[發明專利]發現治療靶標的方法

在審

• 申請號: 201380057737.0
• 申請日: 2013-09-05
• 公開（公告）號: CN104769168A
• 公開（公告）日: 2015-07-08
• 發明（設計）人: 斯蒂芬·阿爾伯特·約翰斯頓;約瑟夫·巴瑞特·勒古特克;姆斯坎·庫克賈
• 申請（專利權）人: 亞利桑那州評議委員會;亞利桑那州法人團體;代理和代表亞利桑那州立大學
• 主分類號: C40B30/04
• 分類號: C40B30/04
• 代理公司: 北京安信方達知識產權代理有限公司 11262
• 代理人: 鄭霞

1.一種篩選治療靶標的方法，所述方法包括：

a.使肽陣列與來自具有感興趣的已知狀況的個體的第一生物樣品接觸；

b.檢測所述第一生物樣品中的抗體與所述肽陣列的結合以獲得第一免疫特征譜；

c.使肽陣列與來源于沒有已知狀況的個體的對照樣品接觸；

d.檢測所述對照樣品中的抗體與所述肽陣列的結合以獲得第二免疫特征譜；

e.將所述第一免疫特征譜與所述第二免疫特征譜進行比較，并鑒定與所述第二免疫特征譜相比在所述第一免疫特征譜中結合更少或更多抗體的差異結合的肽；以及

f.將與所鑒定的差異結合的肽相對應的蛋白質鑒定為針對所述感興趣的狀況的治療靶標。

2.如權利要求1所述的方法，其中所述蛋白質未經注釋。

3.如權利要求1所述的方法，其中所述蛋白質具有移碼。

4.如權利要求1所述的方法，其中所述治療靶標為所述蛋白質的表位。

5.如權利要求1所述的方法，其中所述肽陣列包含至少10,000個不同的肽。

6.如權利要求1所述的方法，其中所述肽陣列包含至少100,000個不同的肽。

7.如權利要求1所述的方法，其中所述肽陣列包含至少330,000個不同的肽。

8.如權利要求1所述的方法，其中所述肽陣列包含至少500,000個不同的肽。

9.如權利要求5-8中任一項所述的方法，其中所述肽陣列上的不同的肽為8至35個殘基的長度。

10.如權利要求5-9中任一項所述的方法，其中所述肽陣列上的不同的肽具有范圍為2-4nm的平均間距。

11.如權利要求5-10中任一項所述的方法，其中所述肽陣列上的不同的肽具有范圍為3-6nm的平均間距。

12.如權利要求5-11中任一項所述的方法，其中所述不同的肽包含肽模擬物。

13.如權利要求5-12中任一項所述的方法，其中所述不同的肽具有隨機氨基酸序列。

14.如權利要求5-13中任一項所述的方法，其中所述不同的肽包含非天然氨基酸。

15.如權利要求1-14中任一項所述的方法，其進一步包括開發針對所述治療靶標的疫苗。

16.一種鑒定疫苗靶標的方法，所述方法包括：

a.使肽陣列與來自具有感興趣的已知狀況的個體的第一生物樣品接觸；

b.檢測所述第一生物樣品中的抗體與所述肽陣列的結合以獲得第一免疫特征譜；

c.使肽陣列與來源于沒有已知狀況的個體的對照樣品接觸；

d.檢測所述對照樣品中的抗體與所述肽陣列的結合以獲得第二免疫特征譜；

e.將所述第一免疫特征譜與所述第二免疫特征譜進行比較，并鑒定與所述第二免疫特征譜相比在所述第一免疫特征譜中結合更少或更多抗體的差異結合的肽；以及

f.將與所鑒定的差異結合的肽相對應的蛋白質鑒定為針對所述感興趣的狀況的疫苗靶標。

17.如權利要求16所述的方法，其中所述蛋白質未經注釋。

18.如權利要求16所述的方法，其中所述蛋白質具有移碼。

19.如權利要求16所述的方法，其中所述治療靶標為所述蛋白質的表位。

20.如權利要求16所述的方法，其中所述肽陣列包含至少10,000個不同的肽。

21.如權利要求16所述的方法，其中所述肽陣列包含至少100,000個不同的肽。

22.如權利要求16所述的方法，其中所述肽陣列包含至少330,000個不同的肽。

23.如權利要求16所述的方法，其中所述肽陣列包含至少500,000個不同的肽。

24.如權利要求20-23中任一項所述的方法，其中所述肽陣列上的不同的肽為8至35個殘基的長度。

25.如權利要求20-24中任一項所述的方法，其中所述肽陣列上的不同的肽具有范圍為2-4nm的平均間距。