液預處理方法包括將新鮮(或融化的凍存)的胃液標本進行渦旋震蕩至均勻,取出10-500μl胃液標本,加入等量的Tris緩沖液(0.67M,pH7.4),振蕩均勻,室溫放置2h。13000rpm離心5min,棄上清留沉淀。
4.前述任一項權利要求所述的試劑盒,其特征在于,所述的Tris緩沖液(0.67M,pH7.4)的配制方法如下:取81.16g?Tris至800ml?ddH2O中,滴加濃鹽酸至pH7.4,加入ddH2O定容至1L。
5.前述任一項權利要求所述的試劑盒,其特征在于,
還包括在每一反應體系中提供相應的陽性對照和陰性對照。
6.前述任一項權利要求所述的試劑盒,其特征在于,
陽性對照、陰性對照包括九種陽性對照和一種大腸桿菌陰性對照,其中九種陽性對照分別為含有cag?H、RNase?P、HP23S?rDNA-AA、HP23S?rDNA-GA、HP23S?rDNA-AG、CYP2C19-2A、CYP2C19-2G、CYP2C19-3A、CYP2C19-3G目的基因的質粒。
7.前述任一項權利要求所述的試劑盒,對照濃度均為1×106copies/μl。
8.前述任一項權利要求所述的試劑盒,其特征在于,
當多重實時PCR擴增反應體系為20μl反應體系時,其優選配置為:
9.前述任一項權利要求所述的試劑盒,其特征在于,
多重實時PCR反應程序為:95℃10min;95℃10s,58℃45s,45個循環,讀板。
10.前述任一項權利要求所述的試劑盒,其特征在于,
對有效擴增的情況下,樣品檢測結果可信,否則試驗需要重復;在檢測中的陽性對照為有效擴增時,樣本結果判斷標準如下:
(1).組合①中綠色曲線起峰,表示DNA標本提取正確,在此基礎上,其他結果判定有效;如果沒有綠色曲線擴增,表示DNA提取失敗,其他結果均不可信;
(2).組合①中藍色曲線起峰,表示有HP感染,Ct值應小于38;
(3).組合②中藍色曲線起峰,表示HP23S?rRNA基因為野生型;
(4).組合②中綠色曲線起峰,表示HP23S?rRNA基因為A2143G或A2142G突變型;
(5).組合②中藍色和綠色曲線起峰,表示患者被兩株(或三株)HP感染,一株為HP23S?rRNA基因野生型,一株為突變型;
(6).組合①中綠色曲線,而組合②中藍色或綠色曲線起峰,Ct值小于38表示被cagH缺失的HP感染;
(7).組合③中藍色曲線先起峰表示CYP2C19*3為G型;綠色起峰,表示CYP2C19*3為A型;
(8).組合④中藍色曲線先起峰表示CYP2C19*2為G型;綠色起峰,表示CYP2C19*2為A型。
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