[發明專利]蛋白質信號轉導子網的預測方法和裝置

有效

• 申請號: 201410102941.6
• 申請日: 2014-03-19
• 公開（公告）號: CN103870720B
• 公開（公告）日: 2017-02-08
• 發明（設計）人: 劉偉;謝紅衛
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍國防科學技術大學
• 主分類號: G06F19/12
• 分類號: G06F19/12
• 代理公司: 長沙智嶸專利代理事務所43211
• 代理人: 黃子平

1.一種蛋白質信號轉導子網的預測方法，其特征在于，包括：

建立步驟：建立信號轉導網絡，其中，一種蛋白質為所述信號轉導網絡的一個節點，具有通信關系的兩種蛋白質之間的通道為所述信號轉導網絡的一條邊；

第一計算步驟：計算所述信號轉導網絡中每個節點和每條邊的分值；

第一獲取步驟：獲取所述信號轉導網絡中的目標節點及多個第一目標信號子網，其中，所述目標節點為所述信號轉導網絡中節點分值最高的節點，所述第一目標信號子網為所述信號轉導網絡中與所述目標節點連通的信號子網；

第二計算步驟：計算每個所述第一目標信號子網的子網分值和顯著性概率值；

第二獲取步驟：獲取所述第一目標信號子網中的多個第二目標信號子網，其中，所述第二目標信號子網為所述顯著性概率值小于預設值的所述第一目標信號子網；以及

確定步驟：確定多個所述第二目標信號子網中子網分值最高的所述第二目標信號子網為所述信號轉導子網。

2.根據權利要求1所述的預測方法，其特征在于，采用以下方式計算每個節點的分值：

獲取節點i對應的蛋白質的實際豐度比和預設豐度比，其中，所述節點i為所述信號轉導網絡中的任一節點；以及

根據所述節點i對應的實際豐度比和所述目標節點對應預設豐度比，計算所述節點i的分值。

3.根據權利要求2所述的預測方法，其特征在于，根據所述實際豐度比和所述預設豐度比，計算所述節點i的分值包括：

按照公式Ei=Σk=1mxikΣj=1lwijEi′=Ei-EminEmax-EminEmin=min{E1,E2,L,EN}Emax=max{E1,E2,L,EN}]]>計算所述節點i的分值，

其中，E_i′為所述節點i的分值，x_ik為所述節點i對應的蛋白質在第k個實際樣本中的實際豐度比，w_ij為所述節點i對應的蛋白質在第j個對照樣本中的對照豐度比，m為所述實際樣本的樣本數，l為所述對照樣本的樣本數。