[發明專利]一種5′端tRNA半分子檢測方法有效
| 申請號: | 201410072557.6 | 申請日: | 2014-03-03 |
| 公開(公告)號: | CN103789447B | 公開(公告)日: | 2017-01-25 |
| 發明(設計)人: | 鄭曉飛;付漢江;劉荻 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍軍事醫學科學院放射與輻射醫學研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
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| 地址: | 10085*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 trna 分子 檢測 方法 | ||
1.一種5′端tRNA半分子檢測方法,該檢測方法的特征在于其是基于分離純化的細胞和組織總RNA,經多核苷酸聚合酶在RNA分子3′端進行Poly(A)加尾,再與DNA探針雜交,后經RNase?H消化與DNA探針互補的RNA序列,再由oligo(dT)12-30-錨定引物進行反轉錄獲得cDNA,以5′端tRNA半分子和錨定引物的序列為PCR反應的上下游引物,擴增檢測5′端tRNA半分子。
2.權利要求1中所述方法包括五個主要步驟:(1)tRNA半分子的poly(A)加尾;(2)DNA探針與tRNA分子雜交;(3)RNase?H消化與DNA探針雜交的tRNA序列;(4)反轉錄反應;(5)PCR擴增反應。
3.權利要求1中所述的DNA探針的特征在于長度為13-30個堿基的與待檢測的tRNA分子的3′端序列互補的寡聚DNA分子,其3′端的羥基被修飾,修飾基團可以是磷酸基團或甲氧基等。
4.權利要求1中所述的反轉錄反應所用引物的特征在于反轉錄oligo(dT)12-30-錨定引物長度為40-60nt,5′端為20-30nt的錨定序列,3′端為12-30nt的dT,在3′末端加上兩個堿基的(A、G或C)/(A、G、C或T),最后兩個堿基起錨定作用。
5.權利要求1中所述的PCR擴增引物特征在于上游引物是待檢測5′端tRNA半分子序列的寡聚DNA片段,下游引物是與反轉錄引物的錨定引物片段序列相同的寡聚DNA片段。
6.權利要求1中所述的5′端tRNA半分子檢測反應中所使用的PCR擴增引物可以進行包括熒光分子、生物素和地高辛等分子的修飾。
7.權利要求1中所述的PCR反應體系中可以加入熒光染料或分子信標進行實時定量PCR反應。
8.權利要求1-7中所述的檢測方法在5′端tRNA半分子檢測分析中的應用。
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