[發明專利]批準預測裝置、批準預測方法及計算機可讀記錄介質

有效

• 申請號: 201380050955.1
• 申請日: 2013-09-27
• 公開（公告）號: CN104781458B
• 公開（公告）日: 2017-09-22
• 發明（設計）人: 蒂亞哥·喬斯·達席爾瓦洛佩斯;北野宏明;河岡義裕
• 申請（專利權）人: 獨立行政法人科學技術振興機構
• 主分類號: C40B30/02
• 分類號: C40B30/02;G06F17/18;G06F17/30;G06F19/16
• 代理公司: 中科專利商標代理有限責任公司11021
• 代理人: 張莉

1.一種批準預測裝置，至少具備輸出部、存儲部和控制部，上述批準預測裝置的特征在于，

上述存儲部具備：

蛋白質排列信息存儲單元，其存儲與蛋白質的氨基酸排列相關的排列信息；

相似性網絡信息存儲單元，其存儲與基于蛋白質彼此的相似性而構成的蛋白質相似性網絡相關的相似性網絡信息；

藥劑靶標存儲單元，其將包含與藥劑的批準或不批準相關的批準屬性的藥劑信息、和與成為該藥劑的靶標的上述蛋白質相關的蛋白質信息建立對應并存儲；和

相互作用網絡信息存儲單元，其存儲與基于上述蛋白質間的相互作用而構成的蛋白質間相互作用網絡相關的相互作用網絡信息，

上述控制部具備：

相似性網絡信息保存單元，其在基于存儲在上述蛋白質排列信息存儲單元中的上述排列信息，使用基于簽名算法相互檢測到上述蛋白質彼此的上述相似性的情況下，建立由相互檢測到上述相似性的上述蛋白質彼此構成的上述蛋白質相似性網絡，將與該蛋白質相似性網絡相關的上述相似性網絡信息保存在上述相似性網絡信息存儲單元；

相似性中心性尺度計算單元，其基于存儲在上述相似性網絡信息存儲單元中的上述相似性網絡信息，計算構成上述蛋白質相似性網絡的上述蛋白質的包含度中心性、介數中心性、距離的中心性、以及Burt的約束值在內的中心性尺度即相似性中心性尺度；

相互作用中心性尺度計算單元，其基于存儲在上述相互作用網絡信息存儲單元中的上述相互作用網絡信息，計算構成上述蛋白質間相互作用網絡的上述蛋白質的包含上述度中心性、上述介數中心性、上述距離的中心性、以及上述Burt的約束值的中心性尺度即相互作用中心性尺度；

否決得分計算單元，其使用將存儲在上述藥劑靶標存儲單元中的各藥劑的上述批準屬性、由上述相似性中心性尺度計算單元計算出的上述相似性中心性尺度的上述各藥劑的每個上述靶標的合計值以及平均值、和由上述相互作用中心性尺度計算單元計算出的上述相互作用中心性尺度的上述各藥劑的每個上述靶標的合計值以及平均值作為訓練數據的分類器，來計算將驗證對象的化合物分類為上述不批準的上述藥劑的概率即否決得分；和

否決得分輸出單元，其經由上述輸出部使由上述否決得分計算單元計算出的上述否決得分輸出。

2.一種批準預測裝置，至少具備輸出部、存儲部和控制部，上述批準預測裝置的特征在于，

上述存儲部具備：

蛋白質排列信息存儲單元，其存儲與蛋白質的氨基酸排列相關的排列信息；

相似性網絡信息存儲單元，其存儲與由具有相似性的蛋白質彼此構成的蛋白質相似性網絡相關的相似性網絡信息；和

藥劑靶標存儲單元，其將包含與藥劑的批準或不批準相關的批準屬性的藥劑信息、和與成為該藥劑的靶標的上述蛋白質相關的蛋白質信息建立對應并存儲，

上述控制部具備：

相似性網絡信息保存單元，其在基于存儲在上述蛋白質排列信息存儲單元中的上述排列信息，使用基于簽名算法相互檢測到上述蛋白質彼此的上述相似性的情況下，建立由相互檢測到上述相似性的上述蛋白質彼此構成的上述蛋白質相似性網絡，將與該蛋白質相似性網絡相關的上述相似性網絡信息保存在上述相似性網絡信息存儲單元；

相似性中心性尺度計算單元，其基于存儲在上述相似性網絡信息存儲單元中的上述相似性網絡信息，計算構成上述蛋白質相似性網絡的上述蛋白質的包含度中心性、介數中心性、距離的中心性、以及Burt的約束值在內的中心性尺度即相似性中心性尺度；

批準判定單元，其使用由上述相似性中心性尺度計算單元計算出的構成該蛋白質相似性網絡的驗證對象的蛋白質的上述相似性中心性尺度來取得以下判定結果，所述判定結果是根據將構成上述蛋白質相似性網絡的與存儲在上述藥劑靶標存儲單元中的上述蛋白質信息相應的上述蛋白質作為上述靶標的上述藥劑的上述批準屬性，來判定該驗證對象的上述蛋白質是否包含在上述批準的上述藥劑或上述不批準的上述藥劑的上述靶標的范圍內的判定結果；和

判定結果輸出單元，其經由上述輸出部使由上述批準判定單元取得的上述判定結果輸出。