[發明專利]用于臨床決策支持的途徑可視化

在審

• 申請號: 201380018494.X
• 申請日: 2013-03-27
• 公開（公告）號: CN104246783A
• 公開（公告）日: 2014-12-24
• 發明（設計）人: N·迪米特羅娃;A·亞內夫斯基;N·班納吉;V·瓦拉達恩;S·卡瑪拉卡蘭
• 申請（專利權）人: 皇家飛利浦有限公司
• 主分類號: G06F19/26
• 分類號: G06F19/26;G06F19/12
• 代理公司: 永新專利商標代理有限公司 72002
• 代理人: 王英;劉炳勝

1.一種使用定義與基因表達、基因活性水平和信息流相關聯的視覺元素的視覺語法(230)來幫助將基因活性途徑可視化以用于臨床決策支持的系統(10)，包括：

驗證途徑數據庫，其存儲多個驗證途徑，所述多個驗證途徑中的每個使用所述視覺語法來描述多個基因之間的至少一個交互作用；以及

處理器(18)，其被配置為執行存儲在存儲器(16)中的計算機可執行指令，所述指令包括：

視覺表示跨多個群體的至少一個基因的基因活性水平(28)；

從所述驗證途徑數據庫(30)檢索途徑(32)，其中，所述途徑包括所述至少一個基因；

視覺表示所述途徑中的所有基因的基因活性水平(34)；

通過所述途徑中的基因之間的交互作用來視覺表示信息流(36)；

將所述信息流(36)的所述視覺表示鏈接到針對臨床醫生的可行動信息(42)；

向所述臨床醫生輸出所述信息流的所述視覺表示和被鏈接的可行動信息。

2.如權利要求1所述的系統，其中，所述多個群體包括正常群體、腫瘤群體和當前患者。

3.如前述權利要求中的任一項所述的系統，所述指令還包括：

對跨所述多個群體的所述至少一個基因的基因活性水平進行顏色編碼，使得由不同的顏色來表示各個群體。

4.如前述權利要求中的任一項所述的系統，所述指令還包括：

對跨所述多個群體的所述至少一個基因的基因活性水平進行紋理編碼，使得由不同的紋理來表示各個群體。

5.如前述權利要求中的任一項所述的系統，所述指令還包括：

視覺表示溫度圖形，所述溫度圖形根據正常群體的平均基因活性水平和腫瘤群體平均基因活性水平來示出患者中的所述至少一個基因的基因活性水平。

6.如前述權利要求中的任一項所述的系統，所述指令還包括：

使用包括閃光和移動中的至少一個的時間方面來視覺表示基因活性，其中，閃光和移動中的所述至少一個的頻率與所述基因活性水平成比例。

7.如前述權利要求中的任一項所述的系統，其中，所述可行動信息包括用于處置所述患者的至少一個治療規劃。

8.如前述權利要求中的任一項所述的系統，其中，所述基因活性水平包括以下中的一個或多個的活性水平：

所述基因內的突變的數量；

所述基因的復制的數量；

基因表達水平；

所述基因的蛋白質表達水平；

基因座的DNA甲基化水平；

基因座的組織蛋白甲基化水平；

基因座的組織蛋白乙酰化水平；以及

由所述基因編碼的特定蛋白質的磷酸化。

9.如前述權利要求中的任一項所述的系統，所述指令還包括：

使用色相-飽和度-亮度(HSB)空間中的視覺顏色來視覺表示基因活性水平，其中，不同的基因活性水平被分配有不同的視覺顏色，并且其中，使用連續函數來生成所述視覺表示。

10.如權利要求9所述的系統，其中，定義所述連續函數使得給定的基因具有r＝[a,b]的值的范圍，其中，值被分配在所述HSB空間中，并且對于每個點r_i∈[a,b]，選擇函數以按照h_i＝f(r_i)來映射所述值。

11.如前述權利要求中的任一項所述的系統，其中，應用到當前患者的治療方案中的至少一種藥物在所述患者中具有抗血管生成作用，并且其中，所述可視化途徑與血管生長相關。

12.如前述權利要求中的任一項所述的系統，其中，所述信息流根據所述途徑中過表達、抑制和基準表達基因中的一個或多個的可能性來描述在所述途徑中捕捉到的基因之間的交互作用，并且其中，所述指令還包括確定所述途徑中的所述交互作用中的一個或多個是否已經被激活。

13.如權利要求12所述的系統，所述指令還包括生成省略了節點表示并且強調了整個所述途徑(222)上的所述信息流的視覺表示(220)。