[發明專利]黃麻表達序列標簽微衛星DNA標記

有效

• 申請號: 201410088219.1
• 申請日: 2014-03-12
• 公開（公告）號: CN103937786A
• 公開（公告）日: 2014-07-23
• 發明（設計）人: 張立武;祁建民;徐建堂;陶愛芬;林荔輝;方平平;林培清;吳建梅
• 申請（專利權）人: 福建農林大學
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 福州元創專利商標代理有限公司 35100
• 代理人: 蔡學俊

技術領域

?本發明涉及一種分子標記技術，具體涉及一種黃麻表達序列標簽微衛星DNA分子標記。

背景技術

微衛星（又稱為簡單重復序列，SSR）是由1-6個核苷酸組成的短序列串聯重復多次而組成的一段DNA；其中，最常見的是二核苷酸和三核苷酸重復單元，如(CT)n，(AT)n，(ACC)n、(CGA)n和(AGA)n。由于微衛星側翼序列相對保守，根據其側翼序列設計引物，可用PCR?擴增出微衛星位點的序列。由于微衛星中重復單元的重復次數不同，因而擴增出的微衛星序列的長度呈現多態性。微衛星序列廣泛存在于真核生物基因組中，而且隨機分布，具有多態性較高，重復性和穩定性好等特點，是十分有效的分子標記，被廣泛應用于遺傳圖譜構建、基因定位、遺傳關系分析、品種鑒定等領域。如用微衛星標記分析黃麻的起源演化關系?(Kundu?等，2013，Journal?of?Plant?Biochemistry?and?Biotechnology，22?：?372-381)、用微衛星?DNA?標記進行豬品種分類的專利申請“適于豬品種分類的豬微衛星DNA標記”（公開號CN1370834A）。

黃麻是椴樹科(Tiliaceae)黃麻屬(Corchorus)一年生草本植物，是重要韌皮纖維作物。在世界上黃麻產量與種植面積僅次于棉花，主要在亞洲(印度、孟加拉、中國和泰國)和拉丁美洲種植。生產上栽培的有長果種(Corchorus?olitorius?L.)和圓果種(Corchorus?capsularis?L.)，染色體數均為2n=2X=14。黃麻纖維細軟、強力大、吸濕性好、散水快，可紡性好，用途十分廣闊。

至今在黃麻基因組中已找到的近1000個微衛星標記，與此同時，黃麻微衛星DNA在基因定位和遺傳多樣性分析中的應用也迅速鋪開，有關黃麻微衛星標記的專利爭奪正逐步展開。但是，我國黃麻微衛星的研究仍十分有限，僅極少數實驗室開始了有關工作。鑒于黃麻微衛星數目多，還有大量的未被發現，且它們具有重要的理論和應用價值，特別是GenBank公共數據庫中還可能存在大量的微衛星位點。因此，在我國開展黃麻的微衛星的分離、鑒定和應用研究，開發具有我國知識產權的微衛星標記顯得十分迫切和必要。

發明內容

?本發明的目的在于：分離和鑒定黃麻表達序列標簽微衛星DNA標記，建立黃麻微衛星DNA的技術體系并利用這些分子標記進行黃麻遺傳多樣性分析。

本發明實現的技術方案：

所述黃麻微衛星DNA標記編號CcSSR001-CcSSR045、CoSSR046-CoSSR066，所對應的黃麻微衛星DNA標記引物序列為SEQ?ID?NO.1-132所示。

所述黃麻微衛星DNA標記編號CcSSR001-CcSSR045為圓果種黃麻EST-SSR，CoSSR046-CoSSR066為長果種黃麻EST-SSR。