[發(fā)明專(zhuān)利]用于急性髓細(xì)胞白血病的診斷、預(yù)后和治療的方法和組合物

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• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201380024896.0
• 申請(qǐng)日: 2013-03-11
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN104508143A
• 公開(kāi)（公告）日: 2015-04-08
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 羅斯·L·萊文;奧馬爾·阿卜杜勒-瓦希卜;杰伊·P·帕特爾;米特哈特·戈嫩
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 紀(jì)念斯隆-凱特琳癌癥中心
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/68
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/68
• 代理公司: 北京天昊聯(lián)合知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司11112
• 代理人: 丁業(yè)平;高釗

1.一種預(yù)測(cè)患有急性髓細(xì)胞白血病的患者的生存率的方法，所述方法包括：

(a)分析從所述患者分離的遺傳樣品是否存在細(xì)胞遺傳學(xué)異常，以及在基因FLT3、NPM1、DNMT3A、NRAS、CEBPA、TET2、WT1、IDH1、IDH2、KIT、RUNX1、MLL-PTD、ASXL1、PHF6、KRAS、PTEN、P53、HRAS和EZH2的至少一者中是否存在突變；以及

(b)(i)如果在基因FLT3、MLL-PTD、ASXL1和PHF6中的至少一者中存在突變，則預(yù)測(cè)所述患者的生存率差，或者(ii)如果在IDH2R140中存在突變和/或在CEBPA中存在突變，則預(yù)測(cè)所述患者的生存率良好。

2.權(quán)利要求1所述的方法，還包括：

如果存在以下情況，則預(yù)測(cè)患有由細(xì)胞遺傳學(xué)限定的中度風(fēng)險(xiǎn)AML的患者的生存率為中度：

(i)在基因FLT3-ITD、TET2、MLL-PTD、DNMT3A、ASXL1或PHF6的任意一者中都不存在突變；

(ii)在CEBPA和FLT3-ITD中存在突變，或

(iii)在FLT3-ITD中存在突變但是不存在8號(hào)染色體三體。

3.權(quán)利要求1所述的方法，還包括：

如果存在以下情況，則預(yù)測(cè)所述患有由細(xì)胞遺傳學(xué)限定的中度風(fēng)險(xiǎn)AML的患者的生存率不良：

(i)在不具有FLT3-ITD突變的患者中，在TET2、ASXL1或PHF6或MLL-PTD中存在突變，或

(ii)所述患者具有FLT3-ITD突變、以及TET2、DNMT3A、MLL-PTD中的突變、或8號(hào)染色體三體。

4.權(quán)利要求2所述的方法，其中生存率中度的所述患者能夠生存大約18個(gè)月到大約30個(gè)月。

5.一種預(yù)測(cè)患有急性髓細(xì)胞白血病的患者生存率的方法，所述方法包括：

(a)檢驗(yàn)來(lái)自所述患者的血液或骨髓的遺傳樣品在所述樣品中的基因FLT3、NPM1、DNMT3A、NRAS、CEBPA、TET2、WT1、IDH1、IDH2、KIT、RUNX1、MLL-PTD、ASXL1、PHF6、KRAS、PTEN、P53、HRAS和EZH2的至少一者中是否存在突變；以及

(b)如果在基因FLT3-ITD、MLL-PTD、ASXL1、PHF6的至少一者中存在突變，則預(yù)測(cè)所述患者的生存率差，或者如果在CEBPA中存在突變和/或在IDH2的R140位存在突變，則預(yù)測(cè)所述患者的生存率良好。

6.權(quán)利要求5所述的方法，其中在患有由細(xì)胞遺傳學(xué)限定的中度風(fēng)險(xiǎn)急性髓細(xì)胞白血病且具有FLT3-ITD突變的患者之中，以下至少一者與所述患者的不良預(yù)后以及總生存率差有關(guān)：8號(hào)染色體三體、或在TET2、DNMT3A或MLL-PTD中具有突變。

7.權(quán)利要求5所述的方法，其中在患有由細(xì)胞遺傳學(xué)限定的中度風(fēng)險(xiǎn)急性髓細(xì)胞白血病且在FLT3-ITD基因中具有突變的患者之中，CEBPA基因的突變與所述患者的改善的預(yù)后和總生存率有關(guān)。

8.權(quán)利要求5所述的方法，其中在同時(shí)具有IDH1/IDH2和NPM1突變的由細(xì)胞遺傳學(xué)限定的中度風(fēng)險(xiǎn)AML患者中，與IDH1和IDH2均為野生型的NPM1-突變的患者相比，總生存率提高。

9.權(quán)利要求5所述的方法，其中在患有急性髓細(xì)胞白血病的患者之中，IDH2R140突變與總生存率提高相關(guān)。

10.權(quán)利要求1至9中任意一項(xiàng)所述的方法，其中生存率差或不良的所述患者(不良風(fēng)險(xiǎn))能存活小于或等于約10個(gè)月。

11.權(quán)利要求1至9中任意一項(xiàng)所述的方法，其中生存率良好的所述患者能存活大約32個(gè)月或更長(zhǎng)時(shí)間。

12.一種預(yù)測(cè)患有急性髓細(xì)胞白血病的患者的生存率的方法，所述方法包括：

(a)檢驗(yàn)來(lái)自所述患者的血液或骨髓的遺傳樣品在基因ASXL1和WT1中是否存在突變；以及

(b)如果檢測(cè)到突變的ASXL1和WT1基因，則確定所述患者患有或?qū)⒒加性l(fā)性難治性急性髓細(xì)胞白血病。