[發明專利]利用胃息肉和胃癌特異性甲基化檢測胃息肉和胃癌標記基因的方法

在審

• 申請號: 201380061964.0
• 申請日: 2013-09-26
• 公開（公告）號: CN104812899A
• 公開（公告）日: 2015-07-29
• 發明（設計）人: 安城皖;吳泰禎
• 申請（專利權）人: 基因特力株式會社
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 北京律誠同業知識產權代理有限公司 11006
• 代理人: 徐金國

技術領域

本發明涉及多配體聚糖-2(syndecan，SDC2；NM_002998)基因作為胃息肉和胃癌特異性的甲基化生物標記物的新用途，并且更具體地，涉及多配體聚糖-2基因作為生物標記物的用途，其使得能夠通過測量多配體聚糖-2基因的甲基化水平在早期階段診斷出胃息肉和胃癌。

背景技術

即使醫學發展到今天，癌癥患者，特別是實體瘤患者(除了血癌患者以外)的5年存活率仍小于50％，并且所有癌癥患者中約2/3在晚期被診斷出來，幾乎所有都在癌癥診斷后的2年內死亡。在癌癥治療中這樣差的結果不僅是治療方法的問題，還是由于這樣的事實，即不容易在早期診斷癌癥和準確地診斷晚期癌癥，并在癌癥治療后對癌癥患者進行隨訪。

在目前的臨床實踐中，癌癥的診斷是由后詢問病史、體檢及臨床評估后進行組織活檢，而如果懷疑是癌癥，隨后進行射線檢測和內窺鏡檢查來確認的。然而，由現有臨床實踐對癌癥的診斷只有當癌細胞的數目超過十億并且癌的直徑大于1cm時才可能。在這種情況下，癌細胞已經具有轉移能力，并且其至少一半已經轉移。同時，用于監測從癌直接或間接產生的物質的腫瘤標記物被用于癌癥篩查，但是它們由于準確性有限而引起混亂，因為其中高達約半數即使在癌癥存在時也顯示為正常，它們即使在沒有癌癥時也表現為陽性。此外，主要用于癌癥治療的抗癌劑的問題在于只有當癌體積很小時才顯示出效果。

之所以難以診斷和治療癌癥是因為癌細胞是高度復雜和可變的。癌細胞過度生長并且連續地侵入周圍組織以及轉移到遠端器官導致死亡。盡管有免疫機制或抗癌治療的攻擊，但癌細胞仍舊存活，不斷地發展并且選擇性繁殖最適宜存活的細胞群。癌細胞是具有高度生存能力的生物體，通過大量基因的突變而產生。為了使一個細胞轉變為癌細胞并發展成臨床上可檢測到的惡性癌癥腫塊，必須發生大量基因的突變。因此，為了從根本上診斷并治療癌癥，在基因水平的方法是必要的。

最近，已積極嘗試用遺傳分析來診斷癌癥。最簡單的典型方法是通過PCR檢測血液中ABL：BCR融合基因(白血病的遺傳特征)的存在。該方法具有大于95％的準確率，并且在使用這個簡易的基因分析來診斷并治療慢性髓細胞性白血病后，這一方法被用于結果評估和后續研究。但是，這種方法的缺點在于它只能適用于某些血癌。

此外，已嘗試另一種方法，其中通過RT-PCR和印跡法檢測由癌細胞表達的基因的存在，從而診斷血細胞中癌細胞的存在。但是，這種方法的缺點在于它只能適用于包括前列腺癌和黑色素瘤在內的某些癌癥，并且具有較高的假陽性率。此外，難以對該方法中的檢測和讀數標準化，并且它的效用也很有限(Kopreski,M.S.et?al.,Clin.Cancer?Res.,5:1961,1999；Miyashiro,I.et?al.,Clin.Chem.,47:505,2001)。

最近，已積極嘗試使用血清或血漿中的DNA的基因檢測。這是一種檢測從癌細胞中分離并釋放到血液中并游離DNA的形式存在于血清中的癌癥相關基因的方法。據發現，血清中的DNA濃度在實際癌癥患者中比正常人中增加5-10倍，并且這種增加的DNA大多從癌細胞釋放。使用這樣的從癌細胞中分離的DNA來分析癌癥特異性基因的異常，例如原癌基因和腫瘤抑制基因的突變、缺失和功能喪失，允許診斷癌癥。在這項工作中，出現了通過檢查血清中突變的K-ras癌基因、p53腫瘤抑制基因和p16基因中的啟動子甲基化，以及微衛星的標記和不穩定性來診斷肺癌、頭頸癌、乳腺癌、結腸癌和肝癌的積極嘗試(Chen,X.Q.et?al.,Clin.Cancer?Res.,5:2297,1999；Esteller,M.et?al.,Cancer?Res.,59:67,1999；Sanchez-Cespedes,M.et?al.,Cancer?Res.,60:892,2000；Sozzi,G.et?al.,Clin.Cancer?Res.,5:2689,1999)。