[發(fā)明專利]一種預(yù)測強直性脊柱炎易感性的方法和試劑盒

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201310713079.8
• 申請日: 2013-12-20
• 公開（公告）號: CN103710448A
• 公開（公告）日: 2014-04-09
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 楊澤;朱小泉;楊帆;孫亮;史曉紅;唐雷;原慧萍;張玉榮;趙承孝;趙帆;王娜娜;惠娟;張政
• 申請（專利權(quán)）人: 衛(wèi)生部北京醫(yī)院
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京正理專利代理有限公司 11257
• 代理人: 李欣

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及一種預(yù)測強直性脊柱炎易感性的方法和試劑盒，更具體的說是通過測定與AS相關(guān)基因TNXB的多態(tài)性預(yù)測受試者對于強直性脊柱炎的易感性，該方法可用于疾病的輔助診斷、治療和新藥開發(fā)，屬于生物技術(shù)領(lǐng)域。

背景技術(shù)

強直性脊柱炎（Ankylosing?spondylitis，AS）是一種自身免疫性疾病，多發(fā)于16-40歲的青壯年，男女患病比例約為4～10:1。病變常首先發(fā)生于骶髂關(guān)節(jié)，少數(shù)重癥患者表現(xiàn)為整個脊柱強直。此外，部分患者伴有不同程度的髖關(guān)節(jié)、眼、肺、心血管、腎等脊柱外病變。AS在白種人群中的發(fā)病率約為1%～3%，我國AS患病率約為0.2-0.6%，其中60%以上的患者伴有髖關(guān)節(jié)受累，致使20%以上AS患者殘疾，炎癥主要累及關(guān)節(jié)囊、肌腱和韌帶的骨附著點，導(dǎo)致局部關(guān)節(jié)粘連強直，活動受限。臨床上至今尚缺乏可明顯緩解和控制疾病發(fā)展的藥物。AS屬多基因疾病，具有明顯的遺傳傾向，雖然通常認為遺傳與免疫因素在AS發(fā)病中起主導(dǎo)作用，但確切的病因與發(fā)病機制仍不清楚。

目前進行AS遺傳病因研究，多采用SNP作為基因組標(biāo)志的關(guān)聯(lián)分析方法，是有效的，已得到證明。SNP是指染色體基因組水平上單個核苷酸變異引起的DNA序列多態(tài)性，在人群中的頻率需>1%，SNPs是雙等位基因標(biāo)記，這種單堿基變化中有70.1%為同型堿基之間的轉(zhuǎn)換：如G/A或T/C，29.1%為發(fā)生在嘌呤和嘧啶之間的顛換。C（胞嘧啶）是人類基因組中最易發(fā)生變化的位點，因為大多數(shù)是甲基化胞嘧啶，能夠自發(fā)脫氨基轉(zhuǎn)換為T（胸腺嘧啶），SNP包含了已知多態(tài)性的80-90%，是最常見的遺傳變異。

由于生存的選擇壓力導(dǎo)致SNP在單一基因和整個基因組中的分布呈不均勻性。SNPs在基因非編碼區(qū)的數(shù)量是編碼區(qū)的4倍，總數(shù)可達3百萬個。SNP以其密度高（平均每1kb就有1個）、代表性強（位于基因內(nèi)部的SNP可能直接影響蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或表達水平）、遺傳穩(wěn)定性好（同微衛(wèi)星多態(tài)性比較而言）、易于自動化分析（因SNP在人群中多為雙等位基因標(biāo)記，可簡單以“＋/－或1/0”直接分型）等特點成為很好的遺傳標(biāo)志。

1973年，Brewerton等首先發(fā)現(xiàn)了與AS強相關(guān)的人類白細胞抗原-B27（HLA-B27）。隨著研究的進展，與AS相關(guān)的其他易感基因如腫瘤壞死因子-α（TNF-α）、白介素-1（IL-1）陸續(xù)被識別。

TNXB（Tenascin?XB，肌健蛋白XB）基因位于6q21.3，全長57053bp，含有42個外顯子，其編碼產(chǎn)物是一種蛋白質(zhì)，該基因定位于人類白細胞抗原III區(qū)域，與免疫反應(yīng)及自身性免疫疾病發(fā)生發(fā)展等密切相關(guān)。

目前尚無任何關(guān)于TNXB基因與AS相關(guān)聯(lián)的研究結(jié)果。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的主要目的是提供一種預(yù)測強直性脊柱炎易感性的方法。

本發(fā)明的第二個目的是提供一種預(yù)測強直性脊柱炎易感性的試劑盒，包括PCR引物和含有該引物的試劑盒。

為實現(xiàn)上述目的，本發(fā)明采用以下技術(shù)方案：

檢測強直性脊柱炎易感性的核酸序列，為序列表SEQ?ID?No.1所示堿基序列。其+316位即是rs141190850變異位點，以字母“R”標(biāo)示出。該核酸序列為TNXB基因全長序列。圖1為TNXB基因結(jié)構(gòu)及其多態(tài)性變異位點的示意圖，附圖中包含有5個外顯子，rs141190850位點標(biāo)在TNXB基因圖中第3外顯子區(qū)的相應(yīng)位置。

一種檢測強制性脊柱炎易感性的方法，檢測受試者TNXB基因第3外顯子區(qū)rs141190850位點的基因型，基因型為AA時，受試者的易感性最低；攜帶G等位基因時，受試者的易感性升高。

一組檢測強直性脊柱炎易感性的引物，引物的核苷酸序列分別為序列表SEQ?ID?No.2和序列表SEQ?ID?No.3所示。可以特異性地擴增出包含有SEQ?ID?No.1所示序列中+316位置（rs141190850）的產(chǎn)物。

本發(fā)明提供了一種檢測強直性脊柱炎易感性的診斷試劑盒，其中含有本發(fā)明特異性擴增TNXB基因rs141190850的引物對和用于PCR擴增檢測的試劑盒的常規(guī)組件、試劑、緩沖液等，本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知這些常規(guī)組件和檢測方法。本發(fā)明試劑盒中的全部組分、含量如下：

一種檢測強直性脊柱炎易感基因的試劑盒，由以下試劑組成：

（1）10μL10×PCR緩沖液；

（2）2μL10mMdNTP混合液；

（3）2μL?TaqDNA聚合酶，2unit/μL；