[發明專利]西瓜雌性系基因ClWIP1與染色體易位及連鎖標記

有效

• 申請號: 201410024176.0
• 申請日: 2014-01-20
• 公開（公告）號: CN103937785A
• 公開（公告）日: 2014-07-23
• 發明（設計）人: 許勇;紀高潔;張潔;宮國義;張海英;郭紹貴;任毅
• 申請（專利權）人: 北京市農林科學院
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12N15/29;C12N15/10;C12Q1/68
• 代理公司: 北京國林貿知識產權代理有限公司 11001
• 代理人: 李桂玲;許文娟

1.與西瓜雌性系基因ClWIP1連鎖的分子標記，其特征在于：其具有序列表中SEQ?ID?NO:1-6所述的DNA序列。?

2.西瓜雌性系基因ClWIP1的DNA序列，其特征在于：其DNA序列全長具有序列表中SEQ?ID?NO:7所述的DNA序列。?

3.導致西瓜雌性系出現的染色體易位區段，其特征在于：野生型材料XHBMB的2號染色體（Chr.2）末端1065957bp（Chr.2：33348296..34414252）的DNA序列，和3號染色體（Chr.3）前端4043236bp（Chr.3:1..4043236）的DNA序列。?

4.根據權利要求3所述的導致西瓜雌性系出現的染色體易位區段，其特征在于：該染色體異位區段為：?

染色體易位后Chr.2³的易位斷點位置，即西瓜雌性系材料的Chr.2的易位斷點位置，具有序列表SEQ?ID?NO:8所述的DNA序列；?

染色體易位前Chr.2的以為斷點位置，具有序列表SEQ?ID?NO:9所述的DNA序列；?

染色體易位后Chr.3²的易位斷點位置，即西瓜雌性系材料的Chr.2的易位斷點位置，具有序列表SEQ?ID?NO:10所述的DNA序列；?

染色體易位前Chr.2的易位斷點位置，具有序列表SEQ?ID?NO:11所述的DNA序列。?

5.根據權利要求1所述的與西瓜雌性系基因ClWIP1連鎖的分子標記的獲得方法，其特征在于，包括如下步驟：?

基因定位所用供試材料選取：?

所述的基因定位所用供試材料包括：父本AKKZW，母本XHBFGM，，，以二者為親本進行雜交獲取的F₁代，該F₁代與母本XHBFGM雜交獲得BC₁代群體{（AKKZW×XHBFGM）F₁×XHBFGM}。?

基因組DNA的提取：?

將所述的AKKZW、XHBFGM、F₁代、BC₁代群體{（AKKZW×XHBFGM）F₁×XHBFGM}分別進行DNA提取處理，得到供試材料基因組DNA；?

gy基因的基因組定位：?

根據西瓜全基因組測序及重測序結果，對所述的XHBFGM、AKKZW進行全基因組序列比對，獲取AKKZW與XHBFGM間的SNP/InDel位點，設計SNP/InDel標記引物作為基因組定位的標記；?

采用集團混合分析法，利用所述的SNP/InDel標記引物在所述的AKKZW、XHBFGM、以二者為親本進行雜交獲取的F₁代、BC₁代群體{（AKKZW×XHBFGM）F₁×XHBFGM}進行基因定位，得到所述的與西瓜雌性系基因ClWIP1連鎖的分子標記。?