[發(fā)明專利]一種利用InDel分子標(biāo)記預(yù)測秈-粳稻雜種F1結(jié)實率的方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201410034373.0
• 申請日: 2014-01-24
• 公開（公告）號: CN103798127A
• 公開（公告）日: 2014-05-21
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 盧寶榮;劉蘋;蔡星星
• 申請（專利權(quán)）人: 復(fù)旦大學(xué)
• 主分類號: A01H1/02
• 分類號: A01H1/02;A01G16/00;C12Q1/68
• 代理公司: 上海正旦專利代理有限公司 31200
• 代理人: 陸飛;盛志范

1.?一種利用InDel分子標(biāo)記確定秈-粳稻雜種F₁結(jié)實率的方法，其特征在于具體步驟為：

（1）選擇包含典型秈稻、典型粳稻和秈-粳分化中間類型，且結(jié)實率大于90%的水稻品種作為實驗群體，并利用40個InDel分子標(biāo)記確定兩兩水稻品種間的秈-粳遺傳分化系數(shù)GDI；

（2）根據(jù)計算的覆蓋0~1之間不同階段的雜交雙親秈-粳遺傳分化系數(shù)GDI值，確定雜交組合，并通過有性雜交獲得各組合的雜種F₁；

（3）種植F₁雜種并測量雜種F₁植株的結(jié)實率PF，通過分析雜交雙親GDI與實測雜種F₁結(jié)實率平均值的相關(guān)性，來建立利用GDI預(yù)測用于雜交的秈稻和粳稻雙親所得到雜種F₁結(jié)實率的方法；其中：

所述利用40個InDel分子標(biāo)記確定兩兩水稻品種間的秈-粳遺傳分化系數(shù)GDI的具體步驟為：

構(gòu)建包含典型秈稻、典型粳稻和秈-粳分化中間類型，且結(jié)實率大于90%的水稻品種實驗群體，并利用基因組DNA提取方法獲取實驗群體包含的全部水稻品種的DNA，用40個InDel分子標(biāo)記對上述DNA進(jìn)行PCR擴增，擴增產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠電泳或者聚丙烯酰胺凝膠電泳方法進(jìn)行分離，獲得所有水稻品種在40個InDel位點上的基因型數(shù)據(jù)；通過計算分析兩兩水稻品種在40個位點上的差異等位基因數(shù)據(jù)，獲得兩個水稻品種間的秈-粳遺傳分化系數(shù)GDI；

所述根據(jù)計算的覆蓋基0~1之間不同階段的雜交雙親秈-粳遺傳分化系數(shù)GDI值確定雜交組合，通過有性雜交獲得各組合的雜種F₁的具體步驟為：

依據(jù)步驟（1）獲得的全部實驗群體兩兩水稻品種間的GDI值，確定將要用于雜交實驗的親本對，確保所有的雜交組合其雙親GDI值覆蓋0~1之間的各個階段，即雜交雙親的秈-粳分化水平包含從最低到最高，以及中間各個過渡階段；將已確定的雜交品種進(jìn)行雜交實驗，每個雜交組合的親本都進(jìn)行正反交；對母本進(jìn)行人工去雄、套袋，然后授以父本的花粉，使每個雜交組合至少獲得100粒雜種F₁種子；

所述種植F₁雜交種并測量雜種F₁植株的結(jié)實率PF，通過分析雜交雙親GDI與實測雜種F₁植株結(jié)實率平均值的相關(guān)性來建立利用GDI預(yù)測用于雜交的秈稻和粳稻雙親所得到雜種F₁結(jié)實率的方法的具體步驟為：

對步驟（2）獲取的雜種F₁種子進(jìn)行萌發(fā)、育秧后，移栽至大田；每個雜交組合設(shè)置3個重復(fù)小區(qū)種植，所有組合F₁雜種小區(qū)的田間布置遵循完全隨機設(shè)計；雜種收獲后，測量F₁的結(jié)實率PF并計算實測F₁植株的平均結(jié)實率；利用線性回歸模型，將計算獲得的雜交雙親秈-粳遺傳分化系數(shù)GDI和實測F₁植株的平均結(jié)實率進(jìn)行分析，獲得二者的相關(guān)值，進(jìn)而形成一種利用InDel分子標(biāo)記來預(yù)測秈-粳稻雜種F₁結(jié)實率的方法。