[發(fā)明專(zhuān)利]用于在不使用前體離子信息的情況下從MS/MS數(shù)據(jù)識(shí)別化合物的系統(tǒng)及方法

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201380052630.7
• 申請(qǐng)日: 2013-10-16
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN104718449A
• 公開(kāi)（公告）日: 2015-06-17
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 斯蒂芬·A·泰特;羅納德·F·邦納
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: DH科技發(fā)展私人貿(mào)易有限公司
• 主分類(lèi)號(hào): G01N27/62
• 分類(lèi)號(hào): G01N27/62;H01J49/26
• 代理公司: 北京律盟知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 11287
• 代理人: 曹曉斐

1.一種用于在不使用任何先驗(yàn)前體離子信息的情況下從串聯(lián)質(zhì)譜產(chǎn)物離子識(shí)別化合物的系統(tǒng)，其包括：

串聯(lián)質(zhì)譜儀，其分析樣本，從而從前體質(zhì)荷比范圍產(chǎn)生至少一個(gè)經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子光譜；及

處理器，其與所述串聯(lián)質(zhì)譜儀通信，所述處理器

(a)從所述串聯(lián)質(zhì)譜儀接收所述至少一個(gè)經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子光譜，

(b)從所述至少一個(gè)經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子光譜選擇經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子的子集，

(c)通過(guò)使用經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子的所述子集搜索潛在化合物的詞典來(lái)創(chuàng)建候選化合物的列表，所述列表包含所述候選化合物中的每一者的分?jǐn)?shù)，所述詞典包含所述潛在化合物中的每一者的一或多個(gè)所預(yù)測(cè)產(chǎn)物離子，及

(d)從所述列表選擇候選化合物作為所述經(jīng)識(shí)別化合物。

2.根據(jù)前述系統(tǒng)權(quán)利要求的任何組合所述的系統(tǒng)，其中所述經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子光譜包括肽碎片，潛在化合物的所述詞典包括蛋白質(zhì)的所預(yù)測(cè)肽，所述潛在化合物中的每一者的所述一或多個(gè)所預(yù)測(cè)產(chǎn)物離子包括肽的一或多個(gè)碎片，候選化合物的所述列表包括候選肽且所述經(jīng)識(shí)別化合物包括經(jīng)識(shí)別肽。

3.根據(jù)前述系統(tǒng)權(quán)利要求的任何組合所述的系統(tǒng)，其中所述潛在化合物包括糖、脂質(zhì)、DNA、RNA或可針對(duì)其預(yù)測(cè)產(chǎn)物離子的任何化合物。

4.根據(jù)前述系統(tǒng)權(quán)利要求的任何組合所述的系統(tǒng)，其中所述處理器通過(guò)從所述至少一個(gè)經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子光譜選擇具有最高強(qiáng)度的某個(gè)數(shù)目的經(jīng)測(cè)量單一同位素產(chǎn)物離子來(lái)選擇經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子的所述子集。

5.根據(jù)前述系統(tǒng)權(quán)利要求的任何組合所述的系統(tǒng)，其中所述處理器通過(guò)選擇預(yù)測(cè)出現(xiàn)在最小數(shù)目的潛在化合物中的經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子來(lái)選擇經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子的所述子集。

6.根據(jù)前述系統(tǒng)權(quán)利要求的任何組合所述的系統(tǒng)，其中所述處理器通過(guò)從所述至少一個(gè)經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子光譜選擇具有大于閾值的質(zhì)荷比(m/z)的某個(gè)數(shù)目的經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子來(lái)選擇經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子的所述子集。

7.根據(jù)前述系統(tǒng)權(quán)利要求的任何組合所述的系統(tǒng)，其中所述處理器通過(guò)以下操作創(chuàng)建候選化合物的所述列表

從經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子的子集選擇第一產(chǎn)物離子，

搜索潛在化合物的所述詞典以找到包含與所述第一產(chǎn)物離子匹配的所預(yù)測(cè)產(chǎn)物離子的潛在化合物，從而產(chǎn)生多個(gè)匹配潛在化合物，

將所述匹配潛在化合物添加到候選化合物的所述列表且向所述列表上的每一候選化合物提供初始分?jǐn)?shù)，

對(duì)于來(lái)自經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子的所述子集的每一剩余經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子，比較所述每一剩余經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子與所述列表上的每一候選化合物的所預(yù)測(cè)產(chǎn)物離子且在所包含的所預(yù)測(cè)產(chǎn)物離子與所述每一剩余經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子匹配的情況下增大所述每一候選化合物的所述分?jǐn)?shù)。

8.根據(jù)前述系統(tǒng)權(quán)利要求的任何組合所述的系統(tǒng)，其中所述處理器通過(guò)以下操作創(chuàng)建候選化合物的所述列表

對(duì)于來(lái)自經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子的所述子集的每一經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子，搜索潛在化合物的所述詞典以找到包含與所述每一經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子匹配的所預(yù)測(cè)產(chǎn)物離子的潛在化合物，

如果潛在化合物包含與所述每一經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子匹配的所預(yù)測(cè)產(chǎn)物離子，那么在所述匹配潛在化合物未存在于所述列表上的情況下以初始分?jǐn)?shù)將所述匹配潛在化合物添加到候選化合物的所述列表，或在所述匹配潛在化合物已存在于所述列表上的情況下增大所述匹配潛在化合物的所述分?jǐn)?shù)。

9.根據(jù)前述系統(tǒng)權(quán)利要求的任何組合所述的系統(tǒng)，其中所述串聯(lián)質(zhì)譜儀通過(guò)以下操作分析樣本

將質(zhì)量范圍分成兩個(gè)或兩個(gè)以上前體質(zhì)量窗，及

將所述兩個(gè)或兩個(gè)以上質(zhì)量窗的每一前體質(zhì)量窗碎片化，從而產(chǎn)生每一前體質(zhì)量窗的經(jīng)測(cè)量產(chǎn)物離子光譜。

10.根據(jù)前述系統(tǒng)權(quán)利要求的任何組合所述的系統(tǒng)，其中所述處理器進(jìn)一步

比較所述經(jīng)識(shí)別化合物與所述范圍，及

在未在所述前體質(zhì)荷比范圍中發(fā)現(xiàn)所述經(jīng)識(shí)別化合物質(zhì)荷比(m/z)的情況下，確定所述經(jīng)識(shí)別化合物為經(jīng)改性形式。

11.根據(jù)前述系統(tǒng)權(quán)利要求的任何組合所述的系統(tǒng)，其中所述處理器進(jìn)一步

分析改性列表，以確定將所述經(jīng)改性的經(jīng)識(shí)別化合物的所述質(zhì)荷比置于所述范圍中的改性。