[發(fā)明專利]大腸桿菌O157:H7的LAMP檢測引物及檢測試劑盒有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410130191.3 | 申請日: | 2014-04-02 |
| 公開(公告)號: | CN103866030A | 公開(公告)日: | 2014-06-18 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 張雪寒;汪偉;何孔旺;倪艷秀;溫立斌;李彬;周俊明;王小敏 | 申請(專利權(quán))人: | 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/19 |
| 代理公司: | 南京經(jīng)緯專利商標(biāo)代理有限公司 32200 | 代理人: | 張素卿 |
| 地址: | 210014*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 大腸桿菌 o157 h7 lamp 檢測 引物 試劑盒 | ||
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一、技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及檢測大腸桿菌O157:H7的LAMP引物及檢測試劑盒,屬于生物和食品檢測領(lǐng)域。
二、背景技術(shù)
大腸桿菌(Escherichia?coli,?E.coli)O157:H7是重要的食源性病原菌,能夠在全世界范圍內(nèi)引起動物、家禽和人類爆發(fā)感染,不僅關(guān)乎食品安全,而且與醫(yī)療和公共衛(wèi)生問題密切相關(guān)。
現(xiàn)如今,許多報(bào)道嘗試研制更特異的方法檢測E.coli?O157:H7。傳統(tǒng)的培養(yǎng)鑒定技術(shù)使用選擇性培養(yǎng)基或者顯色平板檢測E.coli?O157:H7,但是這種方法費(fèi)時,費(fèi)力,準(zhǔn)確性差。?PCR技術(shù)和定量PCR檢測技術(shù)已經(jīng)被廣泛應(yīng)用各檢測領(lǐng)域,發(fā)揮著不可忽視的作用,但對儀器設(shè)備等要求較高,不適合快速和臨床樣品的檢測。我們前期研究工作中,通過對已有E.coli?O157:H7全基因組序列生物信息學(xué),比對分析,發(fā)現(xiàn)新的閱讀框編碼鞭毛類基因,它唯一的存在于E.coli?O157:H7基因組中,為適應(yīng)更廣泛領(lǐng)域檢測的需要,有必要建立新型的檢測技術(shù)。
環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)是由日本學(xué)者T.Notomi發(fā)明的一種新型核酸擴(kuò)增技術(shù)。該技術(shù)依賴于4條特異設(shè)計(jì)的引物和一種具有鏈置換特性的DNA聚合酶,在等溫條件下可以高效、高特異性地?cái)U(kuò)增靶序列。近年來,國內(nèi)外已經(jīng)將該技術(shù)廣泛應(yīng)用于病原檢測,如LAMP可以檢測多種病原菌,例如沙門氏桿菌、李氏桿菌、大腸桿菌等。目前未見能夠特異性和專一性檢測大腸桿菌O157:H7?LAMP的報(bào)道。
本發(fā)明的大腸桿菌O157:H7?LAMP檢測技術(shù)避免了現(xiàn)有檢測手段存在的某些問題,相比較其他檢測手段,建立的大腸桿菌O157:H7?LAMP方法具有敏感性高、特異性強(qiáng)、檢測周期短、操作簡單方便的特點(diǎn)。
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三、發(fā)現(xiàn)內(nèi)容
技術(shù)問題??本發(fā)明目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的不足,提供一種特異性檢測大腸桿菌O157:H7?LAMP檢測試劑盒及其檢測方法。本發(fā)明的試劑盒使用方便,結(jié)果鑒定直觀,檢測敏感性和特異性高,并且易于大范圍推廣使用。
技術(shù)方案??
本發(fā)明是通過以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的。
本發(fā)明設(shè)計(jì)一種大腸桿菌O157:H7?LAMP檢測試劑盒,該試劑盒包括以下4條引物,所述引物序列分別如SEQ?ID?NO.1、SEQ?ID?NO.2、SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.4所示。
所述試劑盒包括反應(yīng)液A和SYBR?Green?I,所述反應(yīng)液A具體包括:每23?uL的反應(yīng)體系包括10×ThermoPol?Reaction?Buffer(美國NEB公司)2.5?uL、2.5mM?dNTPs?2?uL、1M?的Mg2SO4?4?uL、8U/?uL?Bst?DNA酶(美國NEB公司)?1?uL、超純水12.5?uL,以及如下的引物:
5?μM堿基序列如SEQ?ID?NO.1?和SEQ?ID?NO.2所示的引物各0.25?uL,50?μM堿基序列如SEQ?ID?NO.3?和SEQ?ID?NO.4所示的引物各0.25?uL。
本發(fā)明還涉及一種利用所述大腸桿菌O157:H7?LAMP檢測試劑盒的檢測方法,包括以下步驟:
(1)待檢模板的制備:
糞便或者食物10克,加入到90mL磷酸鹽緩沖液中,37℃震蕩2h后,取1mL加入到9mL心腦浸出液培養(yǎng)基中;如果待檢樣品為液體,則直接取1mL加入到9mL心腦浸出液培養(yǎng)基中;培養(yǎng)基中再加入100?uL?濃度為50mg/mL新生霉素,37℃繼續(xù)培養(yǎng)18h,吸取1mL培養(yǎng)物,500?r離心15min,棄沉淀,吸取上清至新離心管,12000r離心10min,棄上清,取沉淀重懸于1/10體積雙蒸水中,沸水浴10min,4℃12000轉(zhuǎn)離心10min,吸取上清,即待檢模板DNA。
(2)取2?uL提取的待檢模板加入到所述的反應(yīng)液A中,終體積為25?uL,混勻,置于64℃恒溫50?min進(jìn)行LAMP擴(kuò)增;
(3)結(jié)果判定:取出上述擴(kuò)增反應(yīng)管,在其中加入1?uL20×SYBR?Green?I,如反應(yīng)管中液體變?yōu)榫G色,則說明樣品中含有大腸桿菌O157:H7;如果顏色為橘黃色,則說明樣品中不含有大腸桿菌O157:H7。
有益效果??
與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的有益效果如下:?
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