[發明專利]一種流式細胞儀數據自動分析方法有效
| 申請號: | 201410129562.6 | 申請日: | 2014-03-31 |
| 公開(公告)號: | CN103942415B | 公開(公告)日: | 2017-10-31 |
| 發明(設計)人: | 王先文;程智;陳鋒;杜耀華;暴洪濤;李辰宇;吳太虎 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍軍事醫學科學院衛生裝備研究所 |
| 主分類號: | G06F19/00 | 分類號: | G06F19/00;G01N35/00;G01N15/10 |
| 代理公司: | 天津市北洋有限責任專利代理事務所12201 | 代理人: | 張金亭 |
| 地址: | 300161 *** | 國省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 細胞 數據 自動 分析 方法 | ||
1.一種流式細胞儀數據自動分析方法,其特征在于,包括以下步驟:
一)采用BIC方法對數據進行自動類群識別,得到數據中包含的類群數目;
二)獲得類群數目后,采用偏斜t混合模型對數據進行自動聚類;
以上步驟一)中所采用的自動類群識別過程為:
BIC=-2log L+k log n
其中:
L是偏斜t混合模型極大似然估計的對數似然值;
k是混合模型的獨立參數;
n是數據中被測樣本的粒子總數。
2.根據權利要求1所述的流式細胞儀數據自動分析方法,其特征在于,所述步驟二)采用的偏斜t混合模型為:
其中:
x為流式細胞儀數據;
g為類群數目;
πi為混合比,表示第i個分量密度在混合密度中的加權因子;
μ,Ω,δ,v為偏斜t分布的密度參數,其中,μ為位置參數,δ為偏斜參數向量,且滿足∑=Ω+δδT;
tp,v(x)為位置參數為μ,尺度矩陣為∑,自由度為v的p維t分布的概率密度函數;
T1,v+p(x)為位置參數為μ,尺度矩陣為∑,自由度為v+p的一維t分布的累積分布函數。
3.根據權利要求2所述的流式細胞儀數據自動分析方法,其特征在于,所述偏斜t混合模型首先采用多維流式細胞儀數據x中的兩個維度作為偏斜t混合模型的輸入進行聚類分析,再將該兩維聚類分析結果投影到該數據x中的剩余其它二個維度中去,繼續采用兩維聚類分析方法進行分析,直到得到該數據x的聚類結果。
4.根據權利要求2所述的流式細胞儀數據自動分析方法,其特征在于,所述偏斜t 混合模型以流式細胞儀數據x作為偏斜t混合模型的輸入,采用多維數據直接聚類的方法對數據進行聚類分析。
5.根據權利要求2所述的流式細胞儀數據自動分析方法,其特征在于,所述偏斜t混合模型中參數的估算方法:
引入向量zj=(z1j,…zgj)T,變量u1,…,un和w1,…,wn,其滿足
其中,xj表示第j個數據x,HN(0,σ2)為均值為0,方差為σ2的一元半正態分布,gamma(α,β)為形狀參數為α,尺度參數為β的伽馬分布;得到包含變量zij、uj、wj的對數似然函數為Lc(Ψ):
其中,
6.根據權利要求5所述的流式細胞儀數據自動分析方法,其特征在于,采用兩步迭代法求解所述偏斜t混合模型中參數,包括以下步驟:
一)根據已知的流式細胞儀數據值,代入似然函數中,以參數作為未知變量,求取似然函數值;其具體實施過程為:
其中E表示期望;
二)根據使似然函數滿足極大值的方法,估計未知參數值,其具體過程為:
其中,k表示迭代序號,分別表示第k次迭代時πi、μi、Ωi、δi的值,為伽馬函數的導數。
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